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近日，浙江大学出版社印刷出版了北京基因组研究所（国家生物信息中心）合作著作的生命科学著作《RNA 甲基化表观转录组学》，该著作入选“中国基础研究前沿”丛书。表观遗传学修饰包括DNA、RNA和蛋白质的化学修饰，基于非序列改变所致基因表达和功能水平变化。近年来基于DNA和蛋白质修饰，可逆RNA甲基化修饰研究引领第三次表观遗传学修饰研究浪潮。RNA存在150余种化学修饰,甲基化是最主要的修饰形式，鉴定R...
2021年3月1日，Nature Plants在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心，中国科学院-英国约翰英纳斯中心植物和微生物科学联合研究中心Jungnam Cho研究组题为“Ribosome stalling and SGS3 phase separation prime the epigenetic silencing of transposons”的研究论文，该研究从一个全新的角度阐...
2021年2月7日，中国农业科学院生物技术研究所谷晓峰团队和合作者揭示了水稻表观遗传调控细胞周期和DNA损伤的新机制，为研究表观遗传调控作物重要农艺性状及提高抗逆性提供了新的途径和基因。相关结果发表在国际学术期刊《植物细胞（The Plant Cell）》上。
中国科学院遗传与发育生物学研究所曹晓风研究组应邀在Current Opinion in Plant Biology撰写“组蛋白甲基化修饰在表观遗传调控和温度响应中的作用”综述文章
曹晓风 组蛋白甲基化 表观遗传 温度响应
2021/2/5
中国科学院遗传与发育生物学研究所曹晓风研究组长期致力于高等植物表观遗传调控机理的研究，揭示了拟南芥组蛋白去甲基化酶JMJ14 (Cell Discov, 2015; Plant Cell, 2018)、REF6/JMJ12 (Nat Genet, 2011, 2016; Nat Commun, 2019; Cell Res, 2019)、JMJ13 (Nat Commun, 2019)、JMJ16...
细胞的命运决定受到转录因子与表观遗传因子的协同调控，例如胚胎干细胞的多能性维持，既需要关键转录因子的正确结合（如OCT4, SOX2, NANOG等），又需要对启动子和增强子活性的精确调控，两者密不可分。它们如何协同作用是亟需解决的科学问题。基因的启动子、超级增强子和过度活化的增强子上，都会有组蛋白甲基化H3K4me3及附近的H3K4me1的共同存在。那么这两种甲基化状态，到底是不同的甲基化酶催化...
复旦大学基础医学院上医孟丹和蓝斐团队合作揭示转录因子与表观遗传因子协同调控干细胞命运决定的机制（图）
复旦大学基础医学院 上医孟丹 蓝斐 转录因子 遗传因子 协同调控 干细胞 命运决定 机制
2021/2/23
细胞的命运决定受到转录因子与表观遗传因子的协同调控，例如胚胎干细胞的多能性维持，既需要关键转录因子的正确结合，又需要对启动子和增强子活性的精确调控，两者密不可分。因此，研究转录因子与表观遗传因子如何协同作用维持干细胞多能性是亟需解决的科学问题，对细胞命运决定具有重要的意义。近日，复旦大学基础医学院教授孟丹团队与生物医学研究院研究员蓝斐团队合作揭示了转录因子与表观遗传因子协同调控干细胞命运决定的新机...
mRNA上的m6A修饰受到了广泛的关注，其对于mRNA的命运调控涉及其生物学功能的方方面面，包括剪接、转运、降解、翻译等，m6A主要由METTL3/METTL14复合物催化，目前的研究主要集中在METTL3/METTL14对于细胞质中mRNA的调控研究。但是METTL3是否参与以及如何参与调控染色质功能的研究相对较少。内源性逆转录病毒（Endogenous retrovirus）元件是基因组转座子...
近日，暨南大学生物医学转化研究院周庆华课题组在Science Advances上发表了题为“N6-methyldeoxyadenine and histone methylation mediate transgenerational survival advantages induced by hormetic heat stress”的研究论文。第一作者为暨南大学生物医学转化研究院博士后万钦黎...
西安交通大学科研人员在单细胞核酸表观修饰与分子网络分析领域取得重要进展（图）
单细胞 核酸表观修饰 分子网络分析
2020/12/15
西安交通大学生命学院生命分析化学与仪器研究所赵永席教授团队利用DNA可编程链置换和自组装特性，发展了单细胞分子成对邻近区分的DNA编码扩增成像方法，并以DNA 5-羟甲基胞嘧啶（5hmC）与5-醛基胞嘧啶（5fC）两种表观修饰为例，使用该方法探究了单细胞内5hmC与5fC的游离位置与邻近分布，获得各自的位点数与亚细胞分布信息，有望揭示其结合蛋白的互作关系以及复杂的表观遗传调控机制。该方法还能拓展用...
近日，我校分子表观遗传学教育部重点实验室在我国主办的著名综合性学术期刊National Science Review（IF=16.693）上发表了题为“Genomic mosaicism due to homoeologous exchange generates extensive phenotypic diversity in nascent allopolyploids” （部分同源交换导致...
2020年9月22日，北京脑重大疾病研究院主办的“他山之玉”基础研究临床转化系列讲座活动，邀请到清华大学颉伟教授，做了题为“利用高灵敏表观遗传分析技术解密生命如何开始”的在线专题讲座。
表观遗传学是人体每天生产100亿个血细胞的关键（图）
表观遗传学 人体 血细胞
2020/9/29
每2000个骨髓细胞中只有一个会成为造血干细胞（HSC），而它们正是人体每天制造的100亿个血细胞的来源。北京时间8月6日，发表在《Science Advances（科学进展）》上的一项新研究中，来自西班牙巴塞罗那的联合研究团队发现，表观遗传调控因子PHF19对HSC分化至关重要，如果没有它，血液组织将失衡，就会出现相当于自然衰老时的状态。
Andrew Teschendorff组开发可应用于任意组织类型的表观基因组单细胞解析算法（图）
Andrew Teschendorff组 任意组织类型 表观基因组 单细胞 解析算法
2020/9/8
2020年9月4日，国际学术期刊Genome Biology在线发表了中国科学院上海营养与健康研究所Andrew Teschendorff课题组题为“EPISCORE: cell-type deconvolution of bulk tissue DNA methylomes from single-cell RNA-Seq data”的最新研究成果，该研究报道了一种新型算法——EPISCORE，...
2020年8月24日，《自然-代谢》（Nature Metabolism）在线发表了中国科学院广州生物医药与健康研究院刘兴国课题组的研究成果。该研究提出由母系转录因子Glis1调控多能干细胞命运的“表观组-代谢组-表观组”的跨界级联反应新概念，表明Glis1实现衰老细胞重编程并稳定基因组的功能，揭示Glis1介导“表观组-代谢组-表观组”的级联反应中，糖酵解代谢组驱动的组蛋白乙酰化和乳酸化修饰在前...
中国科学院微生物研究所郭惠珊研究组报导虫媒DNA病毒劫持宿主印迹基因逃逸表观抑制新发现（图）
中国科学院微生物研究所 郭惠珊 虫媒 DNA 病毒劫持 宿主 印迹基因 逃逸表观 抑制
2020/8/20
近日，中国科学院微生物研究所郭惠珊研究组在 The Plant Cell 杂志在线发表了题为 DNA Geminivirus Infection Induces an Imprinted E3 Ligase Gene to Epigenetically Activate Viral Gene Transcription 的研究论文。研究发现虫媒DNA双生病毒诱导植物异常表达一个编码E3 ligas...