搜索结果: 1-15 共查到“生物学 新算法”相关记录15条 . 查询时间(0.519 秒)
中国农科院蔬菜花卉所开发异交物种基因高效定位的新算法工具OcBSA（图）
基因 分子育种 解析
2024/3/1
2024年2月18日，中国农业科学院蔬菜花卉研究所蔬菜分子设计育种创新团队程锋研究员联合马铃薯遗传育种与栽培创新团队李广存研究员，基于深入解析异交（异花授粉）物种或长世代物种的F1分离群体的遗传特点，开发了一套专用的BSA 新算法工具OcBSA，以高效促进其基因挖掘，从而推进该类物种的分子育种。研究成果以“OcBSA: an NGS-based Bulk Segregant Analysis To...
中国科学院北京基因组研究所开发出比较群体基因组学新算法（图）
基因组测序 基因组学 新算法
2023/10/17
随着基因组测序技术的发展，物种和群体水平基因组数据呈指数增长。这些数据为在基因组水平鉴定和解析自然选择机制提供了机遇。然而，目前的分析方法面临着技术瓶颈和挑战。其中，关键问题是如何高效准确地检测作用于非编码区的自然选择效应。同时，能够高效、高性能地分析多物种大样本数据，成为方法学方面的迫切要求。
中国科学院北京基因组所开发出比较群体基因组学新算法（图）
群体基因 高性能地分析
2023/10/23
随着基因组测序技术的发展，物种和群体水平基因组数据呈指数增长。这些数据为在基因组水平鉴定和解析自然选择机制提供了机遇。然而，目前的分析方法面临着技术瓶颈和挑战。其中，关键问题是如何高效准确地检测作用于非编码区的自然选择效应。同时，能够高效、高性能地分析多物种大样本数据，成为方法学方面的迫切要求。
新算法揭示蛋白质进化秘密（图）
阿尔法折 蛋白质 自然
2023/9/27
一个国际科研团队在2023年9月13日出版的《自然》杂志上刊发论文称，他们开发出一种新算法，来比较“阿尔法折叠”数据库中所有已预测蛋白质的结构，揭示了不同物种蛋白质之间的相似性。最新研究结果有助科学家理解蛋白质的进化历程，并为人类免疫蛋白质的起源提供了新见解。
中国科学院动物研究所提出空间细胞类型组分解析新算法（图）
空间细胞 组分解析 新算法
2023/8/14
2023年8月7日，中国科学院动物研究所翟巍巍/马亮团队在《自然-通讯》（Nature Communications）上，发表了题为SONAR enables cell type deconvolution with spatially weighted Poisson-Gamma model for spatial transcriptomics的研究论文，提出了新颖的基于空间转录组数据解析空间...
中国科学院动物所提出空间细胞类型组分解析新算法（图）
空间细胞 分解析新算法 免疫细胞
2023/8/14
2023年8月7日，中国科学院动物研究所翟巍巍/马亮团队在《自然-通讯》（Nature Communications）上，发表了题为SONAR enables cell type deconvolution with spatially weighted Poisson-Gamma model for spatial transcriptomics的研究论文，提出了新颖的基于空间转录组数据解析空间...
