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古DNA研究揭示东亚家猪母系遗传历史（图）
古DNA研究 东亚家猪 母系遗传历史
2023/1/17
2021年12月11日，《遗传学报（英文版）》（Journal of Genetics and Genomics，中科院生物学大类一区）以研究论文形式在线发表了中国科学院古脊椎动物与古人类研究所、中国社会科学院考古所和陕西省考古研究院共同主导完成的古代东亚家猪线粒体全基因组研究成果。研究获取了42例来自于黄河流域的中国古代猪线粒体基因组数据，发现有部分类型从新石器时代早期直到现在连续存在于中国家猪...
DNA聚合酶分子马达精确动态工作机理研究取得进展（图）
DNA聚合酶分子 马达 确动态工作机理
2023/1/6
从细胞最基本的各种功能原件开始，精确认识其动态工作机理，是认识生命、有效干预生命过程具备基本意义的第一步。伴随冷冻电镜技术的突破，蛋白质静态晶体结构目前能够高效获取，为突破生命科学认知局限提供了巨大便利。之后，解析蛋白质分子内部复杂部件的动态反应机理，是生命科学未来亟需突破的难题。其中，DNA/RNA聚合酶等马达分子精确动态工作机理的明晰，将为高效研发控制病毒复制的有效药物提供可行前提。遗憾的是，...
转录调控蛋白质机器由转录因子（transcirption factor，TF）、转录辅助因子（transcirptional coregulator， TC）等构成，其在几乎所有生物学进程（如分化、发育、细胞周期控制和细胞凋亡等）中都发挥着关键作用。基因的转录过程依赖于转录调控蛋白质机器与DNA结合并行使相应功能，二者的结合是基因启动转录的前提。真核生物基因组中的染色质有一些区域经染色质重塑后呈现...
DNA是由脱氧核糖核苷酸组成的大分子聚合物，具备较好的稳定性和可编程性，已被广泛作为一种通用型生物材料用于构建各式各样具有精确尺寸和特定形状的纳米结构。另一方面，自上世纪90年代以来，生化学家发现DNA像RNA和蛋白质一样具备酶活性，可催化一系列化学反应，包括在特定位点切割DNA或RNA。当结构和酶这两种不同类型的DNA相遇时产生了一系列火花，一些新的研究领域有望因此而诞生。
浙江大学生命科学研究院2021年8月17日宋海卫和黄俊课题组在Cell Discovery上合作发表论文解析了INTS3/INTS6蛋白质复合物参与DNA损伤修复的分子与结构基础（图）
宋海卫 黄俊 蛋白质复合物 基因
2022/10/25
2021年8月17日，浙江大学生命科学研究院宋海卫课题组和黄俊课题组合作在Cell Discovery上发表了题为“Crystal structure of the INTS3/INTS6 complex reveals the functional importance of INTS3 dimerization in DSB repair”的研究论文。该论文在分子水平上揭示了INTS3的二聚化...
生殖健康研究所肖先金课题组DNA纳米技术领域获进展（图）
DNA纳米技术 生殖健康研究所 光热治疗 生物成像
2021/9/26
国际著名期刊《ACS Nano》（IF 15.881）近日在线发表了生殖健康研究所肖先金教授题为Multifunctional Clip strand for regulation of DNA strand dis-placement and construction of complex DNA nanodevices的研究论文。（论文链接：https://pubs.acs.org/doi/1...
神秘蛋白质可使人类DNA形态演变成不同结构（图）
DNA形态 蛋白质 凝缩素 细胞核
2022/1/27
北京时间6月9日消息，人类和蚊子的细胞核都具有自己的形状，目前，研究人员发现这两种生物DNA变体非常微妙，可以转化为不同形态，甚至能使人类DNA结构像蚊子DNA一样。
与RNA和蛋白质一样，DNA具备酶的活性，尽管这一特性目前只在体外得到确认。在DNA的众多酶活特性中，可水解切割DNA的DNA（DNA水解自切酶）因其具备作为新型基因编辑工具的潜能受到更多关注。现有的DNA水解自切酶都是从人工合成的包含随机序列（N）的单链（ss）DNA文库中筛选得到的；大约十年前，耶鲁大学的Breaker团队建立了一套强大的体外筛选策略，借助环化酶CircLigase催化线性DN...
