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2024年3月19日,国际期刊The ISME Journal刊发了中国科学院海洋研究所藻类生理过程与精准分子育种团队利用精准基因编辑技术在海洋硅藻信号感知和传导领域的研究成果。研究揭示了海洋硅藻SLC24A在种群密度信号感知和调控中发挥重要作用。这一发现为工业生产中实现微藻的高密度培养提供了新思路,也为硅藻藻华暴发时种群动态变化及藻华命运决定机制提供了新见解。
草莓 (Fragaria)具有重要的经济和营养价值。现代八倍体栽培草莓 (F. × ananassa) 起源于两个八倍体野生种弗州草莓 (F. virginiana)和智利草莓 (F. chiloensis) 的种间杂交。然而,由于草莓属系统发育解析涉及未知的祖先,同源染色体交换和不完全谱系分选等问题,学术界至今对八倍体草莓的二倍体祖先的问题仍存在较大的争议。此外,对于八倍体草莓在驯化过程中的亚基...
2022年6月21日,浙江大学电气工程学院教师发展中心举办EE教学工作坊系列活动。浙江大学数学学院李方教授主持了沙龙的交流,并为老师们带来了主题为《离散、连续、对称与“基因”从历史角度理解教学与研究》的分享。
近日,国际权威学术期刊《PNAS》在线发表了由中国科学院数学与系统科学研究院和美国斯坦福大学、清华大学等单位的科研人员合作的基因调控网络建模的研究成果,提出了利用匹配的基因表达和染色质可及性数据刻画顺式调控元件和反式调控元件相互作用的数学模型,将基因调控网络的建模研究从编码基因推进到了非编码区域的调控元件,有望用来注释疾病等表型相关的遗传变异。
上海大学材料基因组工程研究院2019年博士研究生招生数学专业目录。
近日,我院李雷研究团队发表于《生物信息学》期刊的文章“BAUM: improving genome assembly by adaptive unique mapping and local overlap-layout-consensus approach”,经《基因组蛋白质组与生物信息学报》,简称GPB(Genomics, Proteomics and Bioinformatics)评审,入选...
上海大学材料基因组工程研究院2019年学术硕士研究生招生数学专业目录。
白延琴,教授,博导,1996 上海大学 博士(硕博联读),2004 荷兰德尔夫特理工大学 博士后,2005 上海大学 教授,2008 上海市重点学科带头人(运筹学),2012 上海市运筹学会副理事长,2014 中国运筹学会数学规划副理事长,研究方向: (1)最优化理论方法与应用 (2)统计与数量分析。
目前在文献中有很多关于多响应比较的研究方法,但是对带协变量调整的非参数检验的研究较少。一种直观的想法是将数据先投影到协变量的正交空间中,然后再利用秩和检验、调整的秩和检验或最大值检验方法。但是,功效普遍不高。在调整的秩和检验和伪F检验两种方法基础上,构建MIN2检验。大量模拟和实际数据表明,MIN2检验的效果优于现有的非参数检验方法。
结合复杂数据分析(Complex Data Analysis)理论和充分降维的思想,本文在有效提取结肠癌特征基因研究的基础上,建立结肠癌特征基因提取的BB-SIR模型。该模型方法简洁易懂且有较高的识别率。本文依据BB-SIR模型和所给数据找到了两个结肠癌亚型,并确定了该亚型的特征基因。实验结果表明,BB-SIR方法选出的特征基因能够识别出结肠癌亚型,并且识别正确率达到96%以上。
本文主要研究时滞因素对基因调控模型的正平衡点的稳定性的影响及其诱发的周期振荡。我们分别研究离散时滞和分布时滞两种情况。通过分析相应的特征方程根的分布,我们给出了正平衡点绝对稳定、条件稳定所满足的条件以及时滞诱发周期振荡的临界值。最后通过数值模拟验证了理论分析结果。
利用能量法分析无标记生物检测中基因芯片的纳米力学行为.首先,考虑微悬臂梁机械能、基因层静电能、水合能和构型熵,建立基因芯片能量模型;其次,利用能量最小原理,得到芯片稳态弯曲的曲率半径与表面应力之间的关系;最后,预测种植密度对芯片表面应力的影响,同时将预测结果与有关实验数据进行比较,证明该方法的可靠性.
单倍型推断在现代连锁分析和关联分析中起着非常关键的作用. 目前的单倍型推断方法基本上是根据基因型去推断个体的单倍型, 而实际家系中某些个体的基因型经常是有部分缺失或者是完全未知的. 本文给出了当家系中含有部分缺失或者完全缺失基因型个体时的单倍型推断的EM方法, 并且给出了参数估计的标准差, 最后通过模拟研究证实了我们的方法的可行性.
广西大学数学建模课件第十一章第三节 基因遗传。

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