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中国科学院广州分院华南植物园在核质冲突现象与动植物进化历史研究获进展（图）
核质冲突 动植物进化 分子系统
2023/11/7
在分子系统发育研究中，基于核基因和细胞质基因（叶绿体或线粒体）构建的系统发育树常常产生不同的枝形拓扑结构，该现象被称为核质冲突（cytonuclear discordance）（图）。产生核质冲突的机制不一而同，但最常见的是基因渐渗（introgression）和不完全谱系分选（incomplete lineage sorting）。前者的原理是杂交后代物种和亲本物种之一进行不断回交，以达到其核基...
中国科学院植物研究所等揭示北极植物区系的进化历史（图）
北极植物 区系 进化历史
2023/8/4
北极地区虽仅约占全球陆地面积的5%，却是巨大的碳库和甲烷库，在全球气候系统中具有重要作用。北极苔原（树线以北）是相对年轻的新型植被类型，栖息着能适应生长季节短、年均温较低和极端季节性气候等恶劣环境的独特生物类群。过去50年以来，北极地区的变暖速度是全球平均速度的3-4倍。该地区的植被组成、密度和分布发生了较大变化。然而，北极植物区系的进化历史仍不清楚。
中国科学院植物所等揭示北极植物区系的进化历史（图）
北极植物 进化历史 气候系统
2023/8/6
北极地区虽仅约占全球陆地面积的5%，却是巨大的碳库和甲烷库，在全球气候系统中具有重要作用。北极苔原（树线以北）是相对年轻的新型植被类型，栖息着能适应生长季节短、年均温较低和极端季节性气候等恶劣环境的独特生物类群。过去50年以来，北极地区的变暖速度是全球平均速度的3-4倍。该地区的植被组成、密度和分布发生了较大变化。然而，北极植物区系的进化历史仍不清楚。
科学家揭示北极植物区系的进化历史
北极植物区 被子植物 甲烷
2023/7/28
2023年7月18日，中国科学院植物所研究员王伟团队联合北华大学教授夏富才等在《自然-通讯》上发表最新研究，揭示了北极植物区系的起源和形成过程。
中国科学院植物研究所王伟研究组及合作者通过整合32个被子植物类群（共3,626种）的系统发育、分化时间和生物地理等分析结果，发现外来迁入和本地多样化的变化趋势基本一致；现代北极植物区系的成分最早可追溯至晚中新世的早期（约10–9 Ma），外来迁入和本地多样化速率在上新世-更新世之交（约2.6 Ma）快速增加，并在更新世中期以来（约1.0–0.7 Ma）急剧降低，该动态过程与北极地区的地质、古气候和...
中国科学院植物所科研人员揭示北极植物区系的进化历史（图）
进化历史 生物类群 被子植物
2023/8/17
北极地区虽仅约占全球陆地面积的5%，但是一个巨大的碳库和甲烷库，在全球气候系统中起着至关重要的作用。北极苔原（树线以北）是一种相对年轻的新型的植被类型，栖息着能适应生长季节短、年均温较低和极端季节性气候等恶劣环境的独特生物类群。过去50年以来，北极地区的变暖速度是全球平均速度的3–4倍，该地区的植被组成、密度和分布发生了很大变化。但是，北极植物区系的进化历史仍然不清楚。
近日，中国科学院昆明植物研究所科研人员与华盛顿大学Richard Olmstead展开合作，对亚洲醉鱼草属植物进行了全面的取样和物种倍性信息测定，同时利用浅层测序数据，对亚洲醉鱼草属植物每个样品进行了叶绿体全基因组组装、nrDNA序列构建、低拷贝核基因构建以及单核苷酸多态性（SNP）的挖掘。本研究通过核质冲突、基因树不一致、贝叶斯聚类等分析方法结合物种倍性信息，推测了亚洲醉鱼草属植物复杂的的网状演...