当前，单链DNA序列的体外获取严重依赖于固相化学合成，其技术上已非常成熟，但依然具有明显的局限性。比如，化学合成DNA的产率随着序列长度的增加而显著降低，当超过200个碱基时，化学合成得到的DNA不仅产率/量低下，而且成本较高。换言之，化学合成长单链DNA的性价比很低，该缺点严重限制了很多基于长单链DNA序列的下游生物技术的应用，如长单链DNA模板介导的基因敲入、基于长单链DNA锁式探针的长程测序...
陈旧动物皮张的古DNA提取方法比较研究（图）
陈旧动物皮张 古DNA 提取方法
2023/2/13
2021年5月18日，《动物学研究》（ZOOLOGICAL RESEARCH，中科院动物学一区Top期刊）发表了中国科学院古脊椎动物与古人类研究所分子古生物学实验室付巧妹研究团队主导，与云南大学、新疆文物考古研究所、大理大学、德国Leibniz Institute for Primate Research、越南Wildlife Consultant，Cuc Phuong Commune等单位共同合...
顾宏周课题组与合作者《Nature Chemistry》报道利用DNA纳米组装体按尺寸精确分选脂质体新策略用于曲率依赖的膜相关反应研究（图）
粒径 曲率 DNA 纳米 囊泡 物医学研究院
2023/4/17
在细胞中，无论是胞内囊泡与细胞器还是胞外的分泌囊泡，大量膜蛋白可以在具有极高曲率的弯曲膜上 (曲率半径<50 nm）分布并维持其结构域，为了理解这些膜蛋白与高曲率膜的依存关系及其功能行为，人们亟需一种模型体系进行膜结构的仿生研究，而粒径大小精确可控的脂质体可以提供这样的理想平台（粒径与曲率成反比）。在现有的脂质体制备策略中，粒径大小的调控依赖于制备条件、均一化的处理方式及纯化方式等，但得到的脂质体...
近15年来，作为构建DNA纳米组装体的主要方法之一，DNA折纸术(DNA origami)可使得一条长单链DNA在成百或千条短链DNA的辅助下, 通过碱基互补配对原则折叠并锁定生成所设计的纳米图案，它的出现极大地推动了DNA纳米技术领域的发展。单链DNA折纸术(single-stranded DNA origami)是传统DNA折纸术的一种进化和衍生，它摒除了对众多短序列的需求，通过高度集成序列信...
环状单链脱氧核糖核酸（circular ssDNA）在分子生物和DNA纳米技术等领域扮演着重要的角色，如作为滚环扩增的必备模板、DNA拓扑结构的构成单元等。目前常用的依赖于T4 DNA连接酶制备环状单链DNA的方法容易产生多聚体副产物，导致单体环产率低；而现有的基于CircLigase（一种单链环化酶）制备环状单链DNA的方法虽然可一定程度上减少副产物，但是随着底物DNA链长度的增大，CircLi...
我国结直肠癌的发病率和死亡率逐年升高，目前缺乏有效无创、依从性高的结直肠癌筛查方法。粪便DNA和RNA检测是近年新兴的非侵入性结直肠癌筛查手段，尤其是粪便多靶点DNA和微小RNA（miRNA）检测具有无创无痛、敏感性高、安全方便等特点，能在很大程度上弥补传统筛查方法的不足。国外已将粪便多靶点DNA检测纳入结直肠癌的筛查指南，但其也存在特异性低、价格昂贵、癌前病变检出率低等不足。粪便miRNA检测具...
Plants are marvelous chemists, the gardenia's DNA shows（图）
Plant marvelous chemists gardenia DNA shows
2020/7/3
Plants are some of nature's most extraordinary chemists. Unlike animals, they can't run from predators or pathogens. They can't uproot to seek out mates or spread their seeds. Instead, they manufactur...