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研究揭示啮齿动物的肠道微生物结构特征反映宿主的系统进化关系（图）
啮齿动物 肠道微生物 结构特征 系统进化
2023/8/3
在长期进化过程中，肠道微生物与其宿主形成了共生功能体。肠道微生物对于维持宿主的能量代谢、免疫功能和社会行为等具有重要作用，有助于提高动物宿主的生存和繁殖适合度。由宿主与肠道微生物组成的全基因组决定了动物物种的适应与进化。然而，关于宿主遗传因素（系统发育）与环境变量对肠道微生物结构的相对贡献尚不明确，特别是亲缘关系较近物种肠道微生物的关系。此外，不同物种能量代谢特征与系统发育关系未见报道。
洗涤过程中的微生物交叉污染以及后续异味产生，一直是人们关心的家庭卫生问题。虽然抗菌洗涤剂可以减少异味，但其除菌和除臭的效果与机制尚不明确。青岛能源所单细胞中心与宝洁公司合作，利用前期发明的简化宏基因组测序技术2bRAD-M，通过研究日常使用的棉质毛巾中微生物含量、多样性和异味成分，揭示了洗涤过程中衣物间微生物交叉污染现象及后续异味形成的机制，强调了科学有效的洗涤对衣物上异味控制以及个人卫生的重要性...
2022年12月7日，中国科学院动物研究所王关红研究组在Trends in Parasitology上发表题为“Nasonia-microbiome associations: a model for evolutionary hologenomics research”的综述论文，系统总结了Nasonia寄生蜂微生物组与宿主相互作用的的最新研究进展。
细胞中的代谢调控十分复杂，一个特定的细胞功能往往由一系列不同类型的代谢途径调控相互作用决定。例如，氨基酸的代谢通常由不同类型相互作用组成的反馈或前馈回路来调节。由于缺乏对这些调控关系的全局性认识，对细胞进行代谢重塑时常触发胞内复杂调控而无法达到预期目标，这是目前细胞工厂构建中存在的共性问题。通常不同类型的调控数据散落在各个不同的数据库中，生物学家较难通过仅关注与所研究的代谢物/蛋白质密切相关的一两...
近日，合肥工业大学食品与生物工程学院汪惠丽教授团队在肠道菌群研究领域取得新进展。相关研究成果“Gut Microbiota Shapes Social Dominance Through Modulating HDAC2 in the Medial Prefrontal Cortex”在Cell子刊《Cell Reports》上发表并成为编辑推荐论文。
近日，微生物技术国家重点实验室高超教授与上海交通大学许平教授、山东大学第二附属医院张文博士合作，在《自然·通讯》（Nature Communications， IF=14.919）上发表了题为“An L-2-hydroxyglutarate biosensor based on specific transcriptional regulator LhgR”的研究论文。微生物技术国家重点实验室博士...
中国科学院天津工业生物技术研究所构建高效利用氢气的大肠杆菌底盘细胞（图）
高效利用 氢气 大肠杆菌 底盘细胞
2020/12/18
氢气广泛存在于地质储层、工业副产品和自然发酵反应中，这使得它成为提高厌氧发酵还原性产物效率的一个潜在理想补充底物。尽管氢气已广泛应用于工业和制药原料生产过程中，但在微生物细胞工厂中尚未实现有效利用。
近期，王建军研究员及其团队通过研究亚欧山地溪流生物膜中的细菌、古菌以及真菌等微生物，发现气候对微生物功能基因多样性的大陆尺度格局具有调控作用，具体表现为：功能基因多样性在气候因子的调控作用下随着海拔升高而单调下降，而功能基因群落组成随着海拔增加而单调增加，这一模式在挪威、西班牙和中国等多个研究区域得到验证。在此基础上，通过模型预测，发现在未来的气候模式下，亚欧大陆河流水体微生物的功能基因多样性变化...
中国科学院天津工业生物技术研究所研究员刘君带领的微生物生理和代谢工程研究组利用适应性进化策略筛选获得了一株谷氨酸棒杆菌耐酸菌株，通过比较分析进化菌株与原始菌株的生理特性差异，并结合转录组测序数据，对进化菌株的耐酸机理进行了详细研究。结果表明，相较于原始菌株，进化菌株在低酸胁迫下能更好地保持细胞结构的完整性，同时维持更高的胞内pH和较低的胞内活性氧水平，进而实现低酸胁迫下更强的生长和存活能力。通过转...
中国科学院微生物研究所等在细菌调控元件资源应用中取得进展（图）
中国科学院微生物研究所 细菌 元件资源应用
2018/12/3
中国科学院微生物研究所微生物资源前期开发国家重点实验室微生物生理代谢研究组首次发现原核生物別构转录因子（allosteric transcription factor，aTF）在体外能够结合缺刻的DNA结合序列，并利用这一发现建立全新的小分子检测方法平台。相关工作以长文（Research Article）的形式发表于《科学进展》（Science Advances）。这是该研究组在这一研究方向连续发...
科睿唯安（Clarivate）最近公布了2018年全球高被引科学家名单，西安交大共4名教授入选。其中，能动学院郭烈锦院士、理学院丁书江教授、材料学院马伟教授三人入选交叉学科领域的高被引科学家名单，人居学院程海教授入选地球科学领域高被引科学家名单。
西安交通大学4人入选2018年全球高被引科学家名单
西安交通大学 2018年 全球高被引科学家 名单
2018/12/13
科睿唯安（Clarivate）最近公布了2018年全球高被引科学家名单，西安交大共4名教授入选。其中，能动学院郭烈锦院士、理学院丁书江教授、材料学院马伟教授三人入选交叉学科领域的高被引科学家名单，人居学院程海教授入选地球科学领域高被引科学家名单。
北京林业大学计算生物学中心博士生发表高质量论文
北京林业大学计算生物学中心 博士生 高质量论文
2018/10/24
近日，国际生物生理研究主流期刊《Cellular Physiology and Biochemistry》（IF:5.500）发表了我校生物学院计算生物学中心博士生赵国淼题为“How long non-coding RNAs and microRNAs mediate the endogenous RNA network of head and neck squamous cell carcino...
中国科学院天津工业生物技术研究所研究员刘君带领的微生物生理和代谢改造研究团队以谷氨酸棒杆菌为研究材料，分析和鉴定出四个潜在的Na+/H+逆向转运蛋白（Mrp1-2、NhaP和ChaA），并系统阐述了谷氨酸棒杆菌在盐碱胁迫等压力条件下的生理适应策略。研究发现，谷氨酸棒杆菌Mrp1蛋白具有最显著的Na+/H+离子转运活性，该蛋白主要在碱性条件下发挥作用。体内实验进一步证实，Mrp1逆向转运蛋白主要参与...
