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中国科学院科学家描绘小鼠胆汁淤积损伤与再生的时空转录图谱（图）
图谱 遗传学 细胞
2024/4/19
2024年4月16日，中国科学院分子细胞科学卓越创新中心惠利健团队联合杭州华大生命科学研究院研究人员，在《自然-遗传学》（Nature Genetics）上发表了题为A spatiotemporal atlas of cholestatic injury and repair in mice的研究成果。该研究以细胞水平的空间分辨率描绘了胆汁淤积与再生过程中的损伤响应和微环境信号的时空动态变化特征，...
Whole-body regeneration of planarians is a natural wonder but how it occurs remains elusive. It requires coordinated responses from each cell in the remaining tissue with spatial awareness to regenera...
科学家构建卵黄囊细胞图谱揭示其在人类早期发育过程中的功能
卵黄囊细胞图谱 人类 早期发育
2024/1/15
胚胎外卵黄囊（yolk sac，YS）可为发育中的胚胎提供营养支持和氧气，并生成第一批血液和免疫细胞，但其他功能仍然未知。英国威康桑格研究所等合作绘制卵黄囊细胞图谱，揭示人类早期发育过程中卵黄囊的功能。该研究成果于近日发表在《Science》杂志上，题为：Yolk sac cell atlas reveals multiorgan functions during human early deve...
科学家揭示小鼠胚胎器官形成初期的时空转录图谱
小鼠胚胎 器官形成初期 时空转录图谱
2024/1/16
胚胎正常发育需要基因表达的时空调控。单细胞技术的发展使研究早期胚胎调控具有更高的分辨率，如对小鼠胚胎发育过程中多数细胞状态的详细分子定义。德国马克斯·普朗克分子遗传学研究所等机构揭示小鼠胚胎器官形成初期的时空转录图谱。该研究成果于近日发表在《Nature Genetics》杂志上，题为：Spatiotemporal transcriptomic maps of whole mouse embryo...
科学家构建兔发育的形态学和分子图谱
兔发育 形态学 分子图谱
2024/1/16
由于小鼠的易实验性和强遗传性，其一直是生物医学研究中使用广泛的动物模型。但是，胚胎学研究发现，小鼠早期发育的许多方面与其他哺乳动物不同，从而使有关人类发育的推论复杂化。英国剑桥大学等研究团队合作构建了兔发育的形态学和分子图谱。该研究成果于近日发表在《Nature Cell Biology》，题为：An atlas of rabbit development as a model for singl...
科学家绘制成人乳腺组织单细胞和空间基因组图谱
成人 乳腺组织 单细胞 空间基因组图谱
2024/1/16
成年人类乳腺组织主要由错综复杂的上皮导管和小叶组成，它们被嵌入在结缔组织和脂肪组织中。过去研究大多集中在上皮组织，非上皮细胞仍未得到充分研究。美国德克萨斯大学安德森癌症中心研究团队绘制成年人类乳腺细胞图谱。该研究成果于近日发表在《Nature》杂志上，题为：A spatially resolved single-cell genomic atlas of the adult human breas...
首个东亚人群炎症性肠病基因图谱绘制完成（图）
东亚人群 遗传学 克罗恩病
2023/6/19
近日，同济大学附属第十人民医院教授刘占举团队联合美国学者黄海亮、广州医科大学附属三院教授李明松在《自然-遗传学》发表论文，阐述了东亚人群与欧洲人群在炎症性肠病（IBD）相关基因位点上的差异，为疾病治疗的本土化与精准化提供了理论依据和指引。
科学家开发时空转录组学并在亚细胞水平揭示RNA动力学图谱
时空转录组学 亚细胞水平 RNA动力学图谱
2024/1/16
细胞转录组的时空调节对细胞内蛋白质的正常表达及细胞功能至关重要。然而，由于现有转录组学方法不能同时获得时间和空间数据。美国麻省理工学院研究团队开发了时空转录组测序技术，并应用于探究RNA的生成、转运和降解速率，在亚细胞水平揭示RNA的动力学图谱。该研究成果于近日发表在《Nature Methods》上，题为：Spatiotemporally resolved transcriptomics rev...
