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本研究旨在了解湖羊FSHR基因5'-UTR序列特征和转录因子调控，为揭示湖羊FSHR基因转录调控机制提供依据。采集3只成年湖羊母羊的心、肝、脾、肺、肾、胃、肌肉、大肠、小肠、子宫和卵巢11种组织，采用PCR扩增和克隆测序技术获得湖羊FSHR基因5'-UTR序列，生物信息学方法分析其序列特征，RT-PCR技术分析转录因子PAX4在湖羊11种组织中的表达情况；合成湖羊PAX4基因过表达载体pcDNA3...
山羊肌内前体脂肪细胞诱导分化过程中内参基因的表达稳定性分析
山羊 肌内前体脂肪细胞 内参基因 实时荧光定量PCR
2018/5/29
旨在通过比较9个内参基因在山羊肌内前体脂肪细胞诱导分化不同时期的表达水平进而最终确定适合山羊肌内前体脂肪细胞分化调控研究最佳的内参基因。本研究利用胶原酶消化法获得山羊肌内前体脂肪细胞，并以分别诱导0、1、2、3、5和6 d的细胞为研究对象，利用荧光定量PCR （Real-time quantitative PCR，qPCR）技术和geNorm、NormFinder和BestKeeper程序来检测和...
旨在分析探讨TLR5基因启动子区甲基化修饰对断奶仔猪F18大肠杆菌抗性的调控作用。本研究首先利用qPCR和Western blot检测分析了TLR5基因在F18大肠杆菌抗性型和敏感型苏太断奶仔猪小肠组织（十二指肠和空肠）中的差异表达，然后利用生物信息学分析和双荧光素酶报告系统检测确定TLR5基因核心启动子区、CpG岛及其作用元件，进而检测并分析TLR5基因启动子区甲基化修饰与TLR5基因在F18大...
为了研究对虾免疫致敏过程中Dscam基因的表达规律，实验采用同源克隆和RACE技术获得了中国明对虾Dscam基因cDNA全长序列，并对该序列进行生物信息学分析。结果显示，中国明对虾Dscam基因的cDNA全长为6 624 bp，其中包括171 bp的5'端非编码区，459 bp的3'端非编码区，开放阅读框的长度为5 994 bp，编码1 996个氨基酸。推测该基因编码的蛋白含有一个信号肽、10个I...
实验采用RT-PCR和RACE克隆fzd2、fzd3a、fzd4和fzd10基因，其cDNA全长分别为2 176、3 243、2 509和3 021 bp，其中ORF长度分别为1 652、2 084、1 649和2 161 bp，编码551、695、550和586个氨基酸。氨基酸序列比对和系统树分析显示，4种基因十分保守，黄颡鱼与斑点叉尾鮰亲缘关系最近。组织表达分析显示，4种基因的mRNA在脑、脾...
为了解近年来广西卵形鲳鲹海豚链球菌流行菌株的基因型信息以及菌株间的差异，对2015—2016年从广西地区7个养殖场的患病卵形鲳鲹体内分离得到的17株海豚链球菌菌株分别进行了基因型分析、耐药谱测定以及毒力基因检测。采用随机扩增多态性DNA标记技术(RAPD)和基因组重复序列PCR(rep-PCR)分析其基因型。结果显示，RAPD和rep-PCR指纹图谱结果一致，17株海豚链球菌可分为2种基因型。对海...
为研究Akt基因在中华绒螯蟹蜕壳前后肌肉生长过程中的功能，应用RACE技术克隆得到编码中华绒螯蟹Akt(命名为EsAkt)的全长为2 200 bp的cDNA序列，包括159 bp的5'非翻译区(5'-UTR)、496 bp的3'非翻译区(3'-UTR)和长度为1545 bp编码514个氨基酸的编码序列。蛋白质结构域分析显示EsAkt含有丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶家族的3个特征性保守结构域。多序列比对和...
RE-NUM-OR: Python-based Renumbering and Reordering Software for Pedigree Files
pedigree renumbering pedigree reordering data arrangement
2018/3/5
RE-NUM-OR is a new, flexible, and user-friendly renumbering and reordering data arrangement software for
unprocessed pedigree files used in genetic evaluation systems for personal computers. RE-NUM-O...
Tissue Specific Splicing of Pre-mRNA Porcine Mitochondrial Transcription Factor A
pig mitochondrion mitochondrial biogenesis splicing forms expression
2018/3/5
Mitochondrial transcription factor A plays, due to its role in replication and transcription of the mitochondrial
DNA, an important role in mitochondrial biogenesis and regulation of its activity. In...
Genetic Diversity and Admixture in Three Native Draught Horse Breeds Assessed Using Microsatellite Markers
population structure endangered breeds gene flow genetic distances
2018/3/5
In this study, we aimed to estimate and compare genetic diversity of two native draught horse breeds and check
the possible influence of Noriker breed population on these native breeds. Genetic analy...
两种方法分析大鳞鲃染色体核型的比较研究
大鳞鲃 染色体核型 分析方法 细胞遗传学
2019/1/21
染色体核型分析是细胞遗传学研究的主要内容。为了获得准确、便捷的染色体核型分析方法，以引进耐盐碱品种大鳞鲃为实验材料，取头肾细胞冷滴片法制备染色体标本，采用E-ruler测量软件和Photoshop图像软件结合完成了染色体核型分析，并与常规方法的测量结果、核型分析进行了比较。结果显示，E-ruler软件与常规方法对伸展平直染色体的测量显著差异，前者对弯曲形态染色体的测量结果更为准确；Photosho...
转录组测序研究三角帆蚌珍珠颜色相关基因
三角帆蚌 珍珠颜色 差异表达 转录组测序
2019/1/21
为筛选影响三角帆蚌珍珠颜色的候选基因，采用转录组测序平台Illumina HiSeqTM 2500对蚌壳珍珠层颜色为紫色和白色的三角帆蚌中央膜组织进行高通量测序。所得序列经质控、组装后比对到NR、Swiss-Prot、COG、KOG、KEGG、GO和Pfam数据库中注释，并进行差异基因聚类分析。结果显示，获得干净数据共72 800 581 bp，拼接获得了89 529个Unigene，差异表达基因...
肌球蛋白是肌肉细胞的重要组成成分，影响肌纤维的组成和肌肉生长。为了研究肌球蛋白重链（MYH）基因多态性与大口黑鲈生长性状的相关性，本研究采用PCR技术扩增得到编码区序列全长为9759 bp的大口黑鲈MYH基因，该基因包含37个外显子和36个内含子，编码1940个氨基酸。采用直接测序法在MYH基因上筛选到8个单核苷酸多态性标记（SNP）位点（A-305G、G-558C、A-2784C、A-2816G...
为了解尼罗罗非鱼乳链球菌（GBS）荚膜多糖合成基因的表达及其与荚膜唾液酸含量、菌株致病性的关系，本实验克隆了尼罗罗非鱼荚膜多糖合成基因cpsE、cpsK和neuA，通过qRT-PCR方法分析了这3个基因在不同培养温度下表达水平的变化，同时通过比色法测定了不同培养温度下GBS荚膜唾液酸含量的变化，通过人工感染实验分析了不同水温条件下GBS对罗非鱼的致病性。结果显示，cpsE、cpsK和neuA编码的...