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中国科学院成都生物研究所在超大基因组转座子动态研究中取得进展（图）
两栖类蝾螈目 超大基因组 转座子 动态
2021/8/20
转座子（transposable elements, TE）可在染色体DNA上自主复制和“跳跃”，曾长期被认为是 “垃圾信息”， 近年来被证实是驱动基因组扩张的主要组分。超大基因组（一般指基因组大于10 Gb）在动物中非常罕见，我们以两栖动物原始类群版纳鱼螈（Ichthyophis bannanicus）为研究对象（基因组大小约12.2G），采用低覆盖度（0.1×）测序研究其转座子的景观和动态。这...
中国科学院动物研究所研究揭示动物中DNA转座子通过两种机制介导基因重复（图）
中国科学院动物研究所 动物 DNA转座子 两种 机制 介导 基因重复
2021/7/15
转座子被认为是宿主基因组演化的重要推动力。其类型众多，包含non-LTR（Long Terminal Repeat）型逆转座子、LTR型逆转座子、Helitron型DNA转座子、TIR（Terminal Inverted Repeat）型DNA转座子等，可引起包含基因重复（gene duplication）在内的各种遗传突变。已有研究表明，non-LTR型逆转座子在人类基因组中介导基因重复，产生大...
转座子或转座元件是大多数真核生物基因组的主要组成成分。甘蓝(Brassica oleracea)基因组比白菜(B. rapa)大主要是转座子的扩增差异造成的。然而, 这两个芸薹属近缘物种转座子表达水平以及对基因的调控和功能的影响目前还不清楚。文章对白菜和甘蓝叶、根、茎3个器官的转录组数据进行了初步分析。结果显示, 转座子的表达量很低, 转录组reads中有1%来自转座子的转录本; 转座子的表达存在...
Tgf2转座子在团头鲂基因组中的插入效率
Tgf2转座子 基因组 团头鲂 插入效率
2013/10/30
文章通过构建带金鱼Tgf2转座子左右臂、斑马鱼肌球蛋白轻链2(Mlyz2)启动子和红色荧光蛋白(RFP)的供体质粒Tgf2-Mlyz2-RFP, 与Tgf2转座酶mRNA共同显微注射入团头鲂1~2细胞期受精卵, 检测金鱼Tgf2转座子在团头鲂基因组中的整合效率。在团头鲂出膜仔鱼、30 d和180 d幼鱼阶段, 可在鱼体背部和侧面肌肉观察到荧光, 红色荧光蛋白的表达率为48.1%, PCR检测结果显...
中国科学院遗传与发育生物学研究所曹晓风课题组在表观遗传调控水稻转座子活性方面取得新进展（图）
表观遗传 水稻 转座子
2013/10/27
转座元件是指在基因组中能够移动或复制并重新整合到基因组新位点的DNA 片段，它们对动植物基因组的组成、进化和基因表达具有重要影响。而在宿主基因组中，如果失去对转座元件的有效抑制，这些元件将对基因表达和基因组的稳定性构成影响。水稻是主要的粮食作物同时也是重要的单子叶模式植物，其中存在着大量的转座元件，迄今为止，对于水稻宿主基因组如何调节这些转座元件还知之甚少。曹晓风课题组及其合作者以水稻为材料，结合...
转座子荣居自然界最丰富基因榜首位
转座子 自然界 最丰富基因 榜首位
2010/4/27
自然界中的基因有千万种，哪类基因最为常见和最为丰富？由美国南佛罗里达州立大学、圣迭戈州立大学和芝加哥大学科学家组成的研究小组在对大量基因组进行成功解码后找到了答案，那就是有“自私DNA（脱氧核糖核酸）”之称的转座子。转座子基因的丰度和广度表明，它们在进化和生物多样性的保持中发挥了至关重要的作用。
转座子Tn233（CH）分子量的测定
转座子
2008/2/5
摘要转座子Tn233(CH)带有str sul抗性基因，最早是在痢疾杆菌的抗药质粒DR233（Tcr Cmr Smr Sur ）中发现的。现在通过菌株间的配对，将插入了Tn233(CH)转座子的质粒R144did3::Tn233(CH)转移到E.coliC600/PBR322(Apr、Tcr)细胞中，组成两种质糕点共存的菌株。从此菌株中提取出质粒DNA，用转化方法使它转移到E.coliC600/p...
摘要用DNA转化将Co1E1型质粒RSF1030（Tn-2载体）引入大肠杆菌C600-ML细胞，然后用限制性温度和在氨基苄青霉素LB培养基上选择的方法，分离到了大量的Tn-插入突变体。经测定，其中有46株营养缺陷型。用琼脂糖时间性泳检查这些突变体的DNA提取物，发现它们都失去了质粒RSF1030。这些Tn-2插入引起的营养缺陷型在回复到原养型的同时，也失去了氨基苄青霉素抗性。已经插入到细细菌染色体...
摘要Tn4(S.ni`Stt'Ap'), Tn3(Ap'）与‘1'z,233((',H) (Sm'Su'Hg`）是结构上相关而且都属于TnA家族的转座子。据报道1.'n4甲还含有一个拷贝的Tn3。为了弄清它们在家系甲的关系，我们进行了Tn4, Tn3与Tn233(CH）之间的转座功能互补与转座免疫的研究。结果如下：(1)当.Ln4以反式状态存在时，Tn233(CH）转座功能缺失的‘npA一变种（I...