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白腹鼠是一类分布于东南亚和中国大部地区的啮齿类动物，受限于其形态的相似性和模式标本保存地的分散性，白腹鼠属物种归属和界定与系统学一直存在诸多争议。
为解决白腹鼠属系统发育关系、厘定其分类系统、评估其物种多样性，蒋学龙课题组通过大量文献回溯，通过在中国广泛采样（白腹鼠属各物种、亚种和同物异名的地模标本）及收集邻近地区的样品，使用分子系统学方法对标本和样品进行比较分析。
【目的】蚜虫是杂食性农业害虫。本研究旨在通过线粒体基因组分析更好地了解蚜科昆虫的系统发育关系。【方法】结合第二代测序和PCR扩增技术获得了烟蚜Myzus persicae线粒体基因组全序列，与蚜科其他昆虫进行了对比分析；以贝叶斯法和最大似然法基于13个蛋白编码基因对蚜科进行了系统发育分析。【结果】烟蚜线粒体基因组（GenBank登录号： KU_236024）序列全长17 832 bp，A+T含量8...
扬州大学昆虫基础知识课件第二十七章 六足总纲的系统发育。
全球约有三分之二的有花植物集中分布于洲际间断分布的热带地区，其中热带美洲有着全球最高的物种丰富度，其次是热带亚洲。分布于热带美洲和热带亚洲的很多生物类群呈现出热带环太平洋间断分布的格局。目前这两大生物多样性富集区正面临着巨大危机已是全球性的共识，而开展热带环太平洋间断分布格局成因与机制的探讨，将有助于分析新、旧世界热带森林群落的演化历史，探究新、旧世界热带生物多样性空间格局形成的历史过程，在全球的...
新疆卡拉麦里山有蹄类自然保护区鹅喉羚遗传多样性及系统发育地位
鹅喉羚 遗传多样性 种群遗传结构 系统发育地位
2016/7/18
鹅喉羚是生活于亚欧大陆荒漠、半荒漠地区重要的有蹄类动物。2010年春季，新疆卡拉麦里山有蹄类自然保护区遭遇了60年不遇的雪灾，我们采集了野外救灾发现的130头死亡鹅喉羚肌肉样本，采用PCR和测序技术，研究了鹅喉羚线粒体 DNA 的 Cyt b 基因 1143 bp 核酸序列，发现新疆卡拉麦里山有蹄类自然保护区生存的鹅喉羚单倍型多样性较高(Hd=0.855)，核苷酸多样性较低(π=0.00224)。...
西华师范大学生命科学学院植物学（系统分类）课件第六章 植物的系统发育
西华师范大学生命科学学院 植物学 系统分类 课件 第六章 植物的系统发育
2015/12/10
西华师范大学生命科学学院植物学（系统分类）课件第六章 植物的系统发育。
应用整合的系统发育数据进行植被调查，不仅可以帮助科学家理解植物群落如何组成，而且还可以探索在近缘植物的生理和生态都是相似的情况下，群落结构是否由环境梯度或者生物的交互作用而成。这也使得科学家可以深入了解次生林等的演替过程。但是目前为止，对于被干扰的森林在该方面的研究仍然较少，特别是针对非树木方面的研究更少。已有研究表明，随着干扰的增加，热带树木群落倾向于由近缘物种组成，这就表明群落组成主要是受早期...
尽管物种的功能性状和亲缘关系已被广泛用于探讨森林群落结构的内在机理，但以往多数研究仅针对系统发育和功能alpha多样性格局，而针对局域尺度上系统发育和功能beta多样性的研究则很匮乏。我所天然林生态组王绪高研究员等以我国长白山25 ha（500m×500m）和美国威斯康星25.2 ha（300m×840m）温带森林样地为平台，利用不同空间过程模型，分别探讨了种间关系、生境过滤和扩散限制等对局域尺度...
拟盘多毛孢属（Pestalotiopsis）通常以植物病原体或内生的方式存在。据前人研究，它是一个包含300多种新化合物和具有生物活性代谢产物的属，因此成为很多新化合物骨架筛选的目标。目前发现该属的许多新化合物都是来自于该属未命名的种。针对该属分子系统学的研究开始于2011年，截止到2014年7月，属内36个种被鉴定并且已经获取分子数据。平脐蠕孢属（Bipolaris）是一个世界广布的非常重要的植...
中国科学院华南植物园发现系统发育对植物元素含量的影响
系统发育 植物元素含量 环境变化 生物多样性
2014/10/16
阐明植物元素含量特征及其影响因子对于理解植物对环境变化的响应与适应具有重要意义。长期以来，人们对土壤和气候条件如何影响植物元素含量做了大量的研究，然而系统发育（或进化历史）对植物元素含量的影响却往往被忽视。华南喀斯特地区是一个全球生物多样性热点地区，喀斯特植物是我国植物多样性和特有性的重要组成部分。
中国科学院成都生物研究所在溪蟹的系统发育研究中获进展
溪蟹 系统发育 印度西高止山脉 生物多样性
2014/9/1
中国科学院成都生物研究所Sebastian Klaus博士等就分布于印度板块的溪蟹 (Brachyura, Gecarcinucidae)开展了较为系统的研究，填补了长期以来对此类群研究的空白。此项工作是在中国科学院外籍青年科学家项目的支持下，与成都生物所李家堂博士开展“多物种时空变化与印度板块和欧亚板块碰撞机理”项目研究的前期科研成果。
中国科学院昆明植物研究所揭示缺失数据对系统发育分析的影响（图）
缺失数据 系统发育分析 基因片段
2014/8/29
在系统发育分析时缺失数据普遍存在于很多数据矩阵中，其对系统发育关系准确性的影响研究是长期以来备受关注的难题。对数据分析通常应该包括尽可能多的基因片段，同时使整个矩阵中的缺失数据最少。但是，到目前为止，通过增加包含缺失数据基因片段后对系统发育关系准确性的影响的研究较为匮缺，尤其是利用似然法对多基因片段联合矩阵而构建的系统发育关系的分析。
负密度制约和生境过滤是解释森林群落物种共存和生物多样性维持机制的重要假说.已有大量研究表明，负密度制约通过优势物种的种内竞争及近缘种之间的种间竞争、个体间病菌传播等过程为非优势物种及非亲缘种提供生存空间，从而使局域群落的系统发育α多样性随时间的推移而增加;由于生境过滤的作用，特定的生境选择亲缘关系相近的物种，因而随着时间的推移，同一生境内群落间的系统发育β多样性会降低.前人的研究主要集中于利用负密...
群落构建机制一直是群落生态学研究的核心问题. 群落系统发育和功能性状的α 及β 多样性为探讨生态位过程和中性过程在局域群落构建中的相对作用提供了新的视角. 本研究以哀牢山6 hm2 中山湿性常绿阔叶林动态监测样地为研究平台，基于DNA条形码构建的群落系统发育树和树种8 个关键功能性状，结合地形数据，分析不同生活史阶段树种在不同空间尺度的系统发育和功能性状α 及β 多样性. 研究表明：（1） 各生活...