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中国科学院植物所在植物转座子进化方面取得进展(图)
植物转座子进化 生物基 自然群体
2023/12/13
转座子(Transposable elements,TEs)是较多生物基因组中主要的组成部分(在玉米中可达到80%以上)。与单碱基变异相比,转座子序列长、突变速率快,可更快速地产生大效应的突变。转座子能够通过多种机制影响基因的功能和生物的表型。尽管已有较多关于转座子的研究,但尚不清楚转座子对生物进化有利还是有害、遗传负荷变异的驱动力、物种生境扩张过程中转座子负荷(TE load)是否发生累积,以及...
中国科学院植物研究所科研人员在植物转座子进化方面取得新进展(图)
植物 转座子 进化 基因组 The Plant Cell 遗传
2024/1/28
中国科学院植物所科研人员在植物转座子进化方面取得新进展(图)
进化 生物基因 数量遗传学
2024/1/16
转座子(Transposable elements,TEs)是很多生物基因组中最主要的组成部分,在玉米中可达到80%以上。由于转座子序列长,突变速率快,与单碱基变异相比,可以更快速地产生大效应的突变。转座子能通过多种机制影响基因的功能和生物的表型。尽管转座子研究很多,但目前仍不清楚转座子究竟是对生物进化有利还是有害,遗传负荷变异的驱动力是什么。特别是,物种生境扩张过程中转座子负荷(TE load)...
普通小麦(Triticum aestivum,AABBDD)是经过两次杂交事件形成的异源六倍体,其融合了三个二倍体祖先不同的特性,具有强大的可塑性和环境适应能力,成为全球广泛种植的主粮作物。从进化角度讲,不同基因组的融合提供了丰富的原材料,促进多倍体的演化和表型可塑性,但具体分子机制并不清楚。小麦亚基因组的分化,主要源于不同二倍体祖先种中发生特异的转座子(TE)扩增。该研究团队前期结合高通量实验和...
近日,新疆农业科学院核技术生物技术研究所陈果副研究员在国际期刊《Nucleic Acids Research》(IF = 19.160)杂志在线发表了题为《A novel active transposon creates allelic variation through altered translation rate to influence protein abundance》的研究论文。...
普通小麦是全球种植范围最广的谷物,具有广泛的环境适应性,这被归因于三套适应不同环境基因组的融合。基因序列相对保守,三套亚基因组的基因间区高度分化,那么,亚基因组如何实现调控的协同与分化呢?2022年11月14日,Nature Communications 在线发表了题为“Transposable elements orchestrate subgenome-convergent and -dive...
转座子(Transposable Elements, TE)是基因组中可移动的DNA元件,20世纪40年代由Barbara McClintock首次报道。小麦族物种的转座子呈现爆发性增长,基因组高达3-16Gb,85%以上由TE组成,而与之亲缘关系密切的二穗短柄草基因组只有272Mb。可以说小麦的基因是“散落”在TE的海洋中,这些庞大的TE群体仅仅是自私的自我复制垃圾序列,还是会影响宿主的基因活性...
南方科技大学生命科学学院Andrew Hutchins团队研究揭示转座子在人多能干细胞转录组中的活性和影响(图)
南方科技大学生命科学学院 Andrew Hutchins Nucleic Acids Research 转座子 干细胞转录
2022/10/20
近日,南方科技大学生命科学学院生物系副教授Andrew Hutchins团队在Nucleic Acids Research杂志发表题为“Transposable element sequence fragments incorporated into coding and noncoding transcripts modulate the transcriptome of human pluri...
中国科学院成都生物研究所在超大基因组转座子动态研究中取得进展(图)
两栖类蝾螈目 超大基因组 转座子 动态
2021/8/20
转座子(transposable elements, TE)可在染色体DNA上自主复制和“跳跃”,曾长期被认为是 “垃圾信息”, 近年来被证实是驱动基因组扩张的主要组分。超大基因组(一般指基因组大于10 Gb)在动物中非常罕见,我们以两栖动物原始类群版纳鱼螈(Ichthyophis bannanicus)为研究对象(基因组大小约12.2G),采用低覆盖度(0.1×)测序研究其转座子的景观和动态。这...
中国科学院动物研究所研究揭示动物中DNA转座子通过两种机制介导基因重复(图)
中国科学院动物研究所 动物 DNA转座子 两种 机制 介导 基因重复
2021/7/15
转座子被认为是宿主基因组演化的重要推动力。其类型众多,包含non-LTR(Long Terminal Repeat)型逆转座子、LTR型逆转座子、Helitron型DNA转座子、TIR(Terminal Inverted Repeat)型DNA转座子等,可引起包含基因重复(gene duplication)在内的各种遗传突变。已有研究表明,non-LTR型逆转座子在人类基因组中介导基因重复,产生大...
近日,我校棉花遗传改良团队公布了三个二倍体棉花的参考基因组,解析了转座子活动驱动的基因组大小进化特征,揭示了转座子扩增与染色质高级结构形成之间的进化关系,为植物中转座子活动介导的转录调控进化研究提供参考。
2021年3月1日,Nature Plants在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心,中国科学院-英国约翰英纳斯中心植物和微生物科学联合研究中心Jungnam Cho研究组题为“Ribosome stalling and SGS3 phase separation prime the epigenetic silencing of transposons”的研究论文,该研究从一个全新的角度阐...