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分子系统生物学研究中心
分子系统 生物学 研究中心
2023/4/9
分子系统生物学研究中心面向人口健康和现代农业两大国家战略需求,依托生物信息学、蛋白质组学、结构生物学、进化遗传学、系统生物学等多学科交叉研究方法,从遗传网络及其关键元件解析的角度,着重开展多种组学数据的分析方法开发与数据挖掘,生物大分子组装、修饰及动态变化,生物系统的稳定性调控,类器官制造与器官分化机制解析等生命科学领域前沿科学问题的研究。中心目前有6个研究组,研究队伍包括获“国家杰出青年科学基金...
中国科学院动物研究所客座研究员杨子恒在Nature Reviews Genetics发表有关分子系统遗传学的综述文章
中国科学院动物研究所 客座研究员 杨子恒 Nature Reviews Genetics 发表 分子系统遗传学 综述文章
2012/5/2
动物研究所计算与进化生物学研究中心客座研究员、英国皇家科学院院士杨子恒日前在最新一期的Nature Reviews Genetics 上发表题目为“Molecular phylogenetics: principles and practice”的文章。
蝗总科部分种类16S rDNA的分子系统发育关系
蝗总科 16S rDNA 分子系统发育
2008/2/1
摘要 摘 要:将自测的我国直翅目蝗总科8科8个种和从互联网GenBank中
检索到相关物种的线粒体基因组16S rDNA序列片段进行同源性比较,计算核苷酸使用频率,并构建分子系统树。在获得的480 bp的序列中,A+T约占70.7%,G+C为29.3%,颠换取代(transversion)的速率大于或接近转换取代(transition)的速率,其中188个核苷酸位点存在变异。研究结果表明:在直翅...
用桑蚕(包括不同生态地理品种59个及野桑蚕)和桑属植物(包括12个种和2个变种)两类截然不同的材料,探讨了分子系统学研究中RAPD分子位点数与遗传差异信息可靠性间的关系。发现:(1)所分析的位点数多少与所能提供系统信息的量及可靠性之间有明显的关系;(2)当位点数在20以下时,得到的遗传差异的结果极不可靠,随着位点数的增加所提供的信息量及可靠性增加。当位点数超过70个时,所提供的信息可靠性趋于稳定;...
几种鳄分子系统发生的探讨
鳄 ND4基因序列 Cyt b基因序列 分子系统发生
2008/1/4
百年来关于扬子鳄的分类学位置存在着很多争议,本文测得扬子鳄、暹罗鳄和湾鳄的mtDNAND4和Cytb基因,并从GenBank中获得密西西比鳄和海龟的ND4基因和Cytb基因相应片段.用ClustalX1.8进行对位排列,以海龟为外群构建分子进化系统树.结果显示:在鳄类动物中,扬子鳄与密西西比鳄的亲缘关系最近,两者ND4基因序列碱基差异为20.68%,而Cytb基因序列碱基差异为14.43%;但扬子...
DNA在鸟类分子系统发育研究中的应用
鸟类 分子系统发育 线粒体DNA 核DNA
2007/12/20
鸟类分子系统发育研究中常用的DNA技术有DNA杂交、RFLP和DNA序列分析等。DNA杂交技术曾在鸟类中有过大规模的应用,并由此诞生了一套新的鸟类分类系统。在鸟类的RFLP分析中,用的最多的靶序列是线粒体DNA。DNA序列分析技术被认为是进行分子系统发育研究最有效、最可靠的方法。在DNA序列分析中,线粒体基因应用最广泛,但由于其自身的一些不足,近年来,不少学者把目光投向了核基因,将线粒体基因和核基...
