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稳健的系统发育假说是生物多样性和进化研究的基础，其对于解决分类争议，理解演化历程和解析分化模式至关重要。树蛙科（Rhacophoridae）隶属于两栖纲Amphibia、无尾目Anura，多样性丰富，目前已描述有约19个属420个物种，广泛分布于东亚、东南亚、南亚和非洲地区。该类群表现出多样的性状差异，因此，该科在生物学的诸多领域受到广泛关注，是验证进化假说的理想材料。近些年，基于传统DNA基因片...
真菌界许多物种对人类来说还是一个迷。真菌类群种与属的分类学地位、系统发育与进化是全球研究的热点。云南农业大学盛军团队与中国科学院昆明植物研究所许建初团队联合发表了真菌类群种属分类学与系统发育研究最新成果。研究团队选择两个门（子囊菌门Ascomycota，担子菌门Basidiomycota）、六个纲、24个目与55个科的126个真菌类群，所选类群覆盖了欧洲意大利等地，亚洲中国、印度和泰国，以及北美和...
【目的】明确肉食亚目(Adephaga)水生类群线粒体基因组的基本特征，并基于线粒体基因组序列分析肉食亚目水生类群的系统发育关系。【方法】基于Illumina HiSeq X Ten测序技术测定了圆鞘隐盾豉甲Dineutus mellyi和齿缘龙虱Eretes sticticus的线粒体全基因组序列，对其进行了基因注释，并对其tRNA基因二级结构进行了预测分析。加上已公布的鞘翅目(Coleopte...
冬青属植物的系统发育及生物地理研究（图）
冬青属植物 系统发育 生物地理研究
2020/3/3
为何有些植物分支的物种广泛分布并演化出许多物种而有些则不然？冬青属植物的进化研究，可能为回答这一进化生物学关键问题提供有力证据。冬青属（Ilex）是木本雌雄异株植物中最大的属（至少664种）。该属植物大多喜好温暖湿润的生境，无法存活于土壤长期干旱或寒冬较长的生境，暗示该属植物可能存在较强的生态位保守特性。冬青属花果形态典型、易于辨认，但叶片迥异，植株形态多变（由低矮灌木到高大乔木）。在气候合适的亚...
中国科学院昆明植物研究所植物多样性与基因组学团队伊廷双和李德铢研究组立足国家重大科学工程中国西南野生生物种质资源库，选取代表豆科全部6个亚科和97%族，以及豆目其它3个科的187种（其中151种为新获取）的质体基因组数据进行全面分析。通过对编码区（PC）、非编码区（PN）、编码区和非编码区串联（PCN）3个基本数据集，加上23个派生数据集及6个系统发育信号分析后新建数据集的深入分析，获得了该科具有...
近日，中国科学院水生生物研究所领衔开发的系统发育分析平台PhyloSuite的相关论文“PhyloSuite: an integrated and scalable desktop platform for streamlined molecular sequence data management and evolutionary phylogenetics studies”在分子与演化生态学综...
合囊蕨科系统发育和物种保护研究取得进展（图）
合囊蕨科 系统发育 物种保护
2019/12/19
合囊蕨科（Marattiaceae）为古老的蕨类植物类群之一，为大中型土生植物，该科植物起源古老，形态特征简化。合囊蕨科在我国的类群代表主要是观音座莲属（广义概念，包括原始观音座莲属）和天星蕨属。主要分布在我国的西南和华南等地，其中天星蕨属仅在云南的河口地区有少量分布。
研究人员通过单细胞测序绘制首个人胚胎造血和免疫系统发育图谱
单细胞测序 人胚胎造血 免疫系统 发育图谱
2019/11/13
2019年10月10日，来自英国Newcastle University和Wellcome Sanger Institute等机构的科学家在Nature上以长文形式发表了题为“Decoding human fetal liver haematopoiesis”的研究，首次报道了由胎肝驱动的人胚胎造血和免疫系统发育过程的单细胞图谱。在该项研究中，作者首先制备了受孕后4周至17周的人胚胎肝脏、卵黄囊、...
新华社孩子适当接触牲畜有利于免疫系统发育
接触牲畜；免疫系统发育；肠道中的淋巴细胞
2022/3/3
为什么乡下孩子经常比城里孩子“皮实”？美国俄亥俄州立大学等机构研究人员日前在国际期刊《免疫学前沿》杂志上发表论文说，婴幼儿时期适当接触农场牲畜有利于免疫系统的发育。
广义孟加拉鲮属Bangana sensu lato是分布于南亚、东南亚和东亚的大中型鱼类，由于该类群鱼类分布范围广且材料难以获取，致使该类群的系统研究十分匮乏。为了厘清广义孟加拉鲮属Bangana sensu lato的系统发育关系及分类，中国科学院昆明动物研究所系统进化与生物地理学研究组和东南亚野生动物多样性研究组合作，对该属的系统发育关系和分类进行了全面的梳理。分子系统发育结果表明，广义孟加拉...
群落组成结构能够通过影响宿主间接触率或宿主密度影响到病原的传播动态。当前，不少研究发现宿主多样性和传染病风险呈负相关（即生物多样性的稀释效应，dilution effect）。在全球生物多样性降低和传染病不断暴发的背景下，这种负向的多样性-疾病关系（Negative diversity-disease relationship）受到了很大的关注。稀释效应甚至被认为是多样性功能的一个重要方面。
樟科山胡椒属树种经济用途广泛。山胡椒属多数种类的种子富含脂肪，可供制皂及工业油用，如油料植物山胡椒（Lindera glauca）；不少种类富含芳香油，可制香料及药用，如中草药三桠乌药（Lindera obtusiloba）；一些种类的木材有香气，可供家具及文体用品等用，如缅甸著名木材黄金樟的树种山香果（Lindera metcalfiana）。然而，目前对于山胡椒属的物种界定是否合适尚存争议，尤...
龚洵团队在苏铁属的分子系统发育框架研究上取得进展（图）
龚洵 苏铁属 分子系统 植物
2018/6/15
苏铁属(Cycas)是现存现存苏铁类植物中分布最广、种类最多的一个属，且多数物种被列入IUCN红色名录，处于濒危状况。该属共有115种，主要分布在亚洲东部以及东南部、大洋洲以及周围岛屿、非洲东部及马达加斯加岛的热带亚热带区域。以往的系统学研究结果表明，苏铁属在苏铁类植物中最先分出，和苏铁目其他9属构成姐妹群关系；然而以往研究主要针对苏铁目下属间的分子系统发育关系，所涉及的苏铁属种类较少。因此，苏铁...
苏铁属的分子系统发育框架研究取得进展（图）
苏铁属 分子系统发育框架
2018/6/12
中国科学院昆明植物研究所特色观赏植物新品种选育与产业化示范团队物种濒危机制与保护遗传学研究组与泰国东芭热带植物园、深圳仙湖植物园、美国加州科学院以及台湾国立中山大学等单位合作，选取苏铁属90%的材料（100个接受种、7个亚种以及9个分类地位尚不确认成立的材料）为内类群，以银杏和苏铁目其他9属的材料为外类群，基于4个叶绿体片段(psbA-trnH，trnL-trnF，trnS-trnG和psbM-t...