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研究人员开发空间转录组生物组织亚结构解析新工具
空间转录组 生物组织 亚结构解析 新工具
2023/1/5
近年来，空间转录组学（Spatial Transcriptomics，简称ST）的突破性进展使得研究人员在全基因组层面测量组织切片中特定空间位点的基因表达信息成为可能，这为研究人员破译组织的空间结构，理解复杂的生物学功能提供了条件。组织切片中具有相似基因表达空间模式的区域形成组织中特异的亚结构（简称为空间域）。精确破译空间域是空间转录组数据解析中最基本和关键的环节。然而，适用于单细胞异质性识别的经...
《Science》期刊以长文形式发表了题为《序列工作记忆在猕猴前额叶表征的几何结构》的研究论文。该研究由中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心（神经科学研究所）、中国科学院灵长类神经生物学重点实验室王立平研究组、上海脑科学与类脑研究中心闵斌副研究员和北京大学生命科学学院唐世明课题组合作完成。在该研究中，科学家训练猕猴记忆由多个空间位置组成的序列，并利用在体双光子钙成像技术记录猕猴大脑前额叶皮层的神...
Journal of the American Chemical Society:揭示卟啉类化合物破坏猪伪狂犬病毒G-四链体结构的新机制（图）
卟啉类化合物；猪伪狂犬病毒；核酸结构
2022/1/26
近日，国际学术期刊Journal of the American Chemical Society在线发表了华中农业大学动物科学技术学院、动物医学院位灯国教授团队和英国伦敦大学学院（UCL）药学院Shozeb Haider教授合作研究成果，题为“Mechanistic Insights into the Ligand-Induced Unfolding of an RNA G-Quadruplex...
中枢神经系统的损伤修复与功能重建一直是神经科学与再生医学领域的研究热点与难点。当前，基于生物材料的再生修复策略受到越来越广泛的关注和共识。生物材料通过递送结构、力学、生物化学等细胞调控信号，激活组织再生潜能。此前，王秀梅团队提出了多模态组织工程新策略，通过自主开发的多级定向纳米纤维蛋白水凝胶（aligned fibrinnanofiber hydrogel，AFG）对脊髓与外周神经损伤进行干预，并...
科技日报高分辨率艾滋病病毒衣壳结构图确定（图）
高分辨率；艾滋病病毒；衣壳结构图
2021/11/26
科技日报北京2021年11月22日电 （实习记者张佳欣）英国电子生物成像中心（eBIC）使用电子断层扫描和亚像素断层图平均化的新技术，确定了艾滋病病毒（HIV）衣壳蛋白、以及其与宿主细胞因子相互作用的复合结构图像，分辨率约5.4埃。研究人员还建立了整个HIV衣壳蛋白的原子模型，或为开发以衣壳蛋白为靶向的抗HIV药物提供新思路。研究论文19日发表在《科学进展》杂志上。
2021年9月21日，北京大学生命科学学院和北京大学生态研究中心姚蒙和李晟课题组在Current Biology上以研究长文（Article）发表题为“Prey partitioning and livestock consumption in the world’s richest large carnivore assemblage”的论文。该论文围绕全球生物多样性热点区“中国西南山地”，通过...
北京大学生态研究中心Current Biology 姚蒙、李晟课题组报道基于DNA宏条形码解析我国西南山地多种食肉动物复杂食物网结构和物种共存机制（图）
北京大学生态研究中心 Current Biology 姚蒙 李晟 DNA宏条形码 西南山地 食肉动物 食物网
2021/9/24
2021年9月21日，北京大学生态研究中心和北京大学生命科学学院姚蒙和李晟课题组在Current Biology上以研究长文（Article）发表题为“Prey partitioning and livestock consumption in the world’s richest large carnivore assemblage”的论文。该论文围绕全球生物多样性热点区“中国西南山地”，通过...
中国科学院动物研究所杨运桂/张强锋/刘峰团队合作揭示早期胚胎发育中RNA二级结构动态性及其调控母源mRNA稳定性的机制（图）
中国科学院动物研究所 杨运桂 张强锋 刘峰 早期胚胎发育 RNA 二级结构动态性 调控母源mRNA 稳定性
2020/8/24
动物早期胚胎发育由存储在卵子中的母源因子（母源mRNA及母源蛋白）主导调控，在母源-合子转换（maternal-to-zygotic transition, MZT）期间，母源mRNA发生有序的降解，合子基因表达开始激活，逐步完成从母源主导到合子基因主导的过渡 (1, 2)。杨运桂/刘峰/麻锦彪研究组的早期合作研究揭示RNA m5C修饰通过其结合蛋白Ybx1招募Pabpc1a来维持一部分重要母源m...
