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中国农业科学院棉花研究所专利：与棉花衣分性状显著相关的基因、SNP标记及其应用
棉花 衣分性状 基因 SNP标记
2024/5/13
本发明涉及棉花衣分性状分子生物学领域，特别涉及与棉花衣分性状显著相关的基因、SNP标记及其应用。与棉花衣分性状显著相关的基因，为基因Gh_D05G1124和/或Gh_D05G0313。本发明以276份陆地棉材料为材料，种植于多个环境中，采用CottonSNP63K基因芯片进行基因分型，共获得10660个高质量的SNPs，用于遗传结构分析和GWAS。结果共发现23个与衣分性状显著相关的SNPs，对应...
本发明属于生物技术领域，公开了中棉所70群体中与棉花纤维强度相关的一个QTL，位于陆地棉24号染色体，定位到6个SNP分子标记，定位到116个基因并对其中一些基因的表达模式进行了分析。本发明还公开了一种与棉花相关的QTL的应用，该QTL和SNP分子标记可用于分子标记辅助选择育种，显著提高强度纤维品系的选择效率，为进一步提高纤维品质提供了一种最经济有效的分子育种新途径。
中国科学院西双版纳热带植物园（以下简称“版纳植物园”）植物系统发育与多样性保护研究组选取黄杞（Engelhardia roxburghiana）为研究物种，利用生物信息学软件STACKS，探索使用不同参考基因组对SNP Calling的影响。该研究围绕两种不同参考基因组：使用近缘种（即枫杨：Pterocarya stenoptera）作为参考基因组，以及利用物种本种（即黄杞）作为参考基...
中国农业科学院棉花研究所专利：与陆地棉枯萎病抗病相关的SNP分子标记及其应用
陆地棉 枯萎病 抗病性 SNP分子标记
2024/4/15
本发明公开了与陆地棉枯萎病抗病相关的SNP分子标记及其应用。本发明首先公开了检测棉花基因组中SNP标记的多态性或基因型的物质在鉴定或辅助鉴定待测棉花对枯萎病抗性中的应用；所述SNP标记为位于棉花基因组D03号染色体第2259240位核苷酸，其核苷酸种类为A和C。本发明进一步公开了鉴定或辅助鉴定待测棉花对枯萎病抗性的方法。本发明所提供的SNP标记可用于棉花枯萎病抗病性的早期预测，还可以用于棉花遗传背...
本发明公开了与陆地棉D08染色体纤维强度相关主效QTL紧密连锁的SNP位点及应用，该陆地棉纤维强度主效QTL位点qFS D08 1、qFS D08 2和qFS D08 3均位于染色体D08上，LOD值在10.299和13.774之间，可解释13.917％ 17.148％的表型变异。本发明所述的SNP分子标记是以陆地棉稳定的RIL群体为材料，通过简化基因组测序(GBS)的方法得到。本发明所公开的这些...
中国农业科学院棉花研究所专利：与陆地棉叶片绒毛相关的SNP分子标记及其应用
陆地棉 叶片绒毛 SNP分子标记
2024/4/11
本发明提供与陆地棉叶片绒毛相关的SNP分子标记及其应用，属于分子生物学领域。本发明与陆地棉植株绒毛相关的SNP标记共31个，这些标记具有SEQ ID No.1～SEQ ID No.31所示的DNA序列，这些SNP分子标记单独或任两个或多个组合应用均可用于陆地棉植株绒毛的早期预测，还可用于棉花遗传背景分析和筛选，以及植株绒毛位点分子标记辅助选择育种，具有广阔的应用前景。
本发明属于植物分子生物学技术领域，具体公开了一种与陆地棉生态适应性关联的SNP分子标记及其应用，本发明与陆地棉生态适应性相关的SNP标记共45个，这些SNP标记具有SEQ IDNO.1-45所示的DNA序列，这些SNP分子标记单独或任两个或多个组合应用均可用于陆地棉生态适应性的早期预测，还可用于棉花遗传背景分析和筛选，以及生态适应性位点分子标记辅助选择育种，具有广阔的应用前景。
本发明属于植物基因工程技术领域，具体公开了棉花基因及其SNP标记在调控棉花果枝节间长度中的应用。本发明提供棉花基因在调控棉花果枝节间长度中的应用，同时提供与所述棉花基因相连锁的SNP标记及其应用。通过将棉花中所述棉花基因进行过表达或基因敲除来改变棉花果枝节间长度；同时利用本发明提供的SNP标记进行分子标记辅助选择，达到检测棉花果枝节间长度和育种的目的。本发明对培育适合机械采收和轻简化栽培的棉花品种...
