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华中农业大学精准营养与代谢团队揭示哺乳动物假基因的演化和功能（图）
代谢 哺乳动物 基因 演化
2022/11/22
2022年11月8日，华中农业大学生命科学技术学院、生物医学与健康学院精准营养与代谢团队陈振夏课题组在国际学术期刊Genome Biology在线发表最新研究成果，该研究系统地分析了人和小鼠基因组中假基因的演化历程、表达模式、在发育过程中的转录调控、翻译活性以及在癌症中的功能。该研究鉴定到一批参与复杂调控网络并有潜力作为癌症生物标志物的假基因，为后续表型和机制研究奠定基础。
中国科学院西双版纳热带植物园揭示了具有寄生习性类群的质体基因组发生了快速的演化，表现在NDH基因和质体基因组结构稳定性，为理解寄生植物质体基因组演化提供了一个很好例证。
中国科学院西双版纳热带植物园生物多样性研究组团队和合作者选取了半寄生类群马先蒿属（Pedicularis L.）中的单系类群斗叶组（sect. Cyathophora H.L.Li）为研究对象，借助系统发育比较分析方法来解析NDH基因的演化。
2021年1月20日，中国医学科学院基础医学研究所余佳研究组、中国科学院动物研究所张勇研究组、中国医学科学院血液病医院（血液病研究所）石莉红研究组在Cell Press细胞出版社旗下期刊Developmental Cell上在线发表了题为“Genome-wide analysis of pseudogenes reveals HBBP1's human-specific essentiality ...
线粒体假基因(nuclear mitochondrial pseudogenes, NUMTs)是指由生物体的线粒体基因组转移至核基因组内的DNA片段。由于其独立进化的特点， NUMTs在用于系统发育分析时是一把双刃剑。我们用基于PCR扩增的方法研究了对叶榕Ficus hispida上两姐妹种榕小蜂Philotrypesis pilosa和Philotrypesis sp.中起源于线粒体Nad1...
一个巴西橡胶树钙调素基因假基因的识别
巴西橡胶树 钙调素基因 假基因
2009/5/25
以巴西橡胶树( Hevea brasiliensis) 基因组DNA 为模板, 根据胶乳钙调素基因HbCaM 序列设计引物,利用PCR 方法克隆获得了1 319 bp 和447 bp 的两个DNA 片段。序列分析表明, 1 319 bp 的DNA 长片段为胶乳钙调素基因HbCaM 的DNA 片段, 含有两个外显子( 77 bp 和373 bp) 和1 个内含子( 869 bp) , 包含了HbCa...
ITS 假基因对栎属系统学研究的影响及其对分子系统学研究的启示
ITS 假基因 栎属 分子系统学FONT
2009/4/22
核糖体rDNA ITS 是被子植物系统发育研究中应用最广泛的分子标记之一。以前人们认为同一物种中的ITS 序列因致同进化而使不同拷贝高度一致, 在分子系统学研究中常以ITS1-5 .8S-ITS2 序列作为构建系统进化树的基础。近年来, 在对一些被子植物的研究中发现这段序列在同一物种中具有多态性, 有些拷贝中的5 . 8S 区不具编码功能, 人们把含有不具编码功能5 . 8S 区的ITS1-5 ....
假基因HMGA1L2在甲状腺肿瘤中的表达
假基因HMGA1L2
2008/1/11
摘要应用RT-PCR技术检测假基因HMGA1L2在50例良、恶性甲状腺病变中HMGA1L2 mRNA的表达。结果显示HMGA1L2 mRNA在12例结节性甲状腺肿、9例甲状腺腺瘤和15例甲状腺乳头状癌中的阳性表达率均为100%, 而在14例甲状腺滤泡癌中的阳性率为35.7%, 与前3者差异有显著性。该研究首次报告了假基因HMGA1L2 mRNA在良、恶性甲状腺病变中的表达, 并且提示其在甲状腺滤泡...
人多肽链延伸因子1α四个反转录假基因的鉴别与定位
多肽链延伸因子1α 反转录假基因 定位
2008/1/7
人多肽链延伸因子1α基因EEF1A是一个在蛋白质合成过程中起重要作用的看家基因。通过对已有GenBank、GDB等数据库的综合分析,鉴别了4个人类多肽链延伸因子1α基因的反转录假基因,并分别将其精细定位于4q2 5、7p15-21、9q34和19q13上。
青蟹线粒体COI假基因的分离和特征分析
青蟹 细胞色素氧化酶亚基I基因 线粒体假基因
2007/12/20
摘要
线粒体DNA标记在遗传结构和系统进化研究中得到广泛应用，然而核假基因的存在对此有很大威胁。本文以中国东南沿海的青蟹(Scylla paramamosain)为研究对象，利用线粒体COI基因的通用引物和特异性引物进行扩增，分别得到34个假基因（nuclear mitochondrial pseudogenes, Numts）和5个线粒体COI基因序列。在所获得的34个假基因中共定义了29种单...
动物线粒体假基因的识别及其在进化生物学中的应用
线粒体假基因 进化生物学
2007/8/5
摘要：在真菌、昆虫、无脊椎动物和脊椎动物等许多分类单元中,都已发现mtDNA序列的核转座现象。在PCR扩增时,往往同时扩增出mtDNA和细胞核中线粒体假基因(Numts),Numts混淆系统发育和群体遗传研究,得出错误的结果。本文综述了Numts的检查和避免的方法,以及在进化生物学研究中的应用进展。
摘要：本研究以中花10号水稻为材料，利用PCR技术扩增并克隆10kDa富硫醇溶蛋白基因的成熟肽编码区。对扩增产物的核苷酸序列分析表明：本扩增产物长 380bp；与 Masumura等人[1] 发表的序列相比，有94．5％的同源性，与我们以前发表的中花10号水稻10kDa富硫醇溶蛋白基因的序列相比，有99．5％的同源性。本扩增片段第150位与151位间的单碱基（T）插入导致了该片段编码区的移码突变...
生物谷博客报道：Xist基因的非编码性RNA是真哺乳亚纲哺乳动物(eutherian mammal)中X染色体失活过程的关键性起始物，然而它的精确功能和起源仍然不清楚。尽管Xist在真哺乳亚纲保守性较好，但在其他的哺乳动物动物中还未找到它的同源物。作者显示Xist至少部分上是从一个编码蛋白的基因进化而来的，而Xist原始类型(proto-Xist)的蛋白编码功能的丢失与Xist两端存在着四个蛋白编...