中国科学院植物研究所科研人员通过进化生物学和生态学等多学科方法的整合分析，揭示了全球杜鹃花属植物的时空进化历史和辐射进化机制，为世界性植物大属的进化研究提供了一个典型例证，并表明谱系转录组学在植物生命之树重建中是一个非常高效的方法。
中国科学院植物研究所科研人员揭示全球松属植物的时空进化历史及机制（图）
松属植物 时空进化历史
2022/11/11
物种多样性从两极到赤道逐渐增加，呈现的纬度多样性梯度是最普遍的生物分布式样。但是，在北半球松柏类的大部分物种分布于中纬度山地。形成该独特分布的机制是什么？分布于中纬度的物种与高纬度和低纬度的物种相比，谁的起源更古老？中纬度山地是松柏类植物的进化博物馆（evolutionary museum）还是进化摇篮（evolutionary cradle）？
泸水大钟花的发现为大钟花属进化历史提供新见解（图）
泸水 大钟花 属进化历史 新见解
2020/8/3
大钟花属（Megacodon (Hemsl.) H. Smith）是中国-喜马拉雅地区的特有属，共有两个物种，其中大钟花分布在东喜马拉雅-横断山的高海拔区域，而川东大钟花分布在川东-鄂西一带（图1），且其野外居群非常稀少，甚至一度被认为濒临灭绝。而调查发现稀有植物的新分布点往往有重要的科研价值。近年来，昆明植物研究所青藏高原-喜马拉雅植物多样性形成与演变团队孙航研究组研究人员在同行提供的线索下，不...
中国科学院植物研究所合作揭示活化石银杏的种群进化历史（图）
中国科学院植物研究所 活化石 银杏 种群 进化历史
2019/9/18
中国科学院植物研究所葛颂团队2016年首次与浙江大学傅承新-赵云鹏团队、华大基因研究院三方合作联合发表了银杏基因组草图。此次三个团队再次合作，通过对全球采样的545个银杏基因组重测序揭示了活化石银杏种群进化历史、避难所及进化潜力。该研究在染色体水平HiC基因组组装和分析的基础上，利用国产BGISEQ-500二代测序仪，对采自全球51个种群545棵银杏大树进行了全基因组测序，产出了44Tb的海量数据...
中国科学院昆明植物研究所植物区系进化历史研究取得新进展（图）
中国科学院昆明植物研究所 植物区系 进化历史
2019/9/10
中国科学院昆明植物研究所植物经典分类与植物多样性团队李嵘课题组以中国植物多样性最为丰富的地区云南为例，结合该地区野生被子植物的地理分布及其系统发育关系，探讨了分类群丰富度（taxonomic richness）、系统发育多样性（phylogenetic diversity）及系统发育多样性残差（residual）的空间分布格局，在此基础上，融合历史生物地理学信息，揭示了云南被子植物区系的形成原因。...
中国科学院昆明植物所植物区系进化历史研究取得新进展（图）
昆明植物所 植物区系 进化历史 多样性
2019/9/19
植物区系（flora）是某一特定地区生长着的全部植物种类，它是人类衣、食、住、行的源泉，也是人类赖以生存的物质基础。植物区系研究在植物种类清查、生物资源开发、环境保护、国民经济建设等方面起着至关重要的作用。
物种分歧时间估算一直是生命之树（Tree of Life）进化历史研究中具挑战性的热点工作。分析过程通常涉及：核苷酸序列数据的系统发育分析；在重建的系统发育树的基础上，基于化石信息校准内部节点时点区间。在现有的绝大多数利用基因或基因组数据开展的工作中，来自化石或生物地质事件的外在时间校准信息多由研究者直接赋予某具体的进化树内部节点，存在一定的主观性。同时，校准信息的具体时间统计分布往往不容易确定，...
浙江大学生命科学研究院周琦实验室在Nature Ecology and Evolution杂志发文阐明天堂鸟性染色体的进化历史（图）
浙江大学生命科学研究院 周琦 天堂鸟 性染色体 进化历史
2019/10/9
2019年4月1日，浙江大学生命科学研究院周琦实验室在Nature Ecology and Evolution (自然•生态与进化)在线发表题为”Dynamic evolutionary history and gene content of sex chromosomes across diverse songbirds”的研究论文。周琦实验室与瑞典自然历史博物馆合作，通过基因组学的...