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中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）国家基因组科学数据中心（NGDC）最新开发的基因序列数据库GenBase正式上线，为科研用户提供基因序列数据汇交共享和查询下载服务。
辅助性T细胞17（Th17细胞）是CD4+ T细胞的主要亚群之一，对自身炎症免疫应答至关重要。Th17细胞受其谱系特异性转录因子RoRγt调控，表达和分泌炎症相关细胞因子，如IL-17A和IL-17F等，参与结肠炎、系统性红斑狼疮、硬皮病、银屑病和类风湿性关节炎等自身免疫性疾病。近年来，研究报道DNA甲基化和组蛋白修饰等表观遗传因素参与调控Th17细胞分化过程，然而，RNA甲基化修饰是否调控Th1...
在脊椎动物胚胎发育过程中，次级造血(definitive hematopoiesis)过程可以产生造血干祖细胞(hematopoietic stem and progenitor cell, HSPC),而HSPC具有产生所有谱系的血细胞和维持机体终生血液系统的能力。在次级造血时期，哺乳动物主动脉-性腺-中肾区或斑马鱼背主动脉腹侧壁区域中的一部分内皮细胞接受细胞内、外信号，获得造血潜能，成为生血内...
近日，由中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）国家基因组科学数据中心研发的全球生物数据库目录Database Commons正式发布。该研究内容以“Database Commons: A Catalog of Worldwide Biological Databases”为题在国际学术期刊Genomics Proteomics & Bioinformatics 在线发表。
生命在于运动，尽管运动促进健康的观念已被广泛接受，然而机体的各个组织器官是如何在系统水平协同响应运动带来的有益效应目前还不明确。此外，年轻和年老的机体对运动的敏感性有何异同？运动能否延缓衰老？运动能否增强机体抗感染能力？介导运动效应的机制是什么？这一系列问题均有待回答。
近十多年来，单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）不断发展和普及，同时数以千计的生物信息学/计算生物学工具被开发出来，以解决诸如数据获取（包括量化、比对、拼接等）、数据清洗（包括质控、过滤、归一化、整合等）、细胞分配（包括聚类、排序、分类等）、基因识别（包括基因网络、差异表达、标记基因等）等scRNA-seq数据处理和分析步骤。尽管其中大部分软件经过同行评议且在其论文中也彰显了优点，但它们自己...
EB病毒（Epstein-Barr virus, EBV）是最常见的人类疱疹病毒，其感染呈现全球性的分布。90%以上成年人EBV血清抗体阳性，大多数表现为自限性的无症状感染。但部分人群无法有效地控制感染，发展为可能危及生命的EBV相关T/NK细胞淋巴组织增殖性疾病（EBV-T/NK-LPDs）。成人EBV-T/NK-LPDs是一组包括惰性/急性进展、预后区别极大的高度异质性谱系疾病。爆发免疫过度激...
全基因组关联研究（Genome-wide association study, GWAS）是研究人类复杂表型遗传因素的有效方法。科学家们已应用GWAS发现了大量的遗传易感位点，阐明了人类复杂表型的多基因性本征，完善了精准医学的核心理论，构建了数千种疾病的遗传风险评估模型，并为多项临床转化类研究提供了明确的分子靶标。然而，由于无法同时分析多个表型，标准的GWAS流程不能高效检出具有多效性的遗传变异。...
尿路上皮癌（UC）是最常见的泌尿系统肿瘤之一，发生在下尿路（膀胱和尿道）或者上尿路（肾盂和输尿管）。膀胱尿路上皮癌（UCB）的发病率大约占UCs的90-95%，而上尿路尿路上皮癌（UTUC）仅占UCs的5-10%，但其恶性程度显著高于UCB。免疫检查点抑制剂能够影响局部晚期或转移性UC（mUC）的治疗，但是仍有多数患者对检查点抑制剂没有反应，识别可能从免疫治疗中受益的患者仍然是临床上主要的挑战之一...
近日，由中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）国家基因组科学数据中心开发的人类长非编码RNA（long non-coding RNA, lncRNA）数据库LncBook 2.0正式上线。该研究内容以“LncBook 2.0: integrating human long non-coding RNAs with multi-omics annotations”为题在国际学术期刊Nucle...
人体携带的脂肪总量和脂肪在身体各部位的分布情况代表了两个相关但是不同维度的信息，它们从不同角度反映了脂肪组织对人体健康的影响。比如，通常利用体质指数（BMI）来定义肥胖，高BMI指数的个体，有更高的概率患二型糖尿病和冠心病。然而，对于任何给定的总体肥胖水平，个体的脂肪分布差异也有很大的不同。比如，对具有相同BMI的两个个体，当脂肪不成比例的聚集在内脏而不是在臀股部位时，会增加罹患心血管代谢性疾病的...
MethBank是一个综合性的DNA甲基化数据库，自2014年上线以来，一直致力于整合多物种高质量的全基因组单碱基精度DNA甲基化数据，因其高质量的数据资源、直观的可视化展示和友好的操作页面被领域内科研人员广泛使用。
普通小麦是全球种植范围最广的谷物，具有广泛的环境适应性，这被归因于三套适应不同环境基因组的融合。基因序列相对保守，三套亚基因组的基因间区高度分化，那么，亚基因组如何实现调控的协同与分化呢？2022年11月14日，Nature Communications 在线发表了题为“Transposable elements orchestrate subgenome-convergent and -dive...
随着单细胞技术的迅速发展和应用，越来越多的细胞类型和细胞多态性被发现。准确的细胞分类对于描绘细胞类型多样性、追踪细胞谱系、表征肿瘤微环境以及阐明发育和疾病复杂机制至关重要。
