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血液单细胞分子图谱首个共享数据库发表（图）
单细胞分子 共享数据库 北京协和医学院
2023/4/20
2022年8月3日，中国医学科学院血液病医院（中国医学科学院血液学研究所）程涛教授、高欣副研究员合作在Nucleic Acids Research《核酸研究》在线发布了题为“ABC portal: a single-cell database and web server for blood cells”（ABC数据库：一个对血液单细胞数据进行交互式探索和再分析的数据库）的研究论文。该研究基于以往...
2022年10月14日，中国医学科学院皮肤病医院（皮肤病研究所）陆前进团队在BMJ子刊Annals Of Rheumatic the Diseases《风湿病年鉴》在线发表了题为“The global epidemiology of systemic lupus erythematosus: a comprehensive systematic analysis and modelling stu...
2022年10月28日，中国医学科学院系统医学研究院/苏州系统医学研究所（简称“系统所”）陈东升课题组在Nucleic Acids Research《核酸研究》发表了题为“SPEED: Single-cell Pan-species atlas in the light of Ecology and Evolution for Development and Diseases”（SPEED数据库：...
中国科学院单细胞转录组数据揭示脑皮层细胞类型在鲸类与人类之间高度保守（图）
单细胞转录 脑皮层细胞 鲸类 视觉感知
2023/3/18
从距今约5550万年前的陆地到如今海洋生境的转变，对于鲸类而言无疑是重塑了大脑。鲸类大脑集早期哺乳动物的保守特征与独有衍生特征于一身。鲸脑内各个细胞类型高效协同工作以维持其独特的认知、运动、听觉及视觉感知等过程。细胞水平的转录组学可以系统地表征脑内细胞的多样性，实现神经科学研究范式由重视细胞解剖向细胞类型分子分类过渡。2023年3月17日，中国科学院深海科学与工程研究所联合青岛华大基因研究院等，在...
中国科学院广州分院单细胞转录组数据揭示脑皮层细胞类型在鲸类与人类之间高度保守
单细胞转录 脑皮层细胞 分子分类
2023/3/20
从距今约5550万年前的陆地到如今海洋生境的转变对于鲸类而言无疑重塑了大脑，鲸类大脑集早期哺乳动物的保守特征与独有衍生特征于一身。鲸脑内各个细胞类型高效协同工作以维持其独特的认知、运动、听觉及视觉感知等过程。细胞水平的转录组学可以系统地表征脑内细胞的多样性，实现神经科学研究范式由重视细胞解剖向细胞类型分子分类进行过渡。2023年3月16日，中国科学院深海科学与工程研究所联合青岛华大基因研究院等科研...
天津工业生物所在构建植物UDP-糖基转移酶数据库方面取得新进展（图）
植物UDP 糖基转移酶 分子识别
2023/7/7
糖基化作为生命体最重要的后修饰作用之一，可以极大提高糖基底物的生物活性，广泛应用于新药研发、分子识别、细胞定位、增强抗逆性等方面。植物UDP-糖基转移酶（UGT）是催化植物天然产物糖基化修饰的关键酶，能够赋予植物天然产物独特的生理活性，以及重要的药用价值。然而，目前相关数据库收录的UGT序列尚未满足日益增长的科研与应用需求，对UGT的功能性鉴定和底物识别机制研究也只是冰山一角。
天津工业生物所构建首个基于图数据库的大肠杆菌调控代谢图谱（图）
图数据库 大肠杆菌 无服务器架构
2023/2/7
细胞中的代谢调控非常复杂，一个特定的细胞功能往往由一系列不同类型的代谢途径调控相互作用决定。例如，氨基酸的代谢通常由不同类型的相互作用组成的反馈或前馈回路来调节。由于缺乏对这些调控关系的全局性认识，对细胞进行代谢重塑时常触发胞内复杂调控而无法达到预期目标，这是目前细胞工厂构建中的存在的共性问题。通常不同类型的调控数据散落在各个不同的数据库，生物学家很难通过仅关注与所研究的代谢物/蛋白质密切相关的一...
近日，由中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）国家基因组科学数据中心研发的全球生物数据库目录Database Commons正式发布。该研究内容以“Database Commons: A Catalog of Worldwide Biological Databases”为题在国际学术期刊Genomics Proteomics & Bioinformatics 在线发表。
由上海技物所空间生命科学仪器团队研制的生物技术和生命生态科学实验系统于2022年7月24日随问天实验舱成功发射。上述系统是我国空间站生命科学领域的核心实验平台，以构建国家空间实验室、满足空间生命科学研究的迫切需求为目标，形成了“原位观测+生命支持+精细操控”为特色核心技术链的空间特殊环境下生命科学仪器技术系统化方案。
近日， 西北工业大学生命学院卢慧甍副教授课题组研发首款昆虫嗅觉受体结构与功能预测的数据库（iORbase），相关研究成果以“iORbase: a database for the prediction of the structures and functions of insect olfactory receptors”为题发表在Insect Science期刊，该期刊是中科院1区TOP期刊，...
中国科学院自动化研究所类脑认知智能研究组在Scientific Data上，发表了题为N-Omniglot, a large-scale neuromorphic dataset for spatio-temporal sparse few-shot learning的研究论文，提出了用于时空稀疏小样本学习的大规模神经形态数据集——N-Omniglot，为脉冲神经网络的学习与训练提供了更具挑战性的...
近十多年来，单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）不断发展和普及，同时数以千计的生物信息学/计算生物学工具被开发出来，以解决诸如数据获取（包括量化、比对、拼接等）、数据清洗（包括质控、过滤、归一化、整合等）、细胞分配（包括聚类、排序、分类等）、基因识别（包括基因网络、差异表达、标记基因等）等scRNA-seq数据处理和分析步骤。尽管其中大部分软件经过同行评议且在其论文中也彰显了优点，但它们自己...
2022年12月，国家标准化管理委员会下达2022年第三批推荐性国家标准计划，由中国科学院微生物研究所马俊才团队牵头起草的国家标准计划“微生物资源机构数据管理及发布规范”正式获批立项。
中国科学院生态环境研究中心魏源送研究组基于高分辨质谱和数据挖掘方法揭示了污泥厌氧发酵过程溶解性有机物的反应特性，相关成果近期发表在Water Research （2023, 229, 119488）。
