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中国科学院昆明动物研究所陈勇彬课题组发现m6A RNA甲基化识别蛋白YTHDF1在低氧适应和非小细胞肺癌发生发展中的重要功能（图）
中国科学院昆明动物研究所 陈勇彬 m6A RNA甲基化 蛋白YTHDF1 低氧适应 非小细胞肺癌
2019/12/19
2019年10月25日，《Nature Communications》期刊在线发表了陈勇彬学科组的最新研究成果“YTHDF1 links hypoxia adaptation and non-small cell lung cancer progression”。该工作揭示了YTHDF1在低氧适应和非小细胞肺癌发生发展中的重要功能和分子调控机理。陈勇彬学科组前期与吴东东学科组合作，利用进化生物学的...
R-loop是一种由RNA:DNA杂合链和单链DNA组成的特殊核酸结构，在原核和真核生物的基因组中分布广泛且普遍存在。R-loop在很多关键的生物学过程中发挥重要功能，包括染色质修饰、转录调控、DNA损伤修复以及基因组稳定性等，但其如何被精确调控的机制尚不清楚。m6A修饰作为信使RNA上丰度最高的修饰类型，广泛参与哺乳动物的发育、免疫、干细胞更新、脂肪分化、以及肿瘤生成和转移等生命过程。然而，目前...
7-甲基鸟嘌呤（m7G）修饰是转录后调控中最常见的碱基修饰形式之一，广泛分布于tRNA、rRNA、以及真核生物mRNA的5’帽子区，对维持RNA的加工代谢、稳定、出核以及蛋白质翻译具有重要作用。近期研究表明高等真核生物mRNA内部也含有m7G修饰，然而对其分布特征和调控作用目前尚不清楚。中国科学院大学中丹学院组学系、中国科学院北京基因组研究所杨运桂团队开发了单碱基分辨率的m7G高通量测序技术(m7...
中国科学院北京基因组研究所杨运桂团队开发了单碱基分辨率的m7G高通量测序技术(m7G miCLIP-seq)，通过该方法系统性描绘m7G在真核生物mRNA内部的分布特征，并进一步解析应激处理下该修饰对蛋白质翻译的分子调控机制。相关研究成果在9月13日以Dynamic methylome of internal mRNA N7-methylguanosine and its regulatory r...
中国科学院北京基因组研究所研发RNA甲基化7-甲基鸟嘌呤（m7G）测序技术
中国科学院北京基因组研究所 研发 RNA 甲基化7 甲基 鸟嘌呤 m7G 测序技术
2019/9/20
7-甲基鸟嘌呤（m7G）修饰是转录后调控中最常见的碱基修饰形式之一，广泛分布于tRNA、rRNA、以及真核生物mRNA的5’帽子区，对维持RNA的加工代谢、稳定、出核以及蛋白质翻译具有重要作用。近期研究表明高等真核生物mRNA内部也含有m7G修饰，然而对其分布特征和调控作用目前尚不清楚。中国科学院北京基因组研究所杨运桂团队开发了单碱基分辨率的m7G高通量测序技术(m7G miCLIP-seq)，通...
研究人员揭示超级增强子动态甲基化调控转录异质性
研究人员 超级增强子 甲基化 转录异质性
2019/9/6
2019年8月15日，美国Whitehead研究所Rudolf Jaenisch联合其他课题组在Molecular Cell上发表文章Dynamic Enhancer DNA Methylation as Basis for Transcriptional and Cellular Heterogeneity of ESCs。研究人员选择了Sox2和miR290-295的超级增强子作为研究对象。这...
北京大学生命科学学院汤富酬课题组携手北医三院乔杰课题组首次利用单细胞转录组和DNA甲基化组图谱重构人类胚胎着床过程（图）
北京大学生命科学学院 汤富酬 课题组 携手 北医三院 乔杰 单细胞 转录组 DNA 甲基化组 图谱 重构 人类 胚胎
2019/8/28
胚胎着床是包括人类在内的哺乳动物发育过程中的里程碑事件，生理状态下超过半数以上的人类胚胎由于无法顺利着床导致不孕。既往研究通常使用小鼠和食蟹猴等模式生物对这一过程展开探索，然而调控围着床时期胚胎发育的分子机制和形态学变化特征在不同物种之间存在较大差异，这使得在小鼠等模式生物研究中获得的调控规律较难为人类胚胎发育研究提供有价值的线索。然而，由于人类胚胎着床发生在受精卵形成后一周左右的时间点，这使得研...