国际竹藤中心专利：一种毛竹变型SNP引物开发的方法
国际竹藤中心 毛竹变型 SNP引物
2023/12/7
一种毛竹变型SNP引物开发的方法，属于分子生物学领域。具体包括以下步骤：a.DNA提取与基因组测序；b.与参考基因组进行比对统计；d.SNP注释；e.SNP筛选；f.SNP引物开发。通过本发明的方法可以开发出毛竹变型SNP引物。
武汉市农业科学院专利：用于不结球白菜的SNP-Panel检测的引物组及其应用。
国际上首个橡胶草高密度SNP遗传图谱构建
天然橡胶 工业原料 三叶橡胶树 橡胶草
2023/7/4
天然橡胶是世界四大工业原料之一，巴西三叶橡胶树一直是天然橡胶的主要来源，但由于种植面积限制、生产成本增加、遗传背景狭窄和病虫害严重等因素，橡胶生产逐渐难以满足需求。因此，开发生产天然橡胶的替代资源具有重要的战略意义和经济价值。
2022年5月26日前，由中国水产科学研究院南海水产研究所朱克诚、张殿昌、刘宝锁等发明的“卵形鲳鲹刺激隐核虫病关联的SNP分子标记及其引物和应用”获得国家发明专利授权，专利号为ZL202111131036.X。该发明提供了一种与卵形鲳鲹刺激隐核虫病相关联的SNP分子标记，该SNP分子标记位于RAC3基因组的碱基序列自5’端起的第4116位，其碱基分别为G或T；同时，提供了用于扩增SNP分子标记的引...
鸡胰岛素样生长因子2基因(IGF2)外显子区功能性SNP预测与分析
鸡 IGF2基因 SNP功能预测 生物信息学
2021/3/9
旨在采用生物信息学方法筛选鸡IGF2基因中具有潜在生物学功能的非同义单核苷酸多态性（non-synonymous single nucleotide polymorphisms，nsSNPs）位点，为开展标记辅助选择改良鸡重要经济性状提供理论参考。本研究从dbSNP数据库中检索出鸡IGF2基因的12个nsSNPs位点，利用生物信息学软件SIFT、Polyphen-2、PhD-SNP和SNAP预测其...
旨在探究DCT基因启动子区甲基化水平和SNP突变对山羊毛色的影响，为探索DCT基因调控山羊毛色变化的机理提供理论依据。本研究以山羊为试验动物，对DCT基因启动子区进行CpG岛预测，设计引物对预测的2个CpG岛富集区域进行亚硫酸氢盐甲基化测序，使用甲基化水平分析软件BISMA统计甲基化位点，比较唐山奶山羊（白色）和南江黄羊（黑色品系）两种不同毛色山羊群体DCT基因启动子区甲基化水平差异。克隆DCT基...
日前，由珠江所水产种质资源与遗传育种研究室赵建副研究员等发明的“用于斑鳢性别鉴定的SNP位点及其检测方法”获得国家发明专利授权，专利号为ZL 2016 1 0532882.5。本发明专利是继乌鳢性别鉴定标记后全雄杂交鳢品种培育的另一核心技术，主要涉及斑鳢的遗传性别鉴定。通过本专利的标记和方法，可以对斑鳢进行遗传性别鉴定，用于在全雄乌斑杂交鳢品种培育中鉴别正常雌雄鱼、性逆转的伪雌鱼和超雄鱼。乌鳢和斑...