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中国海洋大学海洋生物多样性与进化研究所海洋生物遗传学研究团队介绍（图）
海洋生物 遗传学 研究团队
2024/3/5
中国海洋大学海洋生物多样性与进化研究所海洋生物遗传学研究团队研究方向：（1）藻类遗传学和遗传改良。围绕海带和养殖微藻开展经济性状的遗传基础解析和抗逆、抗病生理遗传基础研究，培育杂交海带、海带杂交品种和养殖微藻品种，为海藻养殖产业持续发展提供技术和材料保障。主要成果有杂交海带、海带杂交品种培育及种性维持策略研发；海带高密度连锁图谱绘制；藻基因组测序和抗逆生理遗传基础解析等。（2）饵料藻-微生物互作。...
中国海洋大学海洋生物多样性与进化研究所进化基因组学研究团队介绍（图）
进化基因组 研究团队 生物突变 生活史演化
2024/3/5
利用组学、遗传学和微生物学方法，以纤毛虫原生动物、细菌、酵母等为研究模式，研究生物多样性的产生与演变机制，聚焦生物的突变规律和生活史演化，具体研究主题如下：A.生活史在高变环境下的演化规律与机制；B.基因组演化以及稳定性机制；C.环境胁迫下的突变形成；D.医疗及环境水体中病原微生物演化；E.水产养殖病害纤毛虫的生物防治。
当前人类世，环境在快速变化，物种在快速适应或毁灭，生命自有出路，等待去认识和学习。中国科学院西双版纳热带植物园快速进化与保护研究组致力于从协同进化和遗传物质交换的视角，解析动植物性状进化和协同物种多样化的生态驱动力和遗传机制；师法自然，利用和调整物种间生态关系和遗传关系网络，快速提升物种的遗传弹性和自适应能力，创新适应未来的生物多样性保护方案。
中国科学院微生物研究所向华/李明研究团队此前发现一类全新的可以护卫CRISPR-Cas的双RNA型毒素-抗毒素系统CreTA（Science, 2021），进一步研究发现CreTA起源于mini-CRISPR结构，但其重复序列repeat发生了高度退化（Nucleic Acids Res, 2021）。CreTA的repeat序列为何会发生这一退化，其进化驱动力是什么，科学家们尚不清楚。近日，李明...
2022年3月11日，林业所在沙棘染色体进化及重要经济性状的调控机制研究方面取得新进展。相关成果以《Genome sequence and population genomics provide insights into chromosomal evolution and phytochemical innovation ofHippophae rhamnoides》（基于基因组学和群体遗传学揭...
酿酒酵母中亚硫酸盐转运基因SSU1的分子进化分析
酿酒酵母 亚硫酸盐转运蛋白 适应性进化
2014/2/6
SSU1基因是涉及亚硫酸外排及SO2耐受性的重要因素之一。为了研究酿酒酵母(Saccharomyce cerevisiae)中SSU1对SO2耐受性及其分化机制, 文章探讨了SSU1基因在酿酒酵母中的遗传特征及进化规律。基于SSU1基因序列的聚类分析表明, 酿酒酵母群体可通过该基因分为3个亚群, 且与其分离的地理位置无关; 基于群体数据的McDonald-Kreitman 检验表明, SSU1基因...
杨树MIR169基因家族分子进化分析
毛果杨 MIR169基因家族 分子进化
2014/2/6
MicroRNA(miRNA)是真核生物中普遍存在的一类参与基因表达调控的小分子RNA。ptc-MIR169基因家族有33个成员, 是杨树中规模最大的miRNA基因家族。研究MIR169基因家族的进化对揭示杨树miRNA基因的进化机制具有重要的意义。文章对毛果杨MIR169基因家族的分子系统发育、基因倍增模式、表达分化和靶基因进行了分析。结果表明, 染色体大片段重复和串联重复在毛果杨MIR169基...
