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MACdb数据库系统建立了癌症-代谢物关联关系的收集标准，通过使用一系列本体体系（Ontology）对癌症类型、特征、代谢物标准化，构建了高一致性的综合知识集合。当前版本的知识库共收录了462篇文献，提取了40,710个癌症-代谢物关联关系对，共涉及到269个癌症特征，涵盖17类高发病率或高死亡率癌症类型，是当前涵盖癌症类型最全的癌症-代谢物关联知识库。MACdb构建了便捷高效的检索和过滤系统，支...
物种是我们用来研究、理解和保护自然世界的主要单元。因此，我们如何定义物种会对各个领域产生连锁影响，远远超出生物学的范畴。尽管如此重要，关于物种概念的争论仍持续至今，并对我们认识、研究和保护的生物产生了影响。鉴于地球上丰富生命，实现一个普遍接受的物种概念似乎是不可能的。如果分类学家等待一个普遍接受的概念，推迟他们描述和界定物种的工作，我们就有可能面临物种被命名之前灭绝的风险。
中国科学院北京基因组所等发布全转录组关联研究知识库（图）
北京基因 知识图谱
2022/11/3
2022年11月3日，中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）国家基因组科学数据中心（NGDC）与中国医学科学院医学信息研究所开发的全转录组关联研究知识库正式上线。相关研究成果以TWAS Atlas: a curated knowledgebase of transcriptome-wide association studies为题，在线发表在Nucleic Acids Research上...
近日，中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）国家基因组科学数据中心（NGDC）开发的全转录组关联研究知识库正式上线。该研究成果以“TWAS Atlas: a curated knowledgebase of transcriptome-wide association studies”为题在国际学术期刊Nucleic Acids Research 在线发表。
基因组序列变异与表型关联知识，主要是通过全基因组关联分析(GWAS)，在全基因组范围内鉴定与特定疾病或表型性状等相关联的遗传变异位点，是挖掘和揭示生物复杂性状分子遗传机制的重要资源。
中国科学院北京基因组研究所开发基因组变异-表型关联知识库（图）
中国科学院北京基因组研究所 基因组变异 表型关联知识库
2019/10/15
近日，由基因组所开发的国际上首个动植物基因组变异-表型关联知识库(GWAS Atlas)正式上线发表，该项研究成果以“GWAS Atlas: a curated resource of genome-wide variant-trait associations in plants and animals”为题在国际学术期刊《核酸研究》（Nucleic Acids Research）在线发表。 全...
近日，中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心开发了国际上首个实时定量PCR内参基因知识库——ICG。该知识库基于群体审编策略，对经生物学实验手段鉴定出的内参基因及其应用场景实现了有效的挖掘、整合及注释。研究成果以ICG:a wiki-driven knowledgebase of internal control genes for RT-qPCR normalization为题，在线发表...
新疆天山雪莲(Sasussured involucrata)具有较高的极端低温耐受特性, 为低温耐受机制研究提供了一种非常好的模式植物。新疆天山雪莲转录组注解知识库(http://www.shengtingbiology.com/SaussureaKBase/index.jsp)是基于网络数据资源的综合性数据库, 由html、Perl、Perl CGI/DBD/DBI、Java和JavaScrip...
北京基因组研究所阿尔兹海默症基因知识库ALzBase正式上线（图）
北京基因组研究所 阿尔兹海默症 基因
2014/12/9
阿尔兹海默症（Alzheimer’s disease,AD）是一种在老年人人群中常见的神经退行性疾病，目前无有效治疗手段。人们对AD致病机理方面的研究也没有取得突破性的进展。为了能够更好地助力AD相关的研究，中国科学院北京基因组研究所雷红星研究组通过整合不同来源的数据，以阿尔兹海默症扰动基因为核心整理并开发了阿尔兹海默症基因知识库AlzBase，相关论文于近期发表于Molecular Neurob...