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中国科学院物理研究所从预测模型到真实结构—直接法在蛋白质晶体结构解析中的新应用(图)
蛋白质 晶体结构 解析
2024/3/16
高精度结构预测工具AlphaFold的出现,使得科学家可以通过计算机直接窥探生命基本物质—蛋白质及其复合物的基本构型,这就为蛋白质功能的研究、药物的筛选、以及蛋白质的从头设计,提供了不可估量的帮助。然而,预测从来不可能脱离实验而单独存在,特别是对于一些困难的案例,如超大复合物、长螺旋结构等,如何迈过这万里长征的最后一步,仍然是当前的热门话题。
中国科学院深圳先进技术研究院医工所杨慧研究员团队,与厦门大学萨本栋微米纳米研究院陈宏教授团队合作,在Lab on a Chip 上发表了题为A low-temperature digital microfluidic system used for protein-protein interaction detection的研究,并被选为当期的封底文章 (Back cover)。该团队开发了一种基...
2023年1月,中国科学院大连化学物理研究所生物分子结构表征新方法研究组(1822组)王方军研究员、刘哲益副研究员团队与西南交通大学封顺教授团队合作,利用中国科学院大连化学物理研究所自主搭建的高能紫外激光解离—串联质谱仪器,揭示了质子化氨基酸侧链的正电荷在电喷雾离子化过程中影响蛋白质结构的分子机制,为质谱精确表征蛋白质高级结构提供了参考。
2022年1月11日,生物所微生物蛋白设计与智造创新团队与国内科研单位合作,构建了基于分子动力学模拟与人工智能相结合的蛋白质突变体热稳定性预测策略MDL,并通过该策略成功实现了提升PET塑料降解酶耐热性的分子设计,为酶蛋白的定向分子设计提供了新方法并为塑料的生物降解提供了新材料。相关研究成果以“Computational Design of a cutinase for Plastic Biode...
植物光合系统既要在多云或阴天低光照条件下保持高效捕光和传能效率,又要在正午强光持续照射下避免由此引发的氧化损伤即光保护。植物的光保护功能是将过剩的激发能以热的形式耗散掉。 在自然环境中,太阳光的辐照强度可以在短时间内呈现出十几倍的涨落。当云的阴影遮蔽住受强光辐照的叶片后,叶片还会将光保护状态持续数分钟之久,然后才切换到捕光状态。理论计算表明,由于状态开关切换的滞后效应,可以导致20%的光能损失。2...
近期,中科院高能所蛋白质结构组在疱疹病毒和流感病毒研究领域获得重要进展,研究成果分别发表于国际学术期刊PLoS Pathogens和Nature Communications。卡波氏肉瘤病毒 (KSHV),是一种重要的人类肿瘤病毒,能导致卡波氏肉瘤和B细胞淋巴瘤等恶性肿瘤。ORF57蛋白在病毒复制过程中能稳定病毒转录的信使RNA从而促进病毒复制,是病毒裂解复制过程中的重要功能蛋白。ORF57蛋白半...
中国科学院长春光学精密机械与物理研究所量子点与蛋白质荧光标记研究获得进展(图)
光学精密机械 量子点 蛋白质 荧光标记
2014/10/13
量子点又称半导体纳米晶,是一种由II-IV族或III-V族元素组成的荧光纳米材料,近年来,由于其具有显著的量子尺寸效应、量子限域效应、高荧光量子产率、高光化学稳定性、发射谱线窄和激发谱线宽等优点,使得它们在光电子和生物医学等领域展示出诱人的应用前景,尤其是在生命科学中的应用更受到了广泛的关注。目前,量子点的软化学制备方法有两种:一种是采用胶体化学的方法在有机体系中合成,另一种是在水溶液中合成。水相...
量子点又称半导体纳米晶,是一种由II-IV族或III-V族元素组成的荧光纳米材料,近年来,由于其具有显著的量子尺寸效应、量子限域效应、高荧光量子产率、高光化学稳定性、发射谱线窄和激发谱线宽等优点,使得它们在光电子和生物医学等领域展示出诱人的应用前景,尤其是在生命科学中的应用更受到了广泛的关注。目前,量子点的软化学制备方法有两种:一种是采用胶体化学的方法在有机体系中合成,另一种是在水溶液中合成。水相...
《CdTe/CdS核壳量子点与蛋白质荧光标记》论文入选中国精品科技期刊顶尖学术论文(图)
蛋白质 高等学校化学 光学
2014/10/15
2014年9月末,2014中国科技论文统计结果发布会在北京召开。在公布的首次中国精品科技期刊顶尖学术论文(领跑者5000)评选结果中,我所发光学及应用国家重点实验室的中科院青促会会员曾庆辉等发表于《高等学校化学学报》(2009,30(6):1158-1161)的《CdTe/CdS核壳量子点与蛋白质荧光标记》一文成功入选,这是我所首篇入选的论文。
X-射线晶体学(X-ray crystallography)是解析蛋白质三维结构的主要方法,成功获得可供衍射的晶体是该结构解析方法顺利进行的关键。然而,在目标蛋白质成功结晶之前,多个实验步骤过程均存在失败的可能性,包括蛋白质克隆失败、蛋白质重组表达失败、纯化失败、以及最终获得高精度的、可供衍射的结晶失败等。因此,从蛋白质一级序列信息出发,准确预测目标蛋白质成功通过多个实验步骤的倾向性,将有助于筛选...
研究揭示放电等离子体对蛋白质辐射作用
放电等离子体 蛋白质 辐射作用
2013/8/28
记者日前从中科院合肥物质科学研究院获悉,该院技术生物与农业工程研究所研究员黄青带领的小组在蛋白质辐射作用机理及光谱研究方面取得新进展。相关成果近日以封面文章形式发表于《等离子体过程与聚合物》杂志。
神舟八号飞船空间蛋白质结晶实验
神舟八号 飞船 微重力 空间
2014/4/11
利用德国空间生物实验装置和自主研制的结晶室,在中国神舟八号飞船上进行了14种蛋白质的结晶实验,实验持续16.5d;同时使用相同结晶室在地面开展比对实验.结果表明:12种蛋白质在空间析出晶体,地面有11种;空间析出的6种蛋白质晶体可用于X-射线衍射实验,收得4种晶体的8套同步辐射衍射数据;地面有5种蛋白质晶体可用于X-射线衍射,收得3种晶体的5套同步辐射衍射数据,其中1套不完整.鸡蛋清溶菌酶空间晶体...
在中国科学院外籍青年科学家项目(2009YA1-1)和国家科技部“973”项目(2007CB936000)的支持下,上海应用物理研究所物理生物学实验室外籍青年科学家Daniel Czajkowsky在多聚化Fc-融合蛋白研究和蛋白质与固体表面相互作用机理研究中取得新进展。