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基因调控网络(Gene Regulatory Network, GRN)以网络形式展示了生物系统中基因之间的调控机制,为理解分子间相互作用和生物过程提供了重要线索,并与生物体发育、环境适应,疾病表型等密切相关。转录因子和目标基因之间的调控关系是一种天然的因果关系。面向转录组数据推断基因调控网络一直以来都是大家关心的科学问题,与基于广义相关性的方法相比,基于因果关系的方法推断基因之间的调控关系似乎更...
白粉病是葫芦科作物的三大主要病害之一。设施栽培中的高温高湿环境很容易诱导白粉病的爆发,严重影响黄瓜产量和品质。目前,黄瓜白粉病的防治主要依赖化学药剂,然而在一个生长季内需多次施药,对以鲜食为主的黄瓜而言,因农药残留导致的食品安全隐患不容小觑。黄瓜白粉病抗性是由多基因位点控制的数量性状,传统育种技术很难高效整合多个抗病基因而不引入连锁累赘。利用CRISPR/Cas多基因编辑技术同时敲除多个隐性抗病基...
青藏高原是中国最大、世界海拔最高的高原,素有“世界屋脊”、“第三极”之称。青藏高原独特的地形特征使其成为众多河流的主要源头,并作为“水塔”滋养着周边地区近20亿人。青藏高原的水生态系统类型多样,包括湿地、湖泊、河流、温泉和冰川等,孕育着丰富多样的水生微生物。这些微生物可能在青藏高原极端的环境条件下,如剧烈的温度波动、低氧浓度、低压和强烈的紫外线辐射,展现出独特的种类组成和代谢模式,使得青藏高原可能...
近日,中国科学院水生生物研究所缪炜研究员与华中科技大学宁康教授团队合作解析了青藏高原水生微生物基因组和基因目录。研究搜集了来自青藏高原湿地、淡水湖、盐水湖、河流、温泉和冰川的498个水体环境DNA样本并进行了宏基因组测序,初步建立了一个青藏高原水生微生物基因组和基因目录(Tibetan Plateau Microbial Catalog, TPMC)。TPMC目前包含了3万多个中高质量的原核微生物...
性二态(亦称“第二性征”)是雌雄异体的生物个体在繁殖器官以外的形态、生理和生活史等方面所呈现的差异化特征。性二态通常源于性别偏向基因的差异表达。相关工作始于模式动物果蝇的性别偏向基因鉴定和演化特征分析。研究发现,在正选择和放松的纯化选择作用下,雄性偏向基因显示出较快的蛋白质序列演化速率。由于多数高等植物均为雌雄同株,即使在雌雄异株的植物中第二性征的发育通常不明显,鲜有关于植物性别偏向基因的报道。
西安交大一附院肝胆外科吕毅教授和张谞丰教授团队首次揭示Y染色体及其编码基因是导致男性相较于女性肝纤维化发病率更高、进展更快的关键遗传因素,相关成果近日发表在《肝脏病学杂志》上。
近期,华中科技大学宁康教授团队与中科院水生所缪炜教授团队搜集了来自青藏高原盐水湖、淡水湖、河流、温泉、湿地以及冰川的498个水体样本并进行了宏基因组测序,建立了一个全面的青藏高原水生微生物组的基因组和基因目录(Tibetan Plateau Microbial Catalog,TPMC)。TPMC中包含着32 355个中高质量的宏基因组组装的基因组(Metagenome-assembled gen...
2024年2月18日,中国农业科学院蔬菜花卉研究所蔬菜分子设计育种创新团队程锋研究员联合马铃薯遗传育种与栽培创新团队李广存研究员,基于深入解析异交(异花授粉)物种或长世代物种的F1分离群体的遗传特点,开发了一套专用的BSA 新算法工具OcBSA,以高效促进其基因挖掘,从而推进该类物种的分子育种。研究成果以“OcBSA: an NGS-based Bulk Segregant Analysis To...
Moderna 曾表示,双方的合作不是为了仅仅敲除一个基因、修改一个碱基,或是修复一个基因突变,而是要创造新的基因编辑工具,让科学家能有更好的工具可用,让医生能更好地治疗遗传疾病。
为了进一步促进国内和国际学者在三维基因组领域的交流与合作、展示三维基因组领域的最新研究成果,我们拟于2024年11月1日至3日在美丽的海南省三亚市举办"第十一届国际三维基因组学研讨会"。本次研讨会将邀请国内外著名专家,就三维基因组学的最新进展做大会专题报告,共同探讨三维基因组学研究中采取的技术、未来研究内容和发展方向。本次大会的主题是"3D genome for better life,三维基因组...
2024年2月6日,中国科学院海洋研究所在深海冷泉贝类尾腔纲生物基因组学研究方面取得新进展,发表首个尾腔纲贝类高质量染色体水平参考基因组,相关研究成果在国际数据集期刊Scientific Data(Q1,IF5year=10.8)发表。成果发表后迅速引起了国内外广泛关注。Nature 旗下生命科学研究论坛Nature Research Life Sciences Community&#...
2024年1月29日,国际学术期刊Journal of Experimental Medicine在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所)季红斌研究组、陈洛南研究组、朱学良研究组与同济大学附属肺科医院任胜祥团队、暨南大学陈良研究组的合作研究成果:“EML4-ALK fusions drive lung adeno-to-squamous transition th...
近日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所动物功能基因组学创新团队研发出增强子鉴定新技术,该技术与传统技术相比,平均分辨率提高了约10倍,为基因组的精确注释提供了新的方法。相关研究成果发表在《核酸研究(Nucleic Acids Research)》上。
2024年1月16日,中国科学院分子细胞科学卓越创新中心研究员周小龙、王恩多团队在《核酸研究》(Nucleic Acids Research)上,发表了题为Multifaceted roles of t6A biogenesis in efficiency and fidelity of mitochondrial gene expression的研究成果。该工作揭示了人线粒体转移核糖核酸(tRN...
针对我国畜牧业绿色发展和新污染物治理的国家战略需求,围绕生猪养殖粪污资源化利用与多污染物协同减排,中国科学院生态环境研究中心魏源送研究组开展了系列研究,并在猪粪厌氧消化过程中基于铁系化合物和病毒群落介导耐药基因削减方面取得新进展。相关成果相继发表在Environmental Science & Technology (doi.org/10.1021/acs.est.3c07664), Waste ...

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