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从白桦转录组数据库中筛选出45条AP2/ERF家族蛋白,对其蛋白序列进行生物信息学分析和系统进化分析。结果表明,白桦AP2/ERF蛋白除了分为AP2、ERF、RAV和soloist家族外,还有2条蛋白不属于这些家族;不同组别白桦AP2/ERF蛋白在理化性质上存在差异;白桦AP2/ERF蛋白都含有磷酸化位点,但含有磷酸化位点的数量和种类上都有差异;白桦AP2/ERF蛋白大都定位在细胞核里,它们主要在...
宁波大学医学院2018年博士研究生自命题生物信息学考试大纲。
第七届全国生物信息学与系统生物学学术大会将于2016年10月在四川省成都市召开。此次会议由中国细胞生物学学会功能基因组信息学与系统生物学分会和国家自然科学基金委生命科学部联合主办,清华大学教育部生物信息学重点实验室协办,电子科技大学生命科学与技术学院及神经信息教育部重点实验室承办,会议规模1000人左右。
PPR(Pentatricopeptide repeats)基因家族在植物中广泛存在, 其在植物生长发育过程中至关重要。文章采用生物信息学方法, 利用Pfam已鉴定的PPR保守结构域序列检索番茄(Solanum lycopersicum L.)基因组计划注释的蛋白序列, 最终确定了番茄中可能存在的471个PPR编码基因; 根据拟南芥(Arabidopsis thaliana L.)中鉴定的各个结构...
为了解青枯菌(ralstonia solanacearum)基因组中原噬菌体和噬菌体元件的信息, 在烟草青枯菌FQY_4 全基因组序列的基础上, 分析了FQY_4 染色体上的原噬菌体, 结果显示FQY_4 染色体上有1 个具有完整噬菌体特征的原噬菌体, 3 个噬菌体元件。比较青枯菌GMI1000 和FQY_4 中的原噬菌体的序列信息, 结果显示它们具有一定的相似性, 其中青枯菌FQY_4 的原噬菌...
甲胎蛋白(AFP)是类白蛋白家族成员蛋白之一,在生物个体发育以及肝癌发生发展中起重要作用. 为了研究AFP的系统发生,并以此探讨系统发育与个体发育的关系,运用生物信息学手段,分析了不同物种中类白蛋白家族成员的进化关系,并对各分子的白蛋白结构域进行了进化归类.同时,对不同物种的白蛋白(ALB)和AFP之间包含启动子、抑制子和增强子在内的约14?kb的核苷酸序列进行了比较分析. 研究从系统发育的角度阐...

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