北京大学生命科学学院汤富酬课题组携手北医三院乔杰课题组首次利用单细胞转录组和DNA甲基化组图谱重构人类胚胎着床过程（图）
北京大学生命科学学院 汤富酬 乔杰 单细胞转录组 DNA甲基化组图谱 人类胚胎着床过程
2019/8/23
胚胎着床是包括人类在内的哺乳动物发育过程中的里程碑事件，生理状态下超过半数以上的人类胚胎由于无法顺利着床导致不孕。既往研究通常使用小鼠和食蟹猴等模式生物对这一过程展开探索，然而调控围着床时期胚胎发育的分子机制和形态学变化特征在不同物种之间存在较大差异，这使得在小鼠等模式生物研究中获得的调控规律较难为人类胚胎发育研究提供有价值的线索。然而，由于人类胚胎着床发生在受精卵形成后一周左右的时间点，这使得研...
研究发现植物DNA主动去甲基化新机制（图）
植物 DNA 甲基化 靶向机制
2019/8/19
2019年7月30日，《美国国家科学院院刊》（PNAS）杂志在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心上海植物逆境生物学研究中心朱健康研究组题为Histone Acetylation Recruits the SWR1 Complex to Regulate Active DNA Demethylation in Arabidopsis 的研究论文。该研究发现了植物DNA主动去甲基化的完整调控途...
中国科学院植物研究所解析RNA甲基化调控果实成熟的作用机制（图）
中国科学院植物研究所 RNA甲基化 果实成熟 作用机制
2019/8/13
DNA甲基化（5mC）和RNA甲基化（m6A）是两种重要的核酸修饰，在基因表达调控中发挥重要作用并参与诸多生物学过程。然而，这两种核酸修饰之间是否存在内在关联性却不清楚。近日，中国科学院植物研究所秦国政研究组和田世平研究组合作，揭示了DNA甲基化可通过调节m6A去甲基化酶基因表达的方式影响番茄果实m6A修饰，而m6A去甲基化酶反馈调节DNA甲基化，从而共同调控果实成熟。果实成熟是一个非常复杂的过程...
近期，中国科学院北京基因组研究所杨运桂研究组、中国科学院动物研究所刘峰研究组和复旦大学麻锦彪研究组合作发现，m5C通过新结合蛋白Ybx1调控母源mRNA的稳定性，进而调控斑马鱼母源-合子转换及早期胚胎发育进程。相关研究成果8月6日以RNA 5-methylcytosine facilitates maternal-to-zygotic transition through preventing m...
复旦大学生命科学学院董爱武课题组揭示植物组蛋白H3第36位赖氨酸甲基化修饰建立的分子机制（图）
复旦大学生命科学学院 董爱武 课题组 植物组蛋白H3 第36位 赖氨酸甲基化 分子机制
2019/7/17
组蛋白赖氨酸甲基化修饰作为最重要的表观遗传修饰之一，在不同物种中的功能是相对保守的。不同位点上的赖氨酸甲基化（组蛋白H3第4，9，27，36，79以及H4第20位赖氨酸残基）或是同一位点不同程度的甲基化（me1, me2, me3）代表着不同的染色质状态，进而影响基因的转录。尽管组蛋白赖氨酸甲基化修饰的功能在不同物种中相对保守，但某些修饰在动、植物基因组上的分布模式却存在差异，暗示了植物中存在特殊...
探讨原钙黏附蛋白17（PCDH17）基因甲基化与胃癌的关系及其在胃癌诊断中的价值。方法采用荧光定量甲基化特异性PCR法分析正常胃黏膜上皮细胞株GES-1和胃癌细胞株MGC-803、AGS和SGC-7901，120对胃癌组织及对应癌旁正常组织，120例胃癌患者血浆样本和120例健康体检者血浆样本中PCDH17基因甲基化水平；并分析胃癌组织中PCDH17基因甲基化水平与临床病理特征的关系。比较胃癌组织...
核小体是真核生物染色质的基本单位，由DNA缠绕组蛋白八聚体构成。组蛋白翻译后共价修饰是表观遗传调控的重要方式之一，通过影响染色质的状态而调控基因表达等过程。组蛋白H3第27位赖氨酸的三甲基化修饰(H3K27me3)通过维持基因的沉默状态，在动植物细胞命运决定以及生长发育中发挥重要的调控作用。基因组中特定位点的H3K27me3修饰水平由组蛋白甲基转移酶和去甲基化酶进行动态调控。中国科学院遗传与发育生...
