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牛油果(Persea americana Mill.)属樟科鳄梨属常绿乔木,为著名的热带水果之一,原产于中美洲,果实富含多种不饱和脂肪酸,口感细腻,香气独特。为了深入理解牛油果的遗传信息,中国科学院西双版纳热带植物园(以下简称“版纳植物园”)植物基因组演化与次生代谢研究组,利用NGS、PacBio HiFi、ONT、Pore-C等测序技术对西印度品种的牛油果进行了全基因组测序,并成功组...
2024年5月3日,中国科学院广州生物医药与健康研究院刘兴国课题组在《细胞-代谢》(Cell Metabolism)上发表了题为A novel protein CYTB-187AA encoded by the mitochondrial gene CYTB modulates mammalian early development的研究论文。该研究发现并证实,除13个的线粒体基因编码的蛋白质外,...
中国科学院西双版纳热带植物园(以下简称“版纳植物园”)植物系统发育与多样性保护研究组选取黄杞(Engelhardia roxburghiana)为研究物种,利用生物信息学软件STACKS,探索使用不同参考基因组对SNP Calling的影响。该研究围绕两种不同参考基因组:使用近缘种(即枫杨:Pterocarya stenoptera)作为参考基因组,以及利用物种本种(即黄杞)作为参考基...
“竹子开花”现象,即多年生一次大量开花且开花后即死现象,是指植物经过多年营养生长后转入生殖生长,最后一次开花并结实后植株群体死亡的生物学现象。该现象最早在木本竹类中被发现,引起了生物学家的广泛关注。实际上,多年生一次性开花现象存在于被子植物20多个科(属)中,包括真双子叶植物唇形目爵床科马蓝属植物。因营养生长周期长,“竹子开花”现象相关研究主要集中于形态和生长习性描述,其分子遗传调控机制研究落后于...
基因扩增又称无细胞分子克隆系统或特异性 DNA 序列体外引物定向酶促扩增法,是基因扩增技术的一次重大革新。可将极微量的靶DNA 特异地扩增上百万倍,从而大大提高对 DNA 分子的分析和检测能力,能检测单分子 DNA 或对每 10 万个细胞中仅含 1 个靶 DNA 分子的样品,因而此方法立即在分子生物学、微生物学、医学及遗传学等多领域广泛应用和迅速发展。由于 PCR 具有敏感性高、特异性强、快速、简...
寄生植物是通过特化器官吸器(haustorium)从寄主植物中获取养分和无机盐,这个习性在被子植物中至少独立演化了12次。旋花科菟丝子属(Cuscuta L.)是全球广布的寄生植物代表,已记载超过200个种。在形态上,菟丝子属植物属于茎寄生,根和叶片已完全退化,光合作用能力非常微弱或者完全失去。菟丝子属质体基因丢失和基因组功能退化已被多次报道,但其基因基因组功能退化和演化规律尚未明晰...
2024年4月26日,中国科学院海洋研究所陈楠生课题组在硅藻基因组学研究方面取得新进展,成功构建了首个热带骨条藻(Skeletonema tropicum)的高质量染色体水平参考基因组,相关研究成果发表在国际数据集期刊Scientific Data(Q1,IF=9.8)。这是该团队在2023年成功构建海洋优势浮游植物玛氏骨条藻(Skeletonema marinoi)染色体水平基因组之后完成的第二...
巨核细胞(Megakaryocyte,MK)是骨髓中产生血小板的血细胞,血小板在止血、伤口愈合以及炎症反应中具有重要的作用。然而目前血小板输注完全依赖于健康供者捐献,随着血小板输注需求量的增加,供者来源短缺,血小板难以在体外长期保存,血小板的输注存在巨大的供应缺口。而巨核细胞的多倍体化对于血小板产生非常重要,是高效生成功能性血小板的重要保障。因此解析巨核细胞多倍体化调控机制对于突破血小板再生技术瓶...
小麦白粉病是威胁粮食安全的病害之一。当前,提高小麦的白粉病抗性尤其是广谱抗性,是小麦抗病育种领域的主要任务。野生二粒小麦是普通小麦的野生祖先种,经历了长期而复杂的环境演变,积累了丰富的遗传多样性,是现代小麦抗病遗传改良的宝贵资源。
反刍动物中包含许多重要的家畜,它们拥有独特的包含多个胃室的消化系统。目前对于反刍动物胃肠道中细菌、古细菌的研究已取得了显著进展。而病毒同样是反刍动物胃肠道微生物群的关键组成部分,在塑造微生物组成方面发挥重要作用,并且由于病毒的微生物宿主范围狭窄的特性可以作为一种精确调控微生物宿主以抑制病原细菌和控制甲烷排放的系统性工具。然而对于反刍动物胃肠道中的病毒群落生态结构仍然缺乏全面的了解。2024年4月4...
小麦白粉病是严重威胁我国粮食安全的重要病害。提高小麦的白粉病抗性,尤其是广谱抗性,是当前小麦抗病育种领域的重要任务和挑战。野生二粒小麦(Triticum dicoccoides, AABB)是普通小麦的野生祖先种,经历了长期复杂的环境演变,积累了丰富的遗传多样性,是现代小麦抗病遗传改良的宝贵资源。
近日,中国科学院海洋研究所藻类生理过程与精准分子育种团队与合作者利用精准基因编辑技术揭示了海洋硅藻对种群密度信号的感知和传递机制。研究成果发表在《国际微生物生态学学会杂志》上。
自30年前“人类基因组计划”(HGP)启动以来,完整和准确的参考基因组一直是生物医学研究领域致力追求的目标。2022年4月,Science期刊发表了首个人类端粒到端粒(T2T)完整基因组——T2T-CHM13,填补了GRCh38版本中剩余的8%人类基因组序列空白,成为有史以来第一个高质量的单倍体人类基因组。2024年来研究证实人种之间存在显著的基因组序列差异,而参考基因组与待测样本之间的差异会严重...
近日,中国工程院院士、南方海洋科学与工程广东省实验室(广州)教授包振民团队开发国际首个整合宏观/微观进化基因组和功能基因组的综合分析工具(PanSyn,https://github.com/yhw320/PanSyn)。相关成果发表于《自然-实验手册》。该成果是包振民团队长期积累的丰富基因组学分析方法和工具研发经验的系统总结和提升。
2024年4月2日,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)任捷团队和杨运桂团队,在《分子细胞》(Molecular Cell)上在线发表了题为DDX21 mediates co-transcriptional RNA m6A modification to promote transcription termination and genome stability的研究论文。该研究揭示了三...

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