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新编辑器可同时高效编辑水稻四个除草剂靶基因（图）
新编辑器 编辑水稻 除草剂 靶基因
2021/5/12
近日，中国农业科学院植物保护研究所作物有害生物功能基因组研究创新团队在《分子植物学》（Molecular Plant）上在线发表最新研究论文。该团队优化升级了现有植物腺嘌呤碱基编辑器，并借此成功对水稻主栽品种的4个除草剂靶标基因实现了一次性同时改造。
北京大学生命科学学院贺新强课题组发现miR319及其靶基因PtoTCP20调控毛白杨次生维管组织发育（图）
北京大学生命科学学院 贺新强 课题组 miR319 靶基因PtoTCP20 毛白杨次生维管 组织发育
2020/7/3
2020年6月30日，北京大学生命科学学院贺新强教授课题组在国际知名学术期刊New Phytologist发表了题为“MiR319a-Targeted PtoTCP20 Regulates Secondary Growth via interactions with PtoWOX4 and PtoWND6 in Populus tomentosa”的研究论文。该论文揭示了miR319a的靶基因Pt...
中科院植物所孔宏智研究组与徐桂霞研究组合作，以毛茛科蓝花耧斗菜（Aquilegia coerulea）为材料，利用ChIP-seq技术和生物信息学方法，鉴定了花瓣身份基因AqAP3-3的靶基因。研究发现：AqAP3-3在基因组上结合的保守序列（基序）为CArG box类型，多数位于靶基因启动子区；AqAP3-3与拟南芥AP3共享的靶基因是进化上高度保守的靶基因，主要决定花瓣身份相关的性状；进化上不...
has-miR-155-5p靶基因预测及其生物信息学分析
miR-155-5p 靶基因 生物信息学 信号通路
2018/9/21
深入了解miR-155-5p参与的生命过程和疾病类型,为后续的功能研究提供理论依据。对miR-155-5p进行生物信息学分析发现,已知的其成熟序列在不同物种间高度保守；基因本体论(GO)分析发现其分子功能显著富集于杂环化合物结合、核酸结合等,生物学过程主要富集于细胞大分子代谢、生物调节和有机物代谢等；京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析发现其显著富集于癌症通路、MAPK和FoxO信号通路等。分...
目的:建立一种利用SYBR Green I荧光PCR反应快速、准确、便捷检测副溶血性弧菌的方法。方法:根据副溶血性弧菌的H-NS基因的保守区域设计引物,利用副溶血性弧菌的标准菌株以及12株其他种属的常见致病菌对引物的特异性和灵敏度进行评价。基于该基因利用SYBR Green I荧光PCR检测方法建立标准曲线,确定该检测方法的灵敏度。对用不同浓度的菌液污染的灭菌过的蚬子样品进行检测,确定该方法的的可...
2014年4月11日，中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所何玉科研究组在Plant Cell 杂志上在线发表题为HEAT-INDUCED TAS1 TARGET1 Mediates Thermotolerance via HEAT STRESS TRANSCRIPTION FACTOR A1a–Directed Pathways in Arabidopsis 的研究论文。该研究探索了一类...
研究表明, Hsa-miR-125b在人胃癌耐氟尿嘧啶细胞株BGC823/Fu中表达下降。为进一步探讨hsa-miR-125b在获得性耐药中所起的作用, 文章应用miRbase、靶基因预测软件、Gene Ontology数据库及KEGG数据库对hsa-miR-125b的序列特征、进化保守性、靶基因及功能以及靶基因所参与的信号通路等进行了深入的生物信息学分析。结果显示：has-miR-125b在多个...
文章旨在建立一种种子序列介导的可控遗传操作—microRNA靶基因指纹图谱(MicroRNA targets finger print , MTFP), 用于在基因表达检测中筛选与特定microRNA相关的靶基因。在设定上游种子序列的互补序列和下游锚定序列的基础上添加特殊接头, 通过反转录和特殊二步PCR将microRNA的靶基因扩增; 扩增后的microRNA靶基因在聚丙烯酰胺凝胶电泳中检测其片...
miRNA-9基因家族进化分析及其靶基因预测
miRNA-9 进化 靶基因
2012/7/18
microRNAs(miRNA)是真核生物中一类长度约为21~25个核苷酸的非编码小分子RNA， 在转录后水平调控基因的表达。该文在miRBase中搜索后生动物的mir-9基因序列。47个物种中共搜索到120条mir-9基因序列， 说明mir-9基因家族广泛存在于不同物种中。基因定位显示86%的mir-9基因存在于基因间隔区(IGR)， 多序列比对发现miR-9基因家族成熟序列的第2位到第8位碱基...
染色体上聚集的microRNAs具有更多共同的靶基因
microRNA 前体miRNA(pre-miRNA) 成簇的miRNA(clustered miRNAs) miRNA 基因组学(microRNA genomics)
2008/5/19
miRNAs是一类~22nt、在转录后调节mRNAs表达的内源性非编码RNA。人类miRNA具有成簇聚集于染色体上的特点。文章系统分析了人基因组簇内miRNA各成员的预测靶基因之间的关系，发现簇内miRNA各成员具有更多共同的靶基因， 表明簇内miRNA各成员功能相似。仔细分析簇内miRNA和mRNA的结合位点，发现有两种类型：一种是簇内miRNAs可能竞争性结合同一个靶基因的同一个结合位点；另一...
pMCLacⅠ/neo转基因小鼠靶基因突变检测的新策略
正向选择 LacⅠ靶基因 突变检测
2008/1/24
摘要由于pMCLacⅠ/neo转基因小鼠含有两种不同状态的LacⅠ靶基因,有别于以往所建立的只含有一种靶基因的系统。因此,建立一种能快速、有效地分析这两种靶基因的检测方法,成为该转基因小鼠建立后的又一新课题。通过适当方法将pMCLacⅠ/neo中两种LacⅠ靶基因分开后,采用了新近建立的M9/L正向选择系统进行检测,并用已知的LacⅠ基因突变子作为阳性对照,验证该策略的可行性。实验结果提示,M9/...
ENU诱导带LacZ靶基因的λgt11 DNA突变分子机理的初步研究①Mutation Study of λgt11 DNA with LacZ Induced by ENU
LacZ基因 突变 体外重包装 诱变剂 DNA测序
2008/1/21
摘要采用ENU(乙基亚硝基脲)作用于裸露的 λgt11 DNA，经体外重包装，转染宿主菌 E. coli Y1090，在含底物X-gal，诱导剂IPTG的选择性培养基上铺皿，发现被处理的 λgt11 DNA除了使噬菌体存活率下降外，还出现了靶基因“LacZ”较高频率的突变。其中以二甲基亚砜(DMSO)为溶剂，当存活率分别为3.5×10-3、1.6×10-3和5.5×10-4 时，相应的突变率依次为...
小鼠过氧化物酶体增殖物激活受体α下游新靶基因PTG的克隆
PPARα PTG 基因克隆 基因定位
2007/12/24
摘要 为了进一步研究过氧化物酶体增殖物激活受体α(PPARα)下游靶基因,应用基因芯片技术比较经过氧化物酶体增殖物(peroxisomeproliferators,PPs)处理和未处理鼠肝RNA,获得经PPs处理而上调的一个EST(expressedsequencetag),C3f.用5′RACE法获得其全长cDNA,并命名为PTG.Northern法检测PTG的组织分布.结果显示,在小鼠心脏、肝...