我国科学家绘制出人类胚胎器官发生时期单细胞图谱
人类胚胎 器官发生 单细胞图谱
2024/1/17
中国海洋大学等研究团队合作绘制了人类胚胎早期器官发生的单细胞转录组图谱。该研究成果于近日发表在《Nature Cell Biology》杂志上，题为：A single-cell transcriptome atlas profiles early organogenesis in human embryos。
科学家将人类胚胎发育的前60天划分为23个发育时期，即卡内基分期（Carnegie stage，CS1-CS23）。目前，人类CS1-CS7胚胎发育事件已被多个团队解析，而人类CS7后的早期器官发生时期的胚胎难以获得，此阶段的研究仍为空白。非人灵长类动物与人类在进化上关系密切，经常被用作研究人类早期胚胎发育的动物模型。中国科学院动物研究所等研究人员绘制了非人灵长类动物原肠运动与早期器官发生的单细胞...
人的生命开始于精子与卵子融合形成受精卵（胚胎期第0天；Embryonic day 0；E0），受精卵经历卵裂形成囊胚，囊胚在E7左右种植到母体子宫进一步发育。E14开始，胚胎经历原肠运动，胚胎后部细胞发生大规模定向迁移，并形成原条细胞。原条细胞进一步分化为中胚层和定型内胚层（definitive endoderm），同时胚胎前部细胞分化为外胚层。基于此，胚胎发育成为具有内胚层、中胚层和外胚层的三胚...
基于单细胞转录组测序图谱的肿瘤病灶溯源（图）
单细胞 转录组 测序图谱 肿瘤
2023/6/20
杨朝勇教授课题组与合作者发展了基于单细胞转录组测序图谱与深度迁移学习的循环肿瘤细胞组织溯源新方法, 相关成果以“Deep transfer learning enables lesion tracing of circulating tumor cells”为题发表于《自然-通讯》（Nature Communications, 2022, 13, 7687）。
浙江大学生命科学研究院2022年7月18日浙江大学祝赛勇/刘建钊课题组合作在Nature Communications发文首次报道胰腺谱系分化过程中的mRNA m6A修饰动态图谱及ALKBH5对胰岛发育的关键调控作用（图）
祝赛勇 刘建钊 Nature Communications 胰腺谱系分化 mRNA m6A修饰 动态图谱 ALKBH5 胰岛发育
2022/10/25
器官发育是最重要的生物学问题之一。通过研究线虫、果蝇、斑马鱼、爪蟾、小鼠等经典模式生物，建立了发育学基本原理。人多能干细胞定向分化及类器官技术，基于人类自身遗传背景，是研究人类器官发育新体系，具有独特性、不可替代性。近年来，这一领域得到了快速发展，越来越受到重视、关注和应用。特别是利用干细胞定向分化结合CRISPR基因编辑技术，研究细胞分化和器官发育，已成为研究热点。其中胰岛类器官技术，不仅可以促...
近日，中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）国家基因组科学数据中心开发的癌症单细胞表达图谱数据库（CancerSCEM）正式上线。该研究成果以“CancerSCEM: a database of single-cell expression map across various human cancers”为题在国际学术期刊Nucleic Acid Research 在线发表。
2021年7月10日 讯 /生物谷BIOON/ --正向遗传学研究使用减数分裂图谱来列举证据证明通常由种系突变所诱导的特定突变是某一表明的致病因素；尤其是在小规模的人群血统中，多种突变的共分离、偶尔不知道的突变以及纯合子的缺乏可能会导致错误的因果声明，近日，一项刊登在国际杂志Proceedings of the National Academy of Sciences上题为“Thousands o...