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摘要水稻线粒体基因组嵌合基因orf79 和 orfH79分别被认为与BT-型和HL-型水稻CMS有关, 两者具有98%的同源性, 并且其DNA序列只存在4核苷酸的差异。对于这两个嵌合基因, 前者来源于栽培稻(Oryza. sativa L.), 而后者则来源于普通野生稻(O. rufipogon Griff.)。这意味着orf79/ orfH79可能在广泛分布于稻属AA基因组中。为了调查orf79...
五指山猪IGF2基因5′调控区单核苷酸多态性分析
五指山猪 IGF2基因 SNP PCR-RFLP
2008/1/23
利用PCR产物直接测序法, 对五指山猪、滇南小耳猪、香猪、梅山猪和大白猪共60个样本的IGF2基因5＇调控区部分片段的单核苷酸多态性进行了研究。找到13个SNP, 分别是: C5872T、C5888T、A5976G、C6010T、T6029A、C6037T、C6043T、C6063T、C6112T、C6164T、G13520A、G13563A和G13669A。T6029A为T←→A碱基颠换, A5...
八肋游仆虫一种富含三核苷酸重复序列的新基因GARP的克隆与序列分析
八肋游仆虫 GARP基因 三核苷酸重复
2008/1/23
人类基因中三核苷酸重复序列拷贝数的异常扩增, 可导致多种神经系统疾病。一种富含GAA三核苷酸的GARP (glutamic acid-rich protein)基因从八肋游仆虫(Euplotes octocarinatus)大核文库中筛选获得。大核中该基因的染色体全长460 bp, 基因两端具有下毛类纤毛虫大核特有的端粒序列(C4A4C4A4C4A4C4), 开放读框内含有一个TGA(88-99)...
载脂蛋白基因家族的密码子空间分析:核苷酸替换的非随机进化选择
分子进化 载脂蛋白 密码子空间 核苷酸非随机分布
2008/1/22
DNA分子进化中,对核苷酸替换的选择可呈选择中性或选择倾向性。为研究载脂蛋白基因进化过程中对核苷酸变化的选择方式,本文建立了基因的密码子空间分析方法。密码子空间是由密码子3个位置上核苷酸出现机率所组成的矩阵。对该空间中核苷酸分布的非随机性度量可以反映进化过程中核苷酸替换的选择方式。应用该法,我们发现载脂蛋白基因密码子空间第一及第三位的核苷酸分布呈高度非随机性。进一步研究表明:这种核苷酸的非随机分布...
摘要根据 23个等位基因不同外显子(EN)的核苷酸(NT)替换及同义密码子使用谱(SCU)偏移研究了哺乳类7种动物MHC DQA座位的系谱发育关系。发现:( 1)在大时间尺度内,MHC DQA基因进化速率(1.0×10 E-9,其中EN2为1.3×10 E-9N T/位点/年)与一般核基因相似; 鼠类DQA基因的NT替换速率大致是其他哺乳类的2倍; (2)证实DQA等位基因多态性是在哺乳动物分化以...
猪Kappa阿片受体基因外显子部分序列单核苷酸多态性分析
Kappa阿片受体基因 单核苷酸多态性 行为规癖
2008/1/20
摘要 行为规癖是母猪一种常见的异常行为，表现为重复、不变化的行为模式，并且不带有明显的目的性。Kappa阿片受体（Kappa opioid receptor，简称KOR）属于G蛋白偶联受体，在内分泌、情绪、运动等方面起到重要作用。应用PCR-SSCP的方法对大白猪、长白猪和杜洛克猪的Kappa阿片受体基因进行单核苷酸多态性检测和分析，研究Kappa阿片受体基因作为候选基因，影响母猪行为规癖性状的...
摘要 结核病仍然是人类健康的主要威胁，结核分枝杆菌诱导的巨噬细胞凋亡是宿主防御反应之一，研究凋亡相关基因的差异表达有助于认识结核分枝杆菌致病机理和发现新的药物靶标。利用包括19 200个基因或基因片段的DNA芯片研究巨噬细胞株U937对临床和实验室菌株感染的差异表达，Northern blotting 和RT-PCR验证了芯片研究结果。Mtb H37Rv感染下调bcl-2,vitaminD受体、干...