中国科学院动物研究所杨运桂/张强锋/刘峰团队合作揭示早期胚胎发育中RNA二级结构动态性及其调控母源mRNA稳定性的机制（图）
中国科学院动物研究所 杨运桂 张强锋 刘峰 早期胚胎发育 RNA 二级结构动态性 母源mRNA 稳定性
2020/8/10
动物早期胚胎发育由存储在卵子中的母源因子（母源mRNA及母源蛋白）主导调控，在母源-合子转换（maternal-to-zygotic transition, MZT）期间，母源mRNA发生有序的降解，合子基因表达开始激活，逐步完成从母源主导到合子基因主导的过渡 (1, 2)。杨运桂/刘峰/麻锦彪研究组的早期合作研究揭示RNA m5C修饰通过其结合蛋白Ybx1招募Pabpc1a来维持一部分重要母源m...
芬兰研究人员绘制出北欧驯鹿的完整基因结构
芬兰 研究人员 北欧驯鹿 完整基因结构
2020/6/8
芬兰研究人员2020年6月5日对媒体宣布，他们已绘制出北欧驯鹿的完整基因结构，发现了许多有助于它们适应恶劣自然条件的遗传特征。芬兰北部的拉普兰地区是北欧驯鹿的主要栖息地。在广泛流行的传说中，来自拉普兰的圣诞老人会在圣诞节期间驾着北欧驯鹿拉的雪橇出行。
近日，国际学术期刊Nucleic Acids Research 在线发表了华中农业大学位灯国教授团队和英国伦敦大学学院（UCL）Gary N Parkinson、英国Diamond 光源合作研究成果，题为“Native de novo structural determinations of non-canonical nucleic acid motifs by X-ray crystallog...
中国科学动物研究所肖治术团队在四川都江堰亚热带森林以食果鸟类与鲜果植物为研究系统开展研究发现，食果动物（如鸟类）的种子传播作用在森林更新中发挥了重要作用，同时在区域生物多样性及生态功能维持中也扮演了极为重要的角色。在果期，森林生态系统的果实资源存在明显的垂直分层，如同一结果树在树冠及地面均有大量的成熟果实。这种果实资源的垂直分布为树上和树下的食果动物提供食物，从而为食果动物的垂直觅食生态位分化提供...
中国科学院生物物理研究所饶子和、王祥喜、歩志高研究团队合力解析非洲猪瘟病毒颗粒精细三维结构，助力新型疫苗开发（图）
中国科学院生物物理研究所 饶子和 王祥喜 歩志高 非洲猪瘟病毒 颗粒精细 三维结构 新型疫苗开发
2019/10/22
非洲猪瘟是由非洲猪瘟病毒引起的家猪、野猪的一种急性、热性、高度接触性动物传染病，所有品种和年龄的猪均可感染，发病率和死亡率高可达100%。世界动物卫生组织将其列为法定报告动物疫病，我国也将其列为一类动物疫病。2018年8月3日农业农村部新闻办公室通报我国首例非洲猪瘟疫情，随后病毒很快传播到全国大部分地区，已经造成巨大的经济损失。目前紧迫需要研发有效的疫苗和防疫手段，用于控制及预防非洲猪瘟疫情。
恒河猴（Macaca mulatta）是生物科学研究和新药研发广泛应用的非人灵长类实验动物。构建一个高质量的恒河猴基因组是开展相关研究的重要基础。当前国际上广泛使用的是印度恒河猴的参考基因组，但这个主要基于二代测序的恒河猴参考基因组组装质量较差，序列碎片化和缺失严重，极大地限制了它的应用，特别是无法用于对基因组结构变异（Structural Variant，SV）的解析。
食物链的结构，即由捕食者与被捕食者形成的连锁关系，通常由动物的体重、力量、速度以及智力决定。生物毒素是产毒动物的一大进化创新，产毒动物的出现对食物链的结构产生了影响，决定食物链结构的传统因素在产毒动物存在的生境中变得不再具有决定性(PNAS 2018)。生物毒素是产毒动物捕食猎物(PNAS 2018; PNAS 2013)、防御掠食者(Nat Commun 2015; Sci Adv 2017; ...