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MACdb数据库系统建立了癌症-代谢物关联关系的收集标准,通过使用一系列本体体系(Ontology)对癌症类型、特征、代谢物标准化,构建了高一致性的综合知识集合。当前版本的知识库共收录了462篇文献,提取了40,710个癌症-代谢物关联关系对,共涉及到269个癌症特征,涵盖17类高发病率或高死亡率癌症类型,是当前涵盖癌症类型最全的癌症-代谢物关联知识库。MACdb构建了便捷高效的检索和过滤系统,支...
2023年6月30日,国际学术期刊Arthritis & Rheumatology在线发表了中国科学院上海营养与健康研究所尹慧勇研究组题为“Metabolomics and Machine Learning Identify Metabolic Differences and Potential Biomarkers for Frequent versus Infrequent Gout Flar...
细胞内的代谢通量受胞内基因表达、转录调控、蛋白修饰、别构效应等调控体系共同作用。然而,目前关于细胞内代谢通量的详细调控机制存在较多未知,例如代谢通量的变化到底在多大程度上依赖基因表达以及有多大程度通过酶活力调控。酿酒酵母的Crabtree效应是重要的代谢调控表型,但该表型下各种调控因子对胞内代谢通量的相对贡献尚不清晰,尤其是对细胞代谢通量调控具有重要作用的蛋白磷酸化以及代谢物别构效应。它们对代谢通...
随着水体富营养化日益严重以及气候变暖,全球湖泊蓝藻水华日益频发。蓝藻衍生污染物微囊藻毒素(Microcystins,MCs)慢性暴露已成为全球性健康问题。MCs具有强烈的神经毒性,能够影响哺乳动物大脑结构和功能,并与人群神经退行性疾病阿尔兹海默症有关。已有研究或基于整个大脑(不分区)或主要关注在认知中起重要作用的海马区, 却鲜有关于MCs对其他脑区的神经毒性作用以及潜在分子机制的研究。脂质作为脑组...
2023年6月27日,中国科学院深圳先进技术研究院医工所微创中心聂泽东研究员团队在基于生理信息的无创血糖监测技术方面取得新进展,相关研究成果以“Noninvasive blood glucose monitoring using spatiotemporal ECG and PPG feature fusion and weight-based Choquet integral multimode...
细胞氧化还原调控广泛参与细胞信号转导及细胞代谢过程。饮食限制可改善健康和生存状况,而在不同饮食条件下,氧化还原平衡在不同细胞器和不同组织会发生怎样的变化尚不清楚,导致代谢的氧化还原调控机制不明。因此,探索不同饮食条件下的精确氧化还原图谱具有重要意义。2023年6月12日,中国科学院生物物理研究所陈畅课题组与华东理工大学赵玉政课题组合作,在Stress Biology上,发表了题为Exploring...
细胞氧化还原调控广泛参与细胞信号转导及细胞代谢过程。饮食限制能改善健康和生存状况,然而在不同饮食条件下,氧化还原平衡在不同细胞器和不同组织会发生怎样的变化并不清楚,导致代谢的氧化还原调控机制不明。因此,探索不同饮食条件下的精确氧化还原图谱具有重要意义。中国科学院生物物理研究所陈畅课题组与华东理工大学赵玉政课题组开展合作研究,于2023年6月12日在《Stress Biology》杂志发表了题为" ...
盾状腺毛是一些植物中合成、储存和分泌次生代谢产物的重要场所,萜类、苯丙烷类、黄酮类、生物碱和酰基糖等均可在其内部合成。薰衣草盾状腺毛是薰衣草精油的主要贮藏结构之一,研究其分布、发生及分子调控机制,对于阐明薰衣草主要成分的代谢调控机制和品质育种有重要意义。
代谢型谷氨酸受体(Metabotropic glutamate receptor,mGlu)是人体内最重要的神经递质受体之一,通过与兴奋性神经递质——谷氨酸结合,调控神经信号的传递。其生理功能涉及学习、认知、记忆及情绪调控等,是阿尔兹海默症、帕金森病、焦虑症等重大神经系统疾病潜在的治疗靶点。
023年6月5日,国际学术期刊EMBO Molecular Medicine在线发表了中国科学院上海营养与健康研究所翟琦巍研究组题为“AAV induces hepatic necroptosis and carcinoma in diabetic and obese mice dependent on Pebp1 pathway”的研究论文。该研究发现腺相关病毒(Adeno-associated...
中国科学院上海营养与健康研究所、西南医科大学附属医院和青岛大学研究人员首次解析脯氨酸羟基化修饰调控2型糖尿病进展的新机制,揭示了脯氨酸羟化酶3(PHD3)通过羟基化增加糖异生关键转录因子CRTC2的核定位与活性,进而增加肝脏糖异生基因表达和葡萄糖产生。该研究成果于5月30日在《美国科学院院刊》(PNAS)在线发表。
肝脏作为生物体脂代谢的中心枢纽,主要依赖于其所分泌的肝因子,实现与其他组织器官之间的信号流通和调控反馈,尤其是在能量代谢过程中扮演着重要角色。然而,肝内脂代谢的调节机制与肝因子表达分泌调控尚未被完全阐明。葡萄糖醛酸C5异构酶 (Glucuronyl C5-epimerase ,Glce) 作为细胞膜上广泛存在的硫酸乙酰肝素蛋白聚糖(HSPG)糖链合成修饰的重要异构化酶,基因高度保守,但是否参与肥胖...
2023年5月27日,华中农业大学生命科学技术学院、生物医学与健康学院精准营养与代谢团队陈振夏课题组在国际学术期刊Briefings in Bioinformatics在线发表最新研究成果,该研究基于机器学习的算法开发了可自动下载和筛选高通量测序数据的软件MassiveQC,并将其应用于黑腹果蝇的研究,通过系统整合该物种所有公开RNA-seq数据,解析基因表达动态性的调控规律和演化模式。该研究为后...
蒸散发是陆地生态系统水、能量循环的关键变量和重要纽带。蒸散发参与土壤-植被-大气系统中复杂的相互作用,具有过程复杂且时空变异性大的特点。蒸发互补关系(CR)理论只需常规气象变量即可估算蒸散发,2023年得到了快速发展和广泛应用。当前,全面涵盖CR模型时间和空间性能的评价研究少之又少,对不同CR模型的时间和空间精度以及参数敏感性的认知仍然相对匮乏,特别是在缺少蒸发观测的流域。
代谢工程可以通过基因改造将生物体内代谢通量重新定向到目标产物合成,从而构建高效工业菌株,实现化学品、药物和生物燃料的绿色生物制造。基因组尺度代谢网络模型(Genome-scale metabolic model,GEM)分析可以计算特定菌种中的产物合成最优途径,从而预测可能的代谢工程改造靶点。通量平衡分析(Flux balance analysis,FBA)是GEM分析中最广泛使用的途径设计算法,...

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