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中国科学院遗传发育所揭示翻译起始前核糖体的双向扫描过程(图)
遗传发育所 核糖体 蛋白质稳态
2023/1/8
核糖体准确地识别起始密码子并起始翻译是决定生物体内蛋白质稳态的重要机制。前人研究发现真核生物翻译前起始复合物(Preinitiation complex,PIC,包含核糖体小亚基和多种起始因子)通常从最靠近mRNA的5′帽的AUG起始翻译。如果在报告基因起始密码子AUG(annotated AUG,aAUG)的上游插入另一个AUG(upstream AUG,uAUG),则会降低aAUG处的翻译起始...
厦门大学药学院Dieter Wolf教授团队在Cell子刊发表论文揭示翻译起始因子eIF3的新功能和新机制(图)
厦门大学药学院 Dieter Wolf 教授 翻译起始 因子eIF3 新功能 新机制
2020/7/1
药学院Dieter Wolf教授团队在蛋白质翻译及线粒体健康研究方面取得新进展,相关研究成果以“eIF3 associates with 80S ribosomes to promote translation elongation, mitochondrial homeostasis and muscle health”为题发表于国际顶级学术期刊Molecular Cell。蛋白质翻译是机体维持...
近日,复旦大学基础医学院生物化学与分子生物学系暨代谢分子医学教育部重点实验室党永军课题组在真核翻译起始的调控机制上取得重要进展,揭示了去泛素化酶USP9X调控蛋白翻译过程的分子机制。相关研究成果于12月8日以《USP9X通过去泛素化真核翻译起始因子4A1调控翻译效率》(USP9X Controls Translation Efficiency via Deubiquitination of Euk...
利用抑制削减杂交法筛选日本血吸虫雌雄虫差异基因,从中获得真核翻译起始因子5基因(eIF5)的表达序列标。对该序列进行生物信息学分析:对其5′端进行电子延伸,获得含完整开放阅读框的cDNA序列(AY686501)。将其亚克隆到表达载体pET-28c,进行重组表达。免疫保护效果实验表明,重组表达蛋白具有显著抑制血吸虫卵在寄主肝脏中的沉积效果。
基于支持向量机识别真核生物DNA中的翻译起始位点
支持向量机(Support vector machine) 翻译起始位点(Translation initiation site) 数据优化(Data optimization) 敏感度(Sensitivity)
2008/3/7
翻译起始位点(TIS)的识别是真核生物基因预测的关键步骤之一,近年来一直得到研究人员的高度重视。基于TIS附近序列的统计特性,出现了一些辨识TIS的判别方法,但识别精度还有待进一步提高。针对传统支持向量机(SVM)方法中存在的不足,提出了基于数据优化法的SVM,它通过其它统计学模型优化训练数据集,进而提高分类器的辨识精度。实验结果表明基于数据优化法的SVM分类器在翻译起始位点的辨识上可获得...
霍乱毒素A基因内部翻译调控元件具有翻译起始功能
霍乱毒素 操纵子 翻译调控 体外翻译
2008/2/5
摘要通过大肠杆菌体外转录-体外翻译系统,证明霍乱毒素A基因内部的翻译调控元件具有翻译起始功能,且其翻译起始效率较ctxA基因高得多。当ctxA的起始密码突变时,从该元件起始的翻译效率下降,说明基因内翻译起始效率受ctxA翻译起始的调控。结果进一步证实了霍乱毒素A、B亚基比例表达调控的翻译弱化-翻译偶联机理。
食蟹猴疟原虫 (Plasmodium cynomolgi)中一个真核翻译起始因子4A(eIF-4A)同源蛋白的cDNA克隆、表达和ATP酶活性测定(英文)
真核翻译起始因子4A(eukaryoticinitiationfactor4A eIF-4A) RNA解旋酶 ATP酶 食蟹猴疟原虫(Plasmodiumcynomolgi)
2007/12/24
摘要 真核翻译起始因子 4A(eukaryoticinitiationfactor 4A ,eIF 4A)是DEAD盒蛋白家族的ATP依赖性的RNA解旋酶类中的一个原型成员 .它在真核细胞的蛋白质合成的起始过程中起着关键性作用 .通过PCR扩增和放射探针杂交相结合的方法筛选食蟹猴疟原虫 (Plasmodiumcynomolgi)的cDNA文库 ,克隆了一个eIF 4A同源蛋白的完整cDNA序列 ,...
翻译起始区二级结构对荧光素酶基因在COS-7细胞中表达效率的影响
翻译起始区 荧光素酶 二级结构 表达
2007/12/20
摘要 在荧光素酶基因起始密码子ATG下游插入 4种串连重复的密码子 (6×ATT ,3×ATT ,6×GCC与 3×GCC) ,得到具有不同二级结构的翻译起始区 (translationinitiationregion ,TIR) ,以研究TIR二级结构对该基因在COS 7细胞中表达的影响 .Northern印迹结果显示 ,4种重组子mRNA的转录水平没有显著差异 ,而Western印迹与酶活性检...
m RNA5′端不同位置的二级结构对原核生物翻译起始的影响
翻译起始 二级结构 翻译起始区(TIR) E.coli
2007/12/19
摘要 一个 2 1 bp的序列插入 B50中的人 PCNA- Lac Z′融合蛋白 m RNA的 SD序列的上游 1 1 bpH ind 切点处 ,构成正、反向插入的两个重组质粒 B50 il、B50 i2 .通过计算机程序对 m RNA二级结构的模拟分析 ,B50 il的插入序列在翻译起始区 (TIR)前形成一个发夹结构 ,但不影响 TIR的二级结构 ;B50 i2的插入序列在 TIR 5′端形...