摘要:在无脊椎动物的分子系统学研究中,作为对线粒体DNA信息的重要补充,人们越来越多地采用核DNA的核糖体内转录问隔区(1TS)作为分子标记。本文介绍了ITS的组成和性质.并对近年来ITS在无脊椎动物分子系统学研究中的应用进行了总结,同时提出并讨论了目前在该领域存在的一些问题。
DNA分子系统学在爬行动物中的应用
DNA 分子系统学 爬行动物 应用
2007/8/5
摘要:爬行动物因其在脊椎动物中具有承上启下的作用,对其进行系统学研究,了解它们的进化关系显得尤为重要。本文从DNA杂交、DNA指纹、RFLP、RAPD及测序等五个方面对爬行动物的DNA分子系统学研究工作进行了综述,对其中的一些问题进行了讨论。
摘要:蓝氏贾第虫是广为关注的源真核生物,有人认为它处在生物进化中原核生物与真核生物间的过渡阶段,对其系统发育的研究具有重要的生物学意义。本研究通过对不同地域和/或宿主来源贾第虫虫株的核糖体基因(rDNA)的内转录间隔区(ITS1和ITS2)及5.8S rDNA序列进行扩增、克隆及序列测定,用NJ法构建分子系统树进行系统学分析。结果显示:所测得10个虫株的序列经用DNAMAN软件比对后,有2个虫株的...
从细胞色素b基因序列探讨笛鲷属的分子系统发生关系
笛鲷属 线粒体DNA 细胞色素b基因 分子系统发生
2007/8/5
摘要:测定了9种中国南海的笛鲷属鱼类的细胞色素b基因的部分序列,结合来自GenBank中1种分布于菲律宾和9种分布于美国大西洋的笛鲷属鱼类的相应同源序列,用邻接法和最大简约法构建分子系统树。结果显示:红鳍笛鲷(L. erythropterus)与红笛鲷(L. sanguineus)之间的同源序列碱基差异百分率只有0.32%,支持二者是同种异名的观点;中国南海的笛鲷属鱼类间的平均碱基差异要高于美国大...
题目:基于28S rRNA D2序列的内茧蜂亚科的分子系统发育
作者:陈学新1, 朴美花1, J. B. WHITFIELD2, 何俊华1
摘要:首次利用同源28S rRNA D2基因序列对内茧蜂亚科Rogadinae (昆虫纲Insecta:膜翅目Hymenoptera:茧蜂科Braconidae)进行了分子系统学研究。本研究从95%~100%乙醇浸渍保存的标本中提取基因组DNA并扩增了10种...
题目:基于16s rRNA序列的新蚤属二齿新蚤种团部分种类的分子系统发育关系
作者:鲁亮,吴厚永
摘要:通过比较线粒体基因组16s rRNA基因片段的差异,研究了分布于我国的二齿新蚤种团(bidentatiformis group)7种新蚤的分子系统发育关系,以斯氏新蚤种团的特新蚤作为外群。结果显示,其中5个种 (Neopsylla bidentatiformis、N. mana、N. ples...
棉铃虫18S核糖体RNA基因的序列分析及其分子系统学
18S rDNA 棉铃虫 分子系统学
2007/8/5
题目:棉铃虫18S核糖体RNA基因的序列分析及其分子系统学
作者:王瑛, 陈晓峰, 刘伟, 周红, 章赵珩
摘要:克隆并分析了鳞翅目棉铃虫Helicoverpa armigera (Hübner)18S核糖体RNA基因(18S rDNA)的全序列,将该序列与鞘翅目、膜翅目、同翅目、双翅目、捻翅目和弹尾目各一种昆虫的同源保守区进行了比较。序列分析结果显示:鳞翅目和双翅目昆虫在18S rDN...
题目:从12S rRNA基因和Cyt b基因部分序列研究13种猫科动物的分子系统关系
作者:郑 涛 费荣梅 吴孝兵
安徽师范大学生命科学学院,芜湖241000
摘要:为探讨中国猫科动物(Felidae)的系统发生关系,本文对中国产13种猫科动物的12S rRNA基因 (约371bp)和细胞色素b基因 (Cyt b) 部分序列(约355bp)进行了分析,并采用“最大简约法”和“最大似然法...
核糖体RNA基因在海洋动物分子系统学中的应用
2007/7/28
期刊信息
篇名
核糖体RNA基因在海洋动物分子系统学中的应用
语种
中文
撰写或编译
撰写
作者
毕相东,侯林,刘晓惠,王雪,刘芳,闫晗,杨雷
第一作者单位
辽宁师范大学生命科学学院
刊物名称
应用与环境生物学报
页面
11(6):779-783
出版日期
2005年
12月
日
文章标识(ISSN)
1006-687X
相关项目
中国卤虫早期胚胎发育相关基因的研究