国外新算法可生成蛋白质5D图像揭示微小尺度下的生物学过程
蛋白质 5D图像 微小尺度 生物学过程
2024/1/23
美国圣路易斯华盛顿大学科研团队开发出一种机器学习算法Deep-SMOLM，可生成蛋白质5D图像，包括单个分子的方向和位置等信息。
兰州大学课题组在蛋白质冷冻电镜投影图像方面提出三维重构新算法（图）
蛋白质 冷冻电镜 投影图像 三维重构
2023/11/10
蛋白质结构解析是分子生物学的核心课题，对于人们认识蛋白质的功能，理解疾病的发病机理（例如病毒的致病机理），进行药物设计和疾病治疗等都具有非常重要的意义。近年来，冷冻电镜技术在测定生物大分子结构方面取得了突破性的进展，虽然目前DeepMind 公司开发的AlphaFold已经可以从蛋白质序列预测蛋白质的三维结构，但其准确性还有待提升，其结果也只能作为预测结果使用。
谷歌DeepMind团队研发的阿尔法折叠2（AlphaFold2）使用最新的人工智能算法对蛋白质结构实现了接近实验精度的精准预测。复旦大学复杂体系多尺度研究院教授马剑鹏团队与上海人工智能实验室合作，近日在国际知名刊物《生物信息学简报》上发表论文，显示其蛋白质侧链预测算法（OPUS-Rota4算法）精度显著超越了谷歌团队的阿尔法折叠算法。
中国科学院南海海洋研究所科研人员建立原噬菌体de novo预测新算法（图）
原噬菌体 de novo预测
2022/10/20
中国科学院南海海洋研究所研究员王晓雪团队建立了一种不依赖于噬菌体基因序列相似性的原噬菌体de novo预测新算法，集成分析流程的工具名为Prophage Tracer。相关研究2021年9月22日在线发表于《核酸研究》。汤开浩博士为论文第一作者，王晓雪为通讯作者。来自天津生物芯片技术有限责任公司的孙亚民博士也参与基因组分析工作。
新算法可识别与疾病相关基因
新算法 可识别 疾病 基因
2020/12/2
俄罗斯圣光机大学（ITMO）生物信息学研究人员开发了一种算法，可帮助评估基因对人体过程（包括疾病发展）的影响。这项研究发表在《BMC生物信息学》上。脱发、肥胖或视力低下可能与特定基因有关，识别出相关基因组，有利于研究和治疗。此外，为确定基因和病情之间是否存在联系，了解基因之间的相互作用也非常重要。ITMO助理教授爱列克谢·谢尔盖西切夫解释说：“总的来说，每个人有超过2万个基因。通过将患者病情相关基...
测序数据组装新算法将数据分析速度提升5倍（图）
中国农业科学院深圳农业基因组研究所 自然·生物技术（Nature Biotechnology） 测序数据组装算法 Flye算法 分析
2020/1/11
2019年12月9日，中国农业科学院深圳农业基因组研究所阮珏团队在《自然·方法学（Nature Methods）》上发表第三代测序数据组装算法wtdbg，该算法极大提高三代测序数据的分析效率，与2019年4月1日发表在《自然·生物技术（Nature Biotechnology）》上的Flye算法相比，分析速度提升了5倍，并首次将测序数据分析时间降低到少于测序数据产出时间。
2018年4月19日，Nature Communications杂志在线发表了中国科学院生物物理研究所章新政课题组的研究论文"Pushing the resolution limit by correcting the Ewald sphere effect in single-particle Cryo-EM reconstructions"，本论文计算了传统冷冻电镜单颗粒三维重构法在埃瓦尔德球...
新算法有望加快艾滋病疫苗研发
新算法 艾滋病疫苗 研发
2013/5/14
美国研究人员9日在学术期刊《科学》上报告说，他们开发出一种新计算方法，可以更快地发现抵御艾滋病病毒的强力抗体，这一成果有望加快艾滋病疫苗研发。
开发艾滋病疫苗是全球面临的重要任务和挑战。尽管艾滋病病毒已发现30多年，但由于其多变和多样性，迄今还没有一种针对该病的疫苗能离开实验室并大量应用。不过近年来，科研人员在艾滋病病毒“中和抗体”研究方面已取得重要进展。
北京基因组研究所设计开发出检测密码子使用偏好的新算法（图）
检测密码子 使用偏好 新算法
2012/4/6
近日，中国科学院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室“百人计划”章张研究员带领其团队，成功设计开发出检测密码子使用偏好（Codon Usage Bias，简称CUB）的新算法：密码子偏差系数模型（Codon Deviation Coefficient，简称CDC）。该研究成果发表在BMC Bioinformatics杂志上。