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本发明涉及了一种新的蛋白质定量方法-等重二甲基化标记定量法,该方法利用甲醛和氰基硼氢化钠及其各自的同位素形式进行有机组合,对肽段进行标记,使得肽段在质谱的一级谱上具有相近质荷比而在二级谱上具有不同质荷比,从而在二级谱上实现蛋白质定量分析。该方法相较于其他定量方法,该方法具有定量准确度高,精密度高和动态范围高等优点。
2023年9月14日,《自然-通讯》(Nature Communications)在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心石建涛组完成的最新合作研究成果。 该研究开发了新方法,即利用医学病理学中常用的福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)样本,构建DNA甲基化信息图谱,并结合机器学习方法,准确预测转移性癌症的原发部位。
目前,鱼类病毒病的防控是我国水产养殖业持续和健康发展面临的难题。探究鱼类抗病毒感染的遗传机制、培育抗病鱼类新品种是我国水产科学的重要研究方向。与哺乳类相比,鱼类获得性免疫系统欠发达、免疫记忆较弱。因此,开发鱼类病毒病的疫苗存在较大困难。然而,鱼类天然免疫系统完备、发达,是抵御病原体感染的第一道防线,在鱼类抗病毒感染过程中具有重要作用。
研究团队发现Vc可显著增强DNA羟化酶Tet(ten eleven translocation)氧化5-甲基胞嘧啶的活性,进而促进DNA去甲基化作用。该研究第一次建立了Vc、Tet 和DNA 甲基化调控之间的直接联系,证明了维生素C可以调控哺乳动物的DNA修饰,并可解释维生素C 促进诱导全能干细胞(iPSC)转化的作用机制。研究成果于2013年6月14日发表于国际著名化学期刊《Journal of...
中国科学院化学研究所专利:检测结肠腺癌相关基因启动子甲基化引物
“如何实现健康老龄化”,事关国家发展全局,事关亿万百姓福祉。长寿老人,虽已极度衰老但仍保持相对健康,可延缓/规避重大老年性疾病。以健康长寿人群为研究对象,解析其健康老化分子机制,可对理解人类健康老化保护机制提供新的认识,对新型抗衰老干预技术研发提供新的指导依据。
长期以来,DNA甲基化(5mC)作为哺乳动物中最为经典的DNA共价修饰被广泛研究,其对基因表达调控、转座子沉默、基因印记以及X染色体失活等生命过程至关重要。直到2009年,Anjana Rao实验室在Science首次报道了在哺乳动物细胞中,存在由一类DNA双加氧酶Tet1/2/3介导的基于5mC氧化而产生的新的DNA共价修饰——DNA羟甲基化(5hmC)1;随后,关于5hmC的生物学功能及其意义...
竹类植物作为一种特殊的禾草,其笋期的快速生长这一特殊性状备受关注,但以往研究集中在细胞微观结构、转录组、代谢组、蛋白质组、小RNA以及新基因等方面。DNA甲基化作为重要的表观遗传修饰,主要参与转座子沉默和基因的表达调控,在植物生长发育中发挥重要的调控作用。然而,目前尚不清楚DNA甲基化是否影响竹笋的快速生长。
尿路上皮癌(UC)是泌尿生殖系统常见的恶性肿瘤之一,包含上尿路上皮癌和膀胱癌,均起源于尿路上皮细胞,但上尿路上皮癌恶性程度更高,诊断时约60%的患者已发生肌层浸润,而膀胱癌患者发生肌层浸润的比例仅15-25%。越来越多的证据表明,DNA甲基化与肿瘤的进展紧密相关。肌层浸润和非肌层浸润的膀胱癌具有不同的DNA甲基化模式,且与临床预后相关。而与膀胱癌相比,上尿路上皮癌的甲基化分析及图谱研究仍然欠缺。另...
生物被膜(Biofilm)是微生物生存的主要形式。生物被膜相关研究是微生物学领域的前沿之一,在基础生命科学和医疗、工业、农业、环境治理等应用科学领域均具有至关重要的研究意义。铜绿假单胞菌具有很强的环境适应性,可以在水体、土壤、原油等多种环境中生存。同时铜绿假单胞菌也是一种条件致病菌,易形成生物被膜,是生物被膜研究的模式菌株之一。已有研究发现铜绿假单胞菌存在一类褶皱型小菌落突变株(Rugose sm...
种子既是植物繁殖延续的载体,也是人类粮食的主要来源。种子发育及其储藏物质累积的分子调控机理一直是植物学、农学和种子生物学研究的核心内容之一。近年来,人们已经鉴别了大量控制种子发育的关键基因和调控因子,但关于这些关键因子是如何在种子中被特异被激活的,从而参与种子发育和储藏物质累积,其分子机制尚不十分清楚。DNA甲基化作为一种重要的表观修饰,主要参与转座子沉默和基因的表达调控,在植物生长发育中发挥着重...
近日植物所周明课题组和美国Salk生物研究所Julie Law课题组合作完成的题为The CLASSY family controls tissue-specific DNA methylation patterns in Arabidopsis的研究论文,发表在Nature Communications。一个成熟的个体拥有同一套基因组,却能发育成不同类型的细胞、组织和器官,表观遗传修饰模式被认为...
中国农业大学生物学院生命科学研究进展报告(八)。报告题目:高等植物组蛋白甲基化动态调控的分子机理及功能。报告人:曹晓风 院士 中国科学院遗传与发育生物学研究所研究员。报告时间:2021-11-10(周三)下午14:00-16:00。报告地点:生命科学研究中心大报告厅。
2021年2月22日,东南大学生命科学与技术学院柴人杰教授课题组李异媛副研究员联合浙江大学靳津教授实验室在Journal of Experimental Medicine (JEM)发表题为" Single-nucleotide methylation specifically represses type I interferon in antiviral innate immunity"的研究...

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