摘要以昆山麻鸭、樱桃谷鸭、高邮鸭、荆江麻鸭、金定鸭, 山麻鸭、龙白鸭和白羽番鸭8个鸭品种为实验材料, 根据鸭脂联素基因开放阅读框序列设计5对引物, 用PCR-SSCP方法进行单核苷酸多态性分析,并对不同品种群体进行群体遗传学分析。结果发现引物4扩增片段上共存有7个单碱基突变, 第430、457、523处的G-A 、A-G、T-C单碱基突变导致第144、153、175个氨基酸分别由丙氨酸（A）变为苏...
检测绵羊BMPR-IB基因多态性寡核苷酸芯片的制备
寡核苷酸芯片 BMPR-IB 基因 基因多态性 中国美利奴羊
2008/1/12
摘要FecB基因是控制中国美利奴羊排卵率和产羔数的主效基因，由于A746G的点突变而导致绵羊表型的变化。本研究的目的在于根据FecB基因的多态性，制备寡核苷酸芯片检测绵羊FecB基因的单核苷酸多态性（SNP），设计六条特异性的探针，用基因芯片点样仪将探针点样到醛基修饰的载玻片上，采集绵羊的血液样本，在芯片反应舱中，检测FecB基因A746G点突变，设计对应的软件进行判读，分析检测结果，与PCR-R...
IL-1b基因单核苷酸多态性与腰椎间盘疾病的相关性
白细胞介素-1β 单核苷酸多态性 椎间盘退变 椎间盘疾病
2008/1/12
摘要为研究汉族人白细胞介素-1b（IL-1b）基因 -511T>C 和 +3954C>T位点单核苷酸多态性与腰椎间盘疾病的关系, 采用聚合酶链反应技术, 扩增 81 例腰椎间盘疾病患者和 101 例正常对照者中分别包含IL-1b 基因 -511T>C 和 +3954C>T 位点的片段, 酶切法鉴定 IL-1b基因 -511T>C和 +3954C>T 位点单核苷酸多态性情况, 比较两组中基因多态性与...
猪Mu阿片受体基因单核苷酸多态性分析Single Nucleotide Polymorphism Analysis in Sow Mu Opioid Receptor Gene
猪 Mu阿片受体基因 单核苷酸多态性
2008/1/10
摘要 Mu阿片受体（简称MOR）属于G蛋白藕联受体，分布在痛觉传导区，以及与情绪和行为有关的区域，影响动物的神经反应和行为表现。该研究以长白猪、大白猪和杜洛克猪为试验材料， 用8对引物对Mu阿片受体基因的5′ UTR区域、整个编码区和3′ UTR区域用PCR-SSCP方法进行了扫描，发现5处突变基因座（GenBank登录号：AF521309）。统计结果发现基因型频率分布与品种有关，大白猪突变基因型...
摘要
单核苷酸多态性(SNP)作为第三代遗传标记已经广泛用于基因作图、疾病相关性分析、群体遗传学及药物研究等领域。 文中系统地介绍了目前国内外主要的SNP检测技术，任何一种SNP的检测方法都可将之看成由两部分组成，即区分SNP位点的原理方法和数据的检测分析手段，文章对这两部分做了较详细的介绍，并对SNP检测技术的发展进行了展望。
Abstract :As the third generatio...
中国广东汉族人群核苷酸修复基因hMTH1遗传多态性研究Genetic Polymorphisms of Nucleotide Repair Gene hMTH1 in Southern Chinese Han Population
hMTH1基因 遗传多态性 聚合酶链反应 单链构象多态性
2008/1/6
摘要
为研究中国南方汉族人群核苷酸修复基因hMTH1遗传多态性，应用聚合酶链反应-单链构象多态性技术检测172名健康人外周血白细胞hMTH1基因启动子及全部5个外显子多态性，并进行DNA测序。结果发现hMTH1基因启动子及外显子1序列保守，未见突变；外显子2第73位碱基存在T→C杂合型突变，基因型TT和TC频率分别为93.02%、6.98%，等位基因T和C频率分别为96.51%、3.49％；外显...
摘要利用测序及变性高效液相色谱(DHPLC)研究了蒙古羊、哈萨克羊、滩羊和藏绵羊黑素细胞刺激素受体（MSHR）基因单核苷酸多态性（SNP）。结果表明，在扩增片断长度为415bp范围内存在一个T317C突变，DHPLC可检测到该突变并被证明是一种高通量且简便的筛选方法。通过两次DHPLC可确定两个杂合子和一个纯合子，第一次DHPLC可迅速检测出由于形成异源双链而呈肩峰的杂合子（TC），但不能区分两个...