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陈兴课题组实现动物活体中的细胞特异性糖质标记与分析（图）
细胞特异性 代谢糖质标记 非天然糖分子 糖质标记和分析
2022/5/7
生物体中几乎所有的细胞都具有相同的基因组，而不同的细胞类型和功能则由不同的基因表达、表观遗传修饰和翻译后修饰等所决定。解析特定器官或组织中特定细胞的生物大分子图谱对于探究发育、细胞间通讯以及疾病的发生发展等都具有重要意义。因此，开发细胞选择性的生物大分子标记方法，近年来受到了科学家们的广泛关注1。通过基因编码的方法，人们在活体动物中实现了蛋白质的组织特异性和细胞选择性标记和分析2,3。然而，糖质（...
衣康酸（Itaconate, ITA）是近年来在巨噬细胞中发现的具有显著抗炎活性的小分子代谢物。在细菌内毒素脂多糖 (LPS) 刺激下，巨噬细胞发生代谢重编程，线粒体代谢酶IRG1蛋白迅速被诱导表达，催化顺乌头酸脱羧和产生毫摩尔级别高浓度的ITA。Irg1基因敲除小鼠的遗传研究表明，ITA抑制炎症反应基因表达和发挥抗炎作用。之前的研究表明，ITA能抑制琥珀酸脱氢酶(SDH)活性，使得琥珀酸（Suc...
2022年2月4日，北京大学基础医学院王韵教授课题组在《Advanced Science》杂志发表题为“Cdyl deficiency brakes neuronal excitability and nociception through promoting Kcnb1 transcription in peripheral sensory neurons”的研究论文。文章使用了分子生物学、生物...
在急性髓系白血病（AML）中，~40%的基因突变与DNA甲基化修饰相关，包括DNA甲基转移酶DNMT、DNA羟甲基化酶TET2、代谢酶IDH、转录因子等，这为研究基因组特定区域的DNA甲基化调控提供了理想的疾病模型。基因组特定区域的DNA甲基化不可能仅由DNA序列CpG位点决定，而是表观修饰酶与识别DNA的转录调控因子协同作用的结果。在前期研究中，叶丹团队曾报道招募TET2的首个转录因子WT1，发...
北京时间2022年1月25日零点，上海交通大学医学院上海市免疫学研究所沈蕾课题组在国际著名期刊Nature Immunology 在线发表了题为“Neuropilin-1 mediates lung tissue-specific control of ILC2 function in type 2 immunity”的研究论文。该研究首次发现肺组织中TGFβ1诱导的Neuropilin-1（简称...
浙江大学植物研究所周明课题组在Nature Commun.发文合作揭示植物组织特异性DNA甲基化模式产生的遗传基础（图）
浙江大学植物研究所 周明 Nature Commun DNA甲基化 植物组织特异性 遗传基础
2022/5/31
近日植物所周明课题组和美国Salk生物研究所Julie Law课题组合作完成的题为The CLASSY family controls tissue-specific DNA methylation patterns in Arabidopsis的研究论文，发表在Nature Communications。一个成熟的个体拥有同一套基因组，却能发育成不同类型的细胞、组织和器官，表观遗传修饰模式被认为...
2022年1月13日植物所周明课题组和美国Salk生物研究所Julie Law课题组合作完成的题为The CLASSY family controls tissue-specific DNA methylation patterns in Arabidopsis的研究论文，发表在Nature Communications。
免疫记忆是适应性免疫的标志性特征。适应性免疫的记忆能力，使得宿主能够在面对病原微生物的再次入侵时，发动机体内更迅速、更高效的免疫应答。记忆性CD4和CD8 T淋巴细胞共同协调构建了T细胞免疫，为机体提供长久有效的免疫保护。记忆性T细胞具有静息、长生命周期，以及对再次应答的高反应性等特征。记忆性CD8 T细胞能在机体内保持稳定的数目，维持更长的时间，而记忆性CD4 T细胞则表现出缓慢的、逐步减少的数...
中国水产科学研究院长江水产研究所鱼类生殖发育与细胞工程研究团队通过对施氏鲟雌雄群体进行基因组重测序以及比较分析，筛选到施氏鲟雌性性别特异性DNA片段，并通过引物设计和群体验证，表明所获得的雌性性别特异性DNA分子标记在鲟科鱼类中具有通用性。相关研究成果近期在国际期刊《Genomics》（2021年影响因子为5.736）发表。
中国水产科学研究院长江水产研究所鱼类生殖发育与细胞工程研究团队通过对施氏鲟雌雄群体进行基因组重测序以及比较分析，筛选到施氏鲟雌性性别特异性DNA片段，并通过引物设计和群体验证，表明所获得的雌性性别特异性DNA分子标记在鲟科鱼类中具有通用性。相关研究成果近期在国际期刊《Genomics》（2021年影响因子为5.736）发表。
2021年12月2日，基因组所动物功能基因组学创新团队在《遗传学前沿（Frontiers in Genetics）》杂志上发表了题为“A Comparative Analysis of Super-enhancers and Broad H3K4me3 Domains in Pig, Human and Mouse Tissues”的研究论文。该研究比较分析了猪、小鼠和人的6个组织中的超级增强子以...
蛋白质位点特异性糖基化的精准解析对于研究蛋白质糖基化功能、发现疾病潜在标志物及药物靶标十分重要。大规模、高准确性完整糖肽解析一直是蛋白质后修饰分析领域极具挑战性的工作。近年来，完整糖肽解析在生物质谱分析及计算糖蛋白质组领域都取得了重要进展；然而，目前解析方法仍有明显的局限性：大部分工具无法对糖链鉴定进行质控，尤其是复杂的糖型；检索速度慢；无法对多个糖基化位点精准定位；无法鉴定含有修饰糖单元的完整糖...
寨卡病毒特异性治疗可保护胎鼠大脑
脑萎缩 寨卡病毒 胎鼠 分子治疗
2023/6/15
一项研究发现，一种基因沉默疗法可以防止寨卡病毒从怀孕母鼠传播给胎儿。这种疗法利用小细胞外囊泡（sEV）纳米颗粒进行药物输送，能穿过胎盘和血脑屏障，极大降低病毒对胎儿的神经损伤，包括脑萎缩。相关进展11月11日发表于《分子治疗》。
肠道菌群是人体重要的共生微生物，对于人体无法直接消化利用的膳食纤维等复杂多糖代谢至关重要。多形拟杆菌（Bacteroides thetaiotaomicron）是人体肠道内重要的碳水化合物降解细菌，是肠道中数量最多的细菌之一，能够将人体本身无法消化的大分子多糖降解为小分子糖类，影响宿主代谢机制，使得营养物质利用更加高效。在肠道中，乙酰木聚糖酯酶可以分解乙酰化的木聚糖生成短链脂肪酸——乙酸，有利于宿...
2021年8月9日讯/生物谷BIOON/---在过去的20年里，三种流行性或大流行性冠状病毒---SARS-CoV、MERS-CoV和SARS-CoV-2---已经从动物身上溢出，导致人类的致命疾病。研究病毒的科学家们决心发现一种方法来广泛保护人们免受新出现的冠状病毒的持续威胁。 创造这种全面对策的线索可能来自于一类罕见的人类抗体，它可以中和几种不同的冠状病毒。这些抗体已经在一些从COVID-19...