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密码对的使用与基因组进化
基因组进化(Genome evolution) 密码对(Codon pairs) 三联体对(Triplet pairs) Г(α,β)分布(Г(α,β)distribution)
2008/3/6
以5种真核、20种细菌、10种古菌生物的基因组为样本，分析了编码序列中密码对和基因间序列中三联体对的相对模式数随频数的分布，验证了这种分布符合Г(α,β)分布。发现分布形状参数α值与生物基因组进化存在明显的相关性；编码序列与基因间序列的进化方式截然不同。随着进化，编码序列的分布形状逐渐向随机分布靠近（α值逐渐增大）。而对基因间序列，古菌与真核生物的分布形状接近，与细菌的分布相差明显。Codon...
摘要上海市肿瘤研究所 200032
系统树是描述物种、人种甚至基因间亲缘关系和演化的重要工具，必须以进化距离或( 相对)替代率作为重要的参数。但以哪一个参数构建的树更能反映真实的系统树呢?事实上迄 今并无人对此作过认真的研究。本文以模拟数据并用方差分析法检验两个参数的异同并讨论 其包含的生物学意义。研究结果表明，当氨基酸的替代率和核苷酸的替代率分别为0.18和0. 13时，它们的进化距离分别为0...
摘要通过生物信息学和系统发育学分析，研究了苦味受体和甜味／鲜味受体的进化途径。结果显示，苦味受体和甜味／鲜味受体在进化上具有远相关，并且具有不同的进化途径，提示这可能是导致这些受体具有不同功能，传导不同味觉的原因。
摘要Drosophila auraria复合种 (Drosophila aurariaspecies complex)的5个姐妹种D.auraria(A)、D. biauraria(B)、D. triauraria(T)、D.su bauraria(S)和 D.quadraria(Q)的17个地理种群,及4个对照种的5个地理种群为材料,用聚丙烯酰胺等电聚焦电泳(IEF)技术,分析了18种同工酶及成...
DNA进化马尔可夫过程模型的评价与推广
核苷酸替代 随机过程模型 分子进化
2008/1/31
摘要本文对 DNA序列进化过程中核苷酸替代的随机模型进行了评价,对替代速率在时间和空间上不恒定的情形进行了考察与推广。Lanave等(1984) 曾提出一个模型 ,宣称对替代的模式未做任何假定,但事实上我们证明它假定替代过程是可逆的。运用2-p、4-p和6-p模型进行的计算表明替代速度在位点间的差异会造成估计的替代数严重偏低,并且替代数越大,偏差也越大。替代模式在位点间的差异也会造成估计值偏低,但...
根瘤菌中存在一系列控制固氮结瘤因子(lipo-chito-oligosaccharides)合成的结瘤基因(nodulation genes)。其中, nodA基因是合成结瘤因子所必需的, 该基因负责酰基转移酶的合成, 能将不饱和脂肪酸转移到结瘤因子寡聚糖骨架上; 基因nodZ, nolL和noeI为宿主专一性结瘤基因, 分别转录合成岩藻糖基转移酶, 岩藻糖乙酰化酶和岩藻糖甲基化酶。通过GenBa...
猕猴属6个种的rDNA变异及其系统进化关系
猕猴属 核糖体DNA 系统进化
2008/1/23
以人28S、18S rDNA为探针,用15种限制性内切酶构建了猕猴属6个种(M. mulatta、M.facsicularis、M.arctoides、M.assamensis、M.thibetana、M .nemestrina)和滇金丝猴(Rhinopithecus bieti)、白颊长臂猿(Hy lobates leucogenys)核糖体DNA重复单位的限制性内切酶图谱。红面猴( M.arc...
分子进化的概念、理论和方法
分子进化
2008/1/18
严格地说，“分子进化”有两层含意。一层含意是指生命起源时期的化学进化，即有机分子由简单向复杂的演变〔们；另一层含意是指生物进化过程中，构成生物体的大分子，如蛋白质、核酸的演变。由于分子生物学研究的迅速进展，已经搞清了许多生物大分子的一级结构。从某些同源蛋白质（或核酸）的比较中，人们发现，不同生物之间，同源蛋白质（或核酸）结构上的差异各不相同，亲缘关系近的差异较小，反之则差异较大，即这些生物大分子象...
分子进化与中立说。1)
分子进化 中立说
2008/1/18
生物进化的研究向来是以生物的表型为对象的，如旅类植物的维管束，马的脚趾，哺乳动物的齿冠等，都是用古生物学方法来研究的。生物的进化当然是由自然选择理论来说明的，不过这些都是定性的说明而已。
纪念达尔文发展进化论
进化论 达尔文
2008/1/15
达尔文以前，在科学界占统治地位的是特创论、物种不变论的形而上学世界观。各门生物科学没有统一的指导思想。在十九世纪下半期把特创论和物种不变论推翻掉而把各门生物科学统一起来的是达尔文进化论。现在，继续担负这个统一任务的仍然是达尔文进化论。这个进化论的胜利意味着人类思想的大解放，意味着无神论战胜了有神论，唯物主义战胜了唯心主义，辩证法战胜了形而上学。因此，达尔文进化论得到了马克思和恩格斯的重视。
香山科学会议第215次学术讨论会:基因组学和生命的进化
2008/1/11
香山科学会议第215次学术讨论会简介
香山科学会议是由国家科技部（前国家科委）发起，在国家科技部和中国科学院的共同支持下于1993年正式创办，相继得到国家自然科学基金委员会、中国科学院学部、中国工程院、国家教育部、解放军总装备部和国防科工委等部门的支持与资助。香山科学会议是我国科技界以探索科学前沿、促进知识创新为主要目标的高层次、跨学科、小规模的常设性学术会议。会议实行执行主席负责制。会议以评述...
摘要
提供一组新编分子进化实验。通过该实验使学生了解重建分子进化树的基本过程，获得使用不同建树方法、建树材料和建树参数对建树结果影响的正确认识。本实验同时具有开放性和研究性特点，符合实验教学改革的方向和要求。Abstract: This paper presents a group of new experiments on molecular evolution. It allows stud...
异源多倍体植物核rDNA序列的同步进化
植物 异源多倍体 核rDNA 同步进化
2008/1/7
同步进化是异源多倍体植物核rDNA序列进化的重要方式，同步进化的程度在不同植物类群中存在较大差异，有些类群中同步进化力量较强，核rDNA重复序列间已经纯合或接近纯合，有些类群中同步进化的力量较弱，可观察到序列的杂合性。同步进化的机制主要是不等交换和基因转换，并受异源多倍体形成年代、生殖方式、基因突变率等因素的影响。
ADAM，又称MDC，分别是去整合蛋白和金属蛋白水解酶（a disintegrin and metalloproteinase,ADAM）及金属蛋白水解酶、去整合蛋白和富半胱氨酸（metalloproteinase/disintegrin/cysteine-rich,MDC）的英文缩写，是近几年在多细胞动物中发现的一类含信号肽区、前调控区、金属蛋白水解酶区、去整合蛋白区、富半胱氨酸区、上皮生长因子...