LTR-反转座子是植物基因组的主要组成部分。它们在结构上非常保守, 通常含有gag和pol两个基因, 是完成其转座过程所必需的。在前期研究中, 本项目组对大豆基因组SARE转座子家族进行了详细的分析。结果表明, 该家族的拷贝中还存在第3个基因——Orf1。文章借助生物信息学的研究方法, 对33个已测序的基因组进行了全基因组注释。结果发现, 在7个植物基因组(桉树、杨树、棉花、大豆、百脉根、亚麻和苜...
原核生物eno基因在系统进化中应用及水平转移分析
eno基因 系统发育 基因水平转移
2012/8/6
多基因系统发育研究方法是系统发育分析中的一个重要手段, 基因树冲突已成为分子系统发育研究中日益突出的问题。烯醇化酶基因(eno)及其编码的蛋白广泛存在于五界系统中, 烯醇化酶为糖酵解途径中重要酶类。文章选取原核生物已注释的eno基因序列进行了系统发育分析。对其中的138个模式菌株的eno基因序列进行系统发育分析和同源性搜索, 发现19个模式菌株的eno基因是通过水平转移而来; 并通过核苷酸组成、密...
丙型肝炎病毒(Hepatitis C virus , HCV)是导致慢性肝炎的主要病原体之一, 全球感染人数大约为1.7亿。HCV基因组具有高度变异特性, 利用现代遗传分类方法, 可将HCV分为6个基因型和80多个基因亚型。不同HCV基因型、亚型的分布与流行具有明显地域特性：1型、2型呈全球流行态势, 3型主要流行于亚洲、北美及欧洲部分地区, 4型主要流行于中非、中东和欧洲地区, 5型主要发现于非...
基因重复在基因选配(gene co-option)过程中的重要作用: 对motilin/ghrelin 荷尔蒙基因家族及其受体基因家族的进化研究
ghrelin motilin 基因家族 配体 受体 协同进化 基因间相互作用
2013/8/28
原先存在的基因经过一些改良可能获得新的属性从而承担新的功能. 在分子遗传的层次, 这个过程通常伴随基因重复以及基因重复后旁系同源基因的功能分化. 本研究探索了基因重复后荷尔蒙、受体间特异性相互作用的演化形成. 尽管对这个问题已有相关研究报道,但针对更多个案的研究能帮助我们更好地理解此前已经提出的进化模型的普遍性, 可能还有助于发现新的进化模式. 基于生物信息学的手段, 结合比较基因组学、系统发育学...
寄生原生动物线粒体与适应性进化
寄生原生动物 线粒体 多样性 适应性进化
2010/4/20
真核生物的线粒体一般具有一定的典型的结构和功能。然而，在单细胞的寄生原生动物中却不断发现从数量、结构到功能均与典型线粒体明显不同的线粒体，表现出线粒体的巨大可塑性和丰富的多样性。该文对寄生原生动物中这些多样的线粒体进行了概述，并对形成这种多样性的根本原因，即这些生物对寄生生活微氧或无氧环境线粒体所发生的种种适应性进化进行了分析探讨。
本文从微卫星DNA的发现，微卫星DNA的特点及其在基因组中的分布、微卫星DNA的起源进化、微卫星DNA标记的功能及应用，微卫星DNA标记引物的开发及微卫星标记的检测技术和微卫星研究存在问题和研究方向等几个方面对微卫星DNA的研究进展进行综述。
羚牛线粒体DNA和系统进化研究
羚牛 线粒体DNA 多态性 系统进化
2009/10/28
用8种限制酶分析了5种牛科动物，羚牛、黄牛、水牛、绵羊和山羊的线粒体DNA 的多态性。依据数学模型计算这5种动物间的遗传距离，在此基础上构建了UPG 和NJ两种分子系统进化树。结果表明：羚牛与牛和羊的分化时间分别为4．02 Ma和3．72 Ma，因此将羚牛归入羊亚科较为合理。