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中国科学院遗传发育所利用环状RNA开发出基于Cas12a的引导编辑器（图）
遗传发育 引导编辑器 基因
2024/1/12
基于CRISPR-Cas9的引导编辑器（prime editors，PEs）可同时实现任意碱基类型的精准替换，以及小片段的精准插入、替换和删除。目前，几乎所有的引导编辑器均是依赖于Cas9蛋白开发而成，但Cas9蛋白存在尺寸较大、脱靶效应高和受限于G/C-rich区域编辑的缺点，限制了引导编辑器的广泛应用。如何进一步提升引导编辑器的编辑精度、消除靶点序列限制并降低递送难度是基因组编辑领域亟待解决的...
2023年1月5日，上海科技大学生命科学与技术学院刘如娟教授与瑞典隆德大学Cristian Bellodi教授受邀在国际学术期刊Nature Reviews Molecular Cell Biology 在线发表了题为“Roles and regulation of tRNA-derived small RNAs in animals”的综述，总结了tRNA来源的小RNA(tRNA-derived...
中国科学院生物物理研究所专利：一种用于肝癌与肝癌微环境相互作用的新的长链非编码RNA检测及其应用
科学家开发时空转录组学并在亚细胞水平揭示RNA动力学图谱
时空转录组学 亚细胞水平 RNA动力学图谱
2024/1/16
细胞转录组的时空调节对细胞内蛋白质的正常表达及细胞功能至关重要。然而，由于现有转录组学方法不能同时获得时间和空间数据。美国麻省理工学院研究团队开发了时空转录组测序技术，并应用于探究RNA的生成、转运和降解速率，在亚细胞水平揭示RNA的动力学图谱。该研究成果于近日发表在《Nature Methods》上，题为：Spatiotemporally resolved transcriptomics rev...
第四届全国核糖核酸（RNA）青年学术会议在兰州大学成功举办（图）
核糖核酸 青年学术会议 兰州大学生命科学学院
2023/9/11
2023年4月20日上午，第四届全国核糖核酸（RNA）青年学术会议在兰州大学逸夫生物楼国锠报告厅开幕，开幕式由兰州大学生命科学学院侯岁稳院长主持并致辞。本次会议以“RNA研究新时代-前沿与健康”为主题，来自全国各地的350余名专家学者齐聚一堂，围绕“RNA生成代谢与调控功能、RNA与健康和农学、RNA修饰与表观遗传学以及RNA研究新技术和新方法”四个专题作了60余场精彩纷呈的学术报告及20余场墙报...
2023年4月12日，中国科学院北京生命科学研究院赵方庆团队在《自然-实验手册》（Nature Protocols）上，发表了题为Full-length circular RNA profiling by nanopore sequencing with CIRI-long的研究论文，建立了环形RNA全长转录本解析和高效挖掘的技术体系。
细胞自噬是一种溶酶体介导的降解途径，可以选择性清除胞内不需要的蛋白聚集体和受损的细胞器，以维持细胞稳态平衡。近年来的研究表明，通过液-液相分离（liquid-liquid phase separation, LLPS）形成的蛋白凝聚体在应激或者病理条件下发生异常的相转变，从而逃逸自噬降解。
宿主细胞依赖多种免疫应答机制来对抗病毒感染。其中，针对核酸分子的免疫识别和操作，是极为核心的抗病毒免疫策略，其广泛存在于从细菌到哺乳动物等几乎所有宿主系统中（图-1）。相较于哺乳动物细胞稍显复杂的信号转导和调控，细菌往往更为简单高效，其编码的多种抗病毒免疫系统可直接对核酸分子进行切割或修饰（图-1）。这种特点也使得细菌免疫系统被广泛用于多种生物学工具的开发（如R-M和CRISPR-Cas等），极大...
2023年1月30日，中国科学院生物物理研究所范祖森课题组在《The EMBO JOURNAL》杂志在线发表了题为"Noncoding RNA circBtnl1 suppresses self-renewal of intestinal stem cells via disruption of Atf4 mRNA stability"的文章，该研究揭示了在肠道干细胞高表达的环状RNA circB...
哮喘是儿童最常见的慢性呼吸道疾病，近年来，其发病率呈快速上升的趋势，国内1990-2010年儿童哮喘的发病率从1.09%增至3.02%，20年增加了2.8倍。目前上海市儿童的哮喘发病率已超过8%，成为国内发病率最高的城市，严重影响着儿童的生长发育及身心健康。哮喘是一种是由遗传、环境和表观遗传学因素等相互作用而引起的一种免疫炎症性疾病。表观遗传学是不依赖于DNA序列变化而由染色质改变产生的可稳定遗传...
中国科学院微生物研究所向华/李明研究团队此前发现一类全新的可以护卫CRISPR-Cas的双RNA型毒素-抗毒素系统CreTA（Science, 2021），进一步研究发现CreTA起源于mini-CRISPR结构，但其重复序列repeat发生了高度退化（Nucleic Acids Res, 2021）。CreTA的repeat序列为何会发生这一退化，其进化驱动力是什么，科学家们尚不清楚。近日，李明...
分子遗传学前沿讲座：RNA structure, a hidden regulator in living cells（时间：2022年7月27日14:00）（图）
分子遗传学 前沿讲座 RNA结构 丁一倞
2023/4/9
分子遗传学前沿讲座：RNA structure, a hidden regulator in living cells（时间：2022年7月27日14:00）。
细胞氧化还原反应是生命活动的基本反应，细胞氧化还原调控广泛参与细胞信号转导及生理和病理过程，因此，揭示细胞氧化还原调控机制具有重要意义。目前，关于氧化还原调控机制的认识多为编码基因和蛋白，大量的非编码基因对氧化还原调控的作用知之甚少。为此，中国科学院生物物理研究所研究员陈畅课题组与中科院院士陈润生课题组合作，在Redox Biology上，发表了题为Long noncoding RNA MAGI2...
2021年12月2日，中国科学院昆明动物研究所陈勇彬课题组在《Molecular Cancer-影响因子：27.401》杂志在线发表了题为“LncRNA PKMYT1AR promotes cancer stem cell maintenance in non-small cell lung cancer via activating Wnt signaling pathway”的研究论文。陈勇彬...
中国科学院分子细胞科学卓越创新中心陈玲玲研究员受邀在Molecular Cell发表环形RNA翻译Preview
中国科学院分子细胞科学卓越创新中心 环形RNA 翻译 Preview
2021/10/24
2021年10月21日，中国科学院分子细胞科学卓越创新中心（生物化学与细胞生物学研究所）陈玲玲研究员受邀在国际学术期刊Molecular Cell发表了题为“Expanded regulation of circular RNA translation”文章，对同期同刊发表的环形RNA翻译相关研究工作进行